Protein ID | Pro_DTO377G3_2|g3161.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_04:858517..861395 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2878 |
Transcript length (bp) | 2706 |
Coding sequence length (bp) | 2706 |
Protein length (aa) | 902 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00106 | adh_short | short chain dehydrogenase | 8.3E-37 | 9 | 195 |
PF00106 | adh_short | short chain dehydrogenase | 1.6E-44 | 315 | 496 |
PF13561 | adh_short_C2 | Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase | 2.3E-29 | 15 | 200 |
PF13561 | adh_short_C2 | Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase | 6.9E-35 | 323 | 520 |
PF01575 | MaoC_dehydratas | MaoC like domain | 8.9E-34 | 776 | 887 |
PF08659 | KR | KR domain | 9.0E-12 | 10 | 183 |
PF08659 | KR | KR domain | 1.3E-12 | 316 | 461 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 26 | 0.45 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Pro_DTO377G3_2|g3161.t1 MSELRFDNQTVVVTGAGGGLGKAYALFFASRGANVVVNDLGVSHKGEGKSGKAADVVVEEIRAAGGKAVANYDSV ENGDAIIETAIKAFGRIDILLNNAGILRDISFKNMKDADWDLINRVHTYGAYKCARAAWPHFRKQKFGRIINTAS AAGLFGSFGQANYSAAKLGQVGFTETLAKEGAKYNIIANVIAPIAASRMTATVMPPDVLENLKPDWVVPLVAALV HSSNTTETGGIYEVGGGHVAKLRWERAKGALLKTDDSLTPGAIARKWNDVNDFSQPEYPTGPADFMAFLEDGLKT PSAQLGEEPDFKGRVALVTGGGAGLGRAYCLQFAKLGASVVVNDLVDPEPVVEEIKKLGGKAVGNKANCEDGDAV VKSAIDAFGRIDIVVNNAGILRDKAFTNMDDNLWNAVINVHLRGTYKVTKAAWPYFLKQKYGRVVNTASTSGIYG NFGQANYAAAKLGILGLSRTLALEGAKYNIKVNTIAPNAGTNMTRTIMPEEMVQAFKPDYVAPLVVLLCSDMAPE PSTKGLYECGSGWFGRTRWQRSGGHGFPVDVKLTPEEVVRNWKQITNFDDGRADHPEDGQAGAEKIMANMSNRVH GDASSENDILKNIEKAKALSSEGTPFNYEDRDVILYNLSLGAKRTDLPLVYENDDHFQALPSYGVVPWFNTTTPW NIDDLVKDFSPMMLLHGEQYMEVRKFPIPTAANTLTYPKLIDVIDKGNAAIVVAGYTTKDAKTGEDLFYNESSVF IRGSGGFGGSPKPTAVRAKAATAAYKAPQRQPDAVVEQKTSEDQAALYRLNGDRNPLHIDPEFSKVGGFKTPILH GLCSLGVSAKAVFSKFGPYKNLKVRFAGVVLPGQTLKTEMWKEGNTVLFQATVVETGKPAITGAGAELLEGAKAK L* |
Coding | >Pro_DTO377G3_2|g3161.t1 ATGTCCGAGTTGCGATTTGATAACCAAACGGTGGTCGTCACCGGTGCCGGTGGTGGTCTGGGGAAAGCATATGCT CTTTTCTTCGCCTCAAGGGGTGCAAATGTCGTCGTGAACGACCTCGGTGTCTCTCACAAGGGTGAGGGCAAGTCG GGAAAAGCCGCAGATGTCGTCGTCGAGGAGATCCGCGCCGCTGGCGGTAAGGCCGTCGCCAACTACGATAGCGTC GAGAACGGTGATGCTATCATCGAGACCGCTATTAAGGCCTTCGGCCGCATTGATATCCTGCTCAATAACGCTGGT ATCCTGCGGGATATTAGCTTTAAGAACATGAAGGATGCCGACTGGGATTTAATCAACAGAGTCCACACCTACGGT GCATACAAGTGCGCAAGAGCCGCGTGGCCTCACTTCCGCAAACAAAAGTTCGGCCGTATTATCAACACTGCCTCG GCTGCTGGTCTATTCGGCAGCTTCGGCCAGGCCAACTACTCAGCTGCCAAGCTCGGCCAGGTCGGTTTTACCGAG ACTCTGGCCAAGGAGGGTGCCAAGTACAACATTATTGCGAACGTTATTGCTCCCATTGCTGCCAGCCGCATGACT GCAACTGTCATGCCACCGGATGTTCTAGAGAATCTTAAACCCGACTGGGTGGTTCCTTTGGTCGCTGCTCTCGTG CACTCATCTAACACCACTGAGACCGGTGGTATTTATGAGGTCGGTGGTGGTCACGTTGCCAAGCTCCGCTGGGAG CGAGCTAAGGGTGCTCTCCTGAAGACTGATGACTCCCTGACCCCTGGTGCTATCGCCCGGAAGTGGAACGATGTC AACGATTTCTCTCAGCCCGAGTATCCCACTGGCCCTGCAGACTTCATGGCCTTCTTGGAAGATGGCCTGAAGACG CCTAGCGCTCAGCTAGGAGAGGAGCCTGACTTCAAGGGTCGTGTTGCCCTGGTCACTGGAGGTGGTGCTGGTCTC GGCCGTGCATACTGTTTGCAGTTCGCTAAGCTCGGTGCCTCTGTGGTGGTCAACGATCTTGTTGACCCAGAGCCC GTTGTCGAGGAAATCAAGAAGCTCGGTGGCAAGGCTGTTGGAAACAAGGCCAACTGCGAGGACGGTGATGCCGTC GTTAAGAGCGCCATTGATGCCTTCGGCCGCATTGATATCGTGGTGAACAACGCCGGCATCCTGCGCGACAAGGCT TTCACCAACATGGATGATAACCTGTGGAATGCCGTTATTAATGTCCACCTCCGTGGTACCTACAAGGTGACCAAG GCTGCCTGGCCCTACTTCCTCAAGCAGAAGTACGGCCGTGTTGTCAACACTGCCAGTACCAGCGGTATCTATGGC AACTTCGGCCAGGCCAACTACGCTGCTGCTAAGCTTGGTATCCTGGGTCTTTCCCGCACTCTAGCTTTGGAGGGT GCGAAGTACAACATTAAGGTGAACACCATTGCTCCTAATGCGGGTACCAATATGACCCGTACCATTATGCCCGAG GAGATGGTCCAGGCTTTCAAGCCCGACTATGTTGCTCCCCTTGTGGTTTTGCTGTGCTCTGACATGGCTCCTGAG CCCTCCACCAAGGGTCTCTATGAGTGTGGTAGCGGTTGGTTTGGCCGTACCCGCTGGCAGCGCTCTGGTGGCCAC GGCTTCCCCGTGGACGTCAAGTTGACCCCCGAAGAGGTAGTTCGCAACTGGAAGCAGATCACCAACTTTGATGAC GGTCGCGCTGATCACCCCGAGGATGGCCAGGCCGGCGCGGAGAAGATCATGGCTAACATGTCTAATCGCGTGCAC GGCGATGCCTCCAGCGAGAACGATATCCTCAAGAACATTGAGAAGGCCAAGGCCCTTTCGAGCGAGGGAACTCCC TTCAACTACGAGGACCGCGATGTGATTTTGTACAACCTCAGCTTGGGCGCCAAGCGCACAGACTTGCCTCTGGTC TACGAGAACGACGACCACTTCCAGGCCCTTCCCTCGTATGGTGTTGTCCCCTGGTTCAACACCACTACTCCCTGG AACATTGACGACTTGGTGAAGGATTTCTCCCCCATGATGCTGCTCCACGGCGAGCAGTACATGGAGGTTCGCAAG TTCCCCATTCCCACCGCCGCCAATACCCTGACCTATCCCAAGCTCATTGACGTCATCGACAAAGGCAACGCGGCC ATCGTCGTGGCCGGGTACACAACGAAGGATGCCAAGACCGGTGAGGATCTGTTCTACAACGAGTCCAGCGTCTTC ATCCGCGGCAGCGGCGGCTTCGGAGGCTCTCCCAAGCCGACTGCCGTGCGTGCCAAGGCTGCCACTGCTGCGTAC AAGGCGCCGCAGCGCCAGCCTGATGCCGTGGTTGAGCAGAAGACCTCTGAGGACCAGGCAGCGCTTTACCGCCTG AACGGTGACCGCAATCCGCTCCACATCGACCCCGAGTTCAGCAAGGTTGGCGGCTTCAAGACCCCTATCCTGCAC GGTCTGTGCTCGCTCGGTGTTTCGGCCAAGGCTGTCTTCTCCAAGTTCGGTCCCTACAAGAACCTCAAGGTTCGC TTCGCGGGTGTCGTCCTGCCTGGCCAGACCCTGAAGACTGAGATGTGGAAGGAGGGTAACACCGTCTTATTCCAG GCCACCGTTGTTGAGACTGGTAAGCCTGCCATTACCGGCGCCGGTGCGGAGCTCCTGGAGGGCGCTAAGGCCAAG CTGTAA |
Transcript | >Pro_DTO377G3_2|g3161.t1 ATGTCCGAGTTGCGATTTGATAACCAAACGGTGGTCGTCACCGGTGCCGGTGGTGGTCTGGGGAAAGCATATGCT CTTTTCTTCGCCTCAAGGGGTGCAAATGTCGTCGTGAACGACCTCGGTGTCTCTCACAAGGGTGAGGGCAAGTCG GGAAAAGCCGCAGATGTCGTCGTCGAGGAGATCCGCGCCGCTGGCGGTAAGGCCGTCGCCAACTACGATAGCGTC GAGAACGGTGATGCTATCATCGAGACCGCTATTAAGGCCTTCGGCCGCATTGATATCCTGCTCAATAACGCTGGT ATCCTGCGGGATATTAGCTTTAAGAACATGAAGGATGCCGACTGGGATTTAATCAACAGAGTCCACACCTACGGT GCATACAAGTGCGCAAGAGCCGCGTGGCCTCACTTCCGCAAACAAAAGTTCGGCCGTATTATCAACACTGCCTCG GCTGCTGGTCTATTCGGCAGCTTCGGCCAGGCCAACTACTCAGCTGCCAAGCTCGGCCAGGTCGGTTTTACCGAG ACTCTGGCCAAGGAGGGTGCCAAGTACAACATTATTGCGAACGTTATTGCTCCCATTGCTGCCAGCCGCATGACT GCAACTGTCATGCCACCGGATGTTCTAGAGAATCTTAAACCCGACTGGGTGGTTCCTTTGGTCGCTGCTCTCGTG CACTCATCTAACACCACTGAGACCGGTGGTATTTATGAGGTCGGTGGTGGTCACGTTGCCAAGCTCCGCTGGGAG CGAGCTAAGGGTGCTCTCCTGAAGACTGATGACTCCCTGACCCCTGGTGCTATCGCCCGGAAGTGGAACGATGTC AACGATTTCTCTCAGCCCGAGTATCCCACTGGCCCTGCAGACTTCATGGCCTTCTTGGAAGATGGCCTGAAGACG CCTAGCGCTCAGCTAGGAGAGGAGCCTGACTTCAAGGGTCGTGTTGCCCTGGTCACTGGAGGTGGTGCTGGTCTC GGCCGTGCATACTGTTTGCAGTTCGCTAAGCTCGGTGCCTCTGTGGTGGTCAACGATCTTGTTGACCCAGAGCCC GTTGTCGAGGAAATCAAGAAGCTCGGTGGCAAGGCTGTTGGAAACAAGGCCAACTGCGAGGACGGTGATGCCGTC GTTAAGAGCGCCATTGATGCCTTCGGCCGCATTGATATCGTGGTGAACAACGCCGGCATCCTGCGCGACAAGGCT TTCACCAACATGGATGATAACCTGTGGAATGCCGTTATTAATGTCCACCTCCGTGGTACCTACAAGGTGACCAAG GCTGCCTGGCCCTACTTCCTCAAGCAGAAGTACGGCCGTGTTGTCAACACTGCCAGTACCAGCGGTATCTATGGC AACTTCGGCCAGGCCAACTACGCTGCTGCTAAGCTTGGTATCCTGGGTCTTTCCCGCACTCTAGCTTTGGAGGGT GCGAAGTACAACATTAAGGTGAACACCATTGCTCCTAATGCGGGTACCAATATGACCCGTACCATTATGCCCGAG GAGATGGTCCAGGCTTTCAAGCCCGACTATGTTGCTCCCCTTGTGGTTTTGCTGTGCTCTGACATGGCTCCTGAG CCCTCCACCAAGGGTCTCTATGAGTGTGGTAGCGGTTGGTTTGGCCGTACCCGCTGGCAGCGCTCTGGTGGCCAC GGCTTCCCCGTGGACGTCAAGTTGACCCCCGAAGAGGTAGTTCGCAACTGGAAGCAGATCACCAACTTTGATGAC GGTCGCGCTGATCACCCCGAGGATGGCCAGGCCGGCGCGGAGAAGATCATGGCTAACATGTCTAATCGCGTGCAC GGCGATGCCTCCAGCGAGAACGATATCCTCAAGAACATTGAGAAGGCCAAGGCCCTTTCGAGCGAGGGAACTCCC TTCAACTACGAGGACCGCGATGTGATTTTGTACAACCTCAGCTTGGGCGCCAAGCGCACAGACTTGCCTCTGGTC TACGAGAACGACGACCACTTCCAGGCCCTTCCCTCGTATGGTGTTGTCCCCTGGTTCAACACCACTACTCCCTGG AACATTGACGACTTGGTGAAGGATTTCTCCCCCATGATGCTGCTCCACGGCGAGCAGTACATGGAGGTTCGCAAG TTCCCCATTCCCACCGCCGCCAATACCCTGACCTATCCCAAGCTCATTGACGTCATCGACAAAGGCAACGCGGCC ATCGTCGTGGCCGGGTACACAACGAAGGATGCCAAGACCGGTGAGGATCTGTTCTACAACGAGTCCAGCGTCTTC ATCCGCGGCAGCGGCGGCTTCGGAGGCTCTCCCAAGCCGACTGCCGTGCGTGCCAAGGCTGCCACTGCTGCGTAC AAGGCGCCGCAGCGCCAGCCTGATGCCGTGGTTGAGCAGAAGACCTCTGAGGACCAGGCAGCGCTTTACCGCCTG AACGGTGACCGCAATCCGCTCCACATCGACCCCGAGTTCAGCAAGGTTGGCGGCTTCAAGACCCCTATCCTGCAC GGTCTGTGCTCGCTCGGTGTTTCGGCCAAGGCTGTCTTCTCCAAGTTCGGTCCCTACAAGAACCTCAAGGTTCGC TTCGCGGGTGTCGTCCTGCCTGGCCAGACCCTGAAGACTGAGATGTGGAAGGAGGGTAACACCGTCTTATTCCAG GCCACCGTTGTTGAGACTGGTAAGCCTGCCATTACCGGCGCCGGTGCGGAGCTCCTGGAGGGCGCTAAGGCCAAG CTGTAA |
Gene | >Pro_DTO377G3_2|g3161.t1 ATGTCCGAGTTGCGATTTGATAACCAAACGGTGGTCGTCACCGGTGCCGGTGGTGGTCTGGGGAAAGCATATGCT CTTTTCTTCGCCTCAAGGGGTGCAAATGTCGTCGTGAACGACCTCGGTGTCTCTCACAAGGGTGAGGGCAAGTCG GGAAAAGTATGCCTTATACCTCCGAACTAGACAAACAGATACTGACAGCTACTCCAGGCCGCAGATGTCGTCGTC GAGGAGATCCGCGCCGCTGGCGGTAAGGCCGTCGCCAACTACGATAGCGTCGAGAACGGTGATGCTATCATCGAG ACCGCTATTAAGGCCTTCGGCCGCATTGATATCCTGCTCAATAACGCTGGTATCCTGCGGGATATTAGCTTTAAG AACATGAAGGATGCCGACTGGGATTTAATCAACAGAGTCCACACCTACGGTGCATACAAGGTGAGCACCCTCGGA GACATAAAAACAAGCGCTTGAAACAGGAACTGATAGCCTTTTCTCTGGACAGTGCGCAAGAGCCGCGTGGCCTCA CTTCCGCAAACAAAAGTTCGGCCGTATTATCAACACTGCCTCGGCTGCTGGTCTATTCGGCAGCTTCGGCCAGGC CAACTACTCAGCTGCCAAGCTCGGCCAGGTCGGTTTTACCGAGACTCTGGCCAAGGAGGGTGCCAAGTACAACAT TATTGCGAACGTTATTGCTCCCATTGGTAAGCAAGCTAAAAACCCCAACGCATGAATTGGAAAAGCTAATCCTAA ATTAGCTGCCAGCCGCATGACTGCAACTGTCATGCCACCGGATGTTCTAGAGAATCTTAAACCCGACTGGGTGGT TCCTTTGGTCGCTGCTCTCGTGCACTCATCTAACACCACTGAGACCGGTGGTATTTATGAGGTCGGTGGTGGTCA CGTTGCCAAGCTCCGCTGGGAGCGAGCTAAGGGTGCTCTCCTGAAGACTGATGACTCCCTGACCCCTGGTGCTAT CGCCCGGAAGTGGAACGATGTCAACGATTTCTCTCAGCCCGAGTATCCCACTGGCCCTGCAGACTTCATGGCCTT CTTGGAAGATGGCCTGAAGACGCCTAGCGCTCAGCTAGGAGAGGAGCCTGACTTCAAGGGTCGTGTTGCCCTGGT CACTGGAGGTGGTGCTGGTCTCGGCCGTGCATACTGTTTGCAGTTCGCTAAGCTCGGTGCCTCTGTGGTGGTCAA CGATCTTGTTGACCCAGAGCCCGTTGTCGAGGAAATCAAGAAGCTCGGTGGCAAGGCTGTTGGAAACAAGGCCAA CTGCGAGGACGGTGATGCCGTCGTTAAGAGCGCCATTGATGCCTTCGGCCGCATTGATATCGTGGTGAACAACGC CGGCATCCTGCGCGACAAGGCTTTCACCAACATGGATGATAACCTGTGGAATGCCGTTATTAATGTCCACCTCCG TGGTACCTACAAGGTGACCAAGGCTGCCTGGCCCTACTTCCTCAAGCAGAAGTACGGCCGTGTTGTCAACACTGC CAGTACCAGCGGTATCTATGGCAACTTCGGCCAGGCCAACTACGCTGCTGCTAAGCTTGGTATCCTGGGTCTTTC CCGCACTCTAGCTTTGGAGGGTGCGAAGTACAACATTAAGGTGAACACCATTGCTCCTAATGCGGGTACCAATAT GACCCGTACCATTATGCCCGAGGAGATGGTCCAGGCTTTCAAGCCCGACTATGTTGCTCCCCTTGTGGTTTTGCT GTGCTCTGACATGGCTCCTGAGCCCTCCACCAAGGGTCTCTATGAGTGTGGTAGCGGTTGGTTTGGCCGTACCCG CTGGCAGCGCTCTGGTGGCCACGGCTTCCCCGTGGACGTCAAGTTGACCCCCGAAGAGGTAGTTCGCAACTGGAA GCAGATCACCAACTTTGATGACGGTCGCGCTGATCACCCCGAGGATGGCCAGGCCGGCGCGGAGAAGATCATGGC TAACATGTCTAATCGCGTGCACGGCGATGCCTCCAGCGAGAACGATATCCTCAAGAACATTGAGAAGGCCAAGGC CCTTTCGAGCGAGGGAACTCCCTTCAACTACGAGGACCGCGATGTGATTTTGTACAACCTCAGCTTGGGCGCCAA GCGCACAGACTTGCCTCTGGTCTACGAGAACGACGACCACTTCCAGGCCCTTCCCTCGTATGGTGTTGTCCCCTG GTTCAACACCACTACTCCCTGGAACATTGACGACTTGGTGAAGGATTTCTCCCCCATGATGCTGCTCCACGGCGA GCAGTACATGGAGGTTCGCAAGTTCCCCATTCCCACCGCCGCCAATACCCTGACCTATCCCAAGCTCATTGACGT CATCGACAAAGGCAACGCGGCCATCGTCGTGGCCGGGTACACAACGAAGGATGCCAAGACCGGTGAGGATCTGTT CTACAACGAGTCCAGCGTCTTCATCCGCGGCAGCGGCGGCTTCGGAGGCTCTCCCAAGCCGACTGCCGTGCGTGC CAAGGCTGCCACTGCTGCGTACAAGGCGCCGCAGCGCCAGCCTGATGCCGTGGTTGAGCAGAAGACCTCTGAGGA CCAGGCAGCGCTTTACCGCCTGAACGGTGACCGCAATCCGCTCCACATCGACCCCGAGTTCAGCAAGGTTGGCGG CTTCAAGACCCCTATCCTGCACGGTCTGTGCTCGCTCGGTGTTTCGGCCAAGGCTGTCTTCTCCAAGTTCGGTCC CTACAAGAACCTCAAGGTTCGCTTCGCGGGTGTCGTCCTGCCTGGCCAGACCCTGAAGACTGAGATGTGGAAGGA GGGTAACACCGTCTTATTCCAGGCCACCGTTGTTGAGACTGGTAAGCCTGCCATTACCGGCGCCGGTGCGGAGCT CCTGGAGGGCGCTAAGGCCAAGCTGTAA |