Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein IDPro_DTO377G3_2|g1398.t1
Gene name
Locationscaffold_01:3682121..3684348
Strand-
Gene length (bp)2227
Transcript length (bp)1944
Coding sequence length (bp)1944
Protein length (aa) 648

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PFAM Domains

PFAM Domain ID Short name Long name E-value Start End
PF00890 FAD_binding_2 FAD binding domain 2.5E-124 62 457
PF02910 Succ_DH_flav_C Fumarate reductase flavoprotein C-term 1.1E-44 512 647

GO

GO Term Description Terminal node
GO:0016491 oxidoreductase activity Yes
GO:0055114 oxidation-reduction process Yes
GO:0008150 biological_process No
GO:0008152 metabolic process No
GO:0003824 catalytic activity No
GO:0003674 molecular_function No

SignalP

[Help with interpreting these statistics]
SignalP signal predicted Location
(based on Ymax)
D score
(significance: > 0.45)
No 1 - 12 0.45

Transmembrane Domains

(None)

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

Analysis 1: Genome-wide gene expression in conidia of Penicillium roqueforti during growth at various temperatures and for various amounts of time. Published in Punt et al., 2020.

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Sequences

Type of sequenceSequence
Locus Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein >Pro_DTO377G3_2|g1398.t1
MSSMSMRSLAPASKVSRILRNQRRLFSSSKPAARIWSNQPLRAKESSGYLSDKYPIIDHEYDALVVGAGGAGLRA
AFGLAEAGFKTACVSKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMHPDDWRWHMYDTVKGSDWLGDQDAIHYMTREAPASVR
ELEGYGCPFSRTEDGLIYQRAFGGQSKDYGKGGQAYRCAAAADRTGHALLHTLYGQSLRHHTNYFIEFFALDLLM
EDGVCRGVIAYNQEDGTLHRFKAHHTVLATGGYGRAFFSCTSAHTCTGDGMAMVSRAGLPNQDLEFVQFHPTGIY
GAGCLITEGSRGEGGYLINSEGERFMERYAPTAKDLASRDVVSRSMTLEIREGRGVGPEKDHLYLQLSHLPAELL
HERLPGISETASIFAGVDVTKQPIPVLPTVHYNMGGIPTNHTGEVLNVDENGQEKPVPGLYACGEAACVSVHGAN
RLGANSLLDLVVFGRAVSHRVRDISSPGQPHKPLAADAGAQSVKDLDHARNADGPKSTFEVRNAMQKVMQTDVSV
FRTQSSLDEGVEKINKVDQLYEQVGTKDRSMIWNSDLVETLELRNLLTCATQTAASAAARKESRGAHAREDYPER
DDEHWMKHTLSWQKVPHGEIKLGYRPVQSHTLDESECKSVPPFKRVY*
Coding >Pro_DTO377G3_2|g1398.t1
ATGAGCTCCATGAGTATGCGGAGTTTAGCTCCTGCTTCCAAGGTTTCCCGCATCTTGAGGAACCAAAGACGTCTC
TTCTCATCTTCAAAGCCCGCAGCCCGGATATGGTCCAACCAGCCTTTGCGCGCTAAGGAGTCCAGTGGCTACCTG
AGTGACAAGTACCCTATCATTGATCACGAGTACGATGCCCTCGTTGTCGGTGCCGGAGGTGCCGGTTTGCGCGCT
GCTTTCGGTCTGGCTGAAGCTGGATTCAAGACTGCTTGTGTTTCCAAGCTGTTCCCTACGAGAAGTCACACTGTC
GCTGCCCAGGGTGGTATCAACGCTGCCCTCGGAAACATGCACCCGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGATACC
GTGAAGGGTTCTGATTGGCTTGGTGACCAAGATGCCATTCACTACATGACCCGCGAGGCTCCCGCCAGTGTCCGC
GAGCTTGAAGGTTACGGTTGCCCATTCTCGCGTACTGAGGATGGACTTATTTACCAGCGTGCTTTCGGTGGTCAA
TCTAAGGATTACGGCAAGGGTGGTCAGGCTTACCGTTGCGCCGCCGCTGCTGATCGTACTGGTCACGCCCTTCTG
CACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACCACACCAACTACTTCATTGAATTCTTCGCCCTCGACCTGCTGATG
GAAGATGGTGTTTGCCGTGGTGTCATTGCCTACAACCAGGAGGATGGTACTCTGCACCGCTTCAAGGCCCACCAC
ACTGTCCTTGCCACCGGTGGTTACGGACGAGCCTTCTTCTCTTGTACCTCTGCCCACACTTGCACTGGTGACGGT
ATGGCTATGGTTTCTCGTGCTGGTCTCCCTAACCAGGATCTGGAATTCGTCCAGTTCCACCCTACTGGTATCTAC
GGTGCTGGTTGTCTGATTACCGAGGGCTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGATCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTC
ATGGAGCGTTACGCTCCTACCGCCAAGGATCTTGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGATCCATGACTCTGGAGATC
CGTGAGGGCCGTGGTGTTGGTCCCGAGAAGGACCACCTCTACCTTCAGCTCAGCCACTTGCCCGCTGAGCTCCTG
CACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACTGCCTCGATTTTCGCCGGTGTTGATGTTACCAAGCAGCCCATCCCT
GTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAACCACACTGGTGAGGTTCTCAATGTCGATGAG
AACGGCCAGGAGAAGCCTGTTCCCGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCCTGTGTGTCTGTCCACGGTGCTAAC
CGCCTGGGTGCCAACTCCCTGCTTGATTTGGTTGTCTTCGGCCGCGCTGTGTCTCACCGTGTTCGTGACATTTCC
AGCCCTGGCCAGCCCCACAAGCCCCTTGCAGCCGATGCTGGTGCTCAGTCTGTCAAGGACCTCGACCACGCCCGT
AATGCCGATGGCCCCAAGTCGACTTTTGAAGTCCGCAACGCTATGCAGAAGGTCATGCAGACCGATGTCAGCGTC
TTCCGTACCCAGTCGAGCTTGGACGAGGGTGTTGAGAAGATCAACAAGGTTGATCAGCTGTACGAACAGGTCGGC
ACTAAGGACCGCAGCATGATCTGGAATTCCGACTTGGTGGAGACTCTTGAGCTCCGCAACCTGCTCACTTGCGCT
ACCCAAACCGCTGCTTCCGCTGCAGCTCGTAAGGAGTCTCGTGGTGCTCACGCCCGTGAGGATTACCCCGAGCGT
GATGACGAGCACTGGATGAAGCACACTCTCTCCTGGCAGAAGGTTCCCCACGGCGAGATCAAGCTTGGCTACCGT
CCCGTTCAGTCCCACACCTTGGATGAGTCGGAGTGCAAGTCTGTTCCTCCTTTCAAGCGTGTCTACTAA
Transcript >Pro_DTO377G3_2|g1398.t1
ATGAGCTCCATGAGTATGCGGAGTTTAGCTCCTGCTTCCAAGGTTTCCCGCATCTTGAGGAACCAAAGACGTCTC
TTCTCATCTTCAAAGCCCGCAGCCCGGATATGGTCCAACCAGCCTTTGCGCGCTAAGGAGTCCAGTGGCTACCTG
AGTGACAAGTACCCTATCATTGATCACGAGTACGATGCCCTCGTTGTCGGTGCCGGAGGTGCCGGTTTGCGCGCT
GCTTTCGGTCTGGCTGAAGCTGGATTCAAGACTGCTTGTGTTTCCAAGCTGTTCCCTACGAGAAGTCACACTGTC
GCTGCCCAGGGTGGTATCAACGCTGCCCTCGGAAACATGCACCCGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGATACC
GTGAAGGGTTCTGATTGGCTTGGTGACCAAGATGCCATTCACTACATGACCCGCGAGGCTCCCGCCAGTGTCCGC
GAGCTTGAAGGTTACGGTTGCCCATTCTCGCGTACTGAGGATGGACTTATTTACCAGCGTGCTTTCGGTGGTCAA
TCTAAGGATTACGGCAAGGGTGGTCAGGCTTACCGTTGCGCCGCCGCTGCTGATCGTACTGGTCACGCCCTTCTG
CACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACCACACCAACTACTTCATTGAATTCTTCGCCCTCGACCTGCTGATG
GAAGATGGTGTTTGCCGTGGTGTCATTGCCTACAACCAGGAGGATGGTACTCTGCACCGCTTCAAGGCCCACCAC
ACTGTCCTTGCCACCGGTGGTTACGGACGAGCCTTCTTCTCTTGTACCTCTGCCCACACTTGCACTGGTGACGGT
ATGGCTATGGTTTCTCGTGCTGGTCTCCCTAACCAGGATCTGGAATTCGTCCAGTTCCACCCTACTGGTATCTAC
GGTGCTGGTTGTCTGATTACCGAGGGCTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGATCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTC
ATGGAGCGTTACGCTCCTACCGCCAAGGATCTTGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGATCCATGACTCTGGAGATC
CGTGAGGGCCGTGGTGTTGGTCCCGAGAAGGACCACCTCTACCTTCAGCTCAGCCACTTGCCCGCTGAGCTCCTG
CACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACTGCCTCGATTTTCGCCGGTGTTGATGTTACCAAGCAGCCCATCCCT
GTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAACCACACTGGTGAGGTTCTCAATGTCGATGAG
AACGGCCAGGAGAAGCCTGTTCCCGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCCTGTGTGTCTGTCCACGGTGCTAAC
CGCCTGGGTGCCAACTCCCTGCTTGATTTGGTTGTCTTCGGCCGCGCTGTGTCTCACCGTGTTCGTGACATTTCC
AGCCCTGGCCAGCCCCACAAGCCCCTTGCAGCCGATGCTGGTGCTCAGTCTGTCAAGGACCTCGACCACGCCCGT
AATGCCGATGGCCCCAAGTCGACTTTTGAAGTCCGCAACGCTATGCAGAAGGTCATGCAGACCGATGTCAGCGTC
TTCCGTACCCAGTCGAGCTTGGACGAGGGTGTTGAGAAGATCAACAAGGTTGATCAGCTGTACGAACAGGTCGGC
ACTAAGGACCGCAGCATGATCTGGAATTCCGACTTGGTGGAGACTCTTGAGCTCCGCAACCTGCTCACTTGCGCT
ACCCAAACCGCTGCTTCCGCTGCAGCTCGTAAGGAGTCTCGTGGTGCTCACGCCCGTGAGGATTACCCCGAGCGT
GATGACGAGCACTGGATGAAGCACACTCTCTCCTGGCAGAAGGTTCCCCACGGCGAGATCAAGCTTGGCTACCGT
CCCGTTCAGTCCCACACCTTGGATGAGTCGGAGTGCAAGTCTGTTCCTCCTTTCAAGCGTGTCTACTAA
Gene >Pro_DTO377G3_2|g1398.t1
ATGAGCTCCATGAGTATGCGGAGTTTAGCTCCTGCTTCCAAGGTGAGTAGCCATGCAACGATTTTCAGCCCATTC
GCAACGGCCATGACATACTCATAAGATCTCTCTAGGTTTCCCGCATCTTGAGGAACCAAAGACGTCTCTTCTCAT
CTTCAAAGCCCGCAGGTACGCATTAGACTACTCAACCCATGAACGCACCGTCACTAACTAAACTGCGCCAGCCCG
GATATGGTCCAACCAGCCTTTGCGCGCTAAGGAGTCCAGTGGCTACCTGAGTGACAAGTACCCTATCATTGTAAG
AGCTACCACTCACAGGCGGTTGATTGAGTCTAACATGCGCAGGATCACGAGTACGATGCCCTCGTTGTCGGTGCC
GGAGGTGCCGGTTTGCGCGCTGCTTTCGGTCTGGCTGAAGCTGGATTCAAGACTGCTTGTGTTTCCAAGCTGTTC
CCTACGAGAAGTCACACTGTCGCTGCCCAGGGTGGTATCAACGCTGCCCTCGGAAAGTAGGTTTTCACCGCAAGC
ACCGGAAGGTACCGAATTGAGTCTAACTGAATTTTAGCATGCACCCGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGATA
CCGTGAAGGGTTCTGATTGGCTTGGTGACCAAGATGCCATTCACTACATGACCCGCGAGGCTCCCGCCAGTGTCC
GCGAGCTTGAAGGTTACGGTTGCCCATTCTCGCGTACTGAGGATGGACTTATTTACCAGCGTGCTTTCGGTGGTC
AATCTAAGGATTACGGCAAGGGTGGTCAGGCTTACCGTTGCGCCGCCGCTGCTGATCGTACTGGTCACGCCCTTC
TGCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACCACACCAACTACTTCATTGAATTCTTCGCCCTCGACCTGCTGA
TGGAAGATGGTGTTTGCCGTGGTGTCATTGCCTACAACCAGGAGGATGGTACTCTGCACCGCTTCAAGGCCCACC
ACACTGTCCTTGCCACCGGTGGTTACGGACGAGCCTTCTTCTCTTGTACCTCTGCCCACACTTGCACTGGTGACG
GTATGGCTATGGTTTCTCGTGCTGGTCTCCCTAACCAGGATCTGGAATTCGTCCAGTTCCACCCTACTGGTATCT
ACGGTGCTGGTTGTCTGATTACCGAGGGCTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGATCAACTCCGAGGGTGAGCGTT
TCATGGAGCGTTACGCTCCTACCGCCAAGGATCTTGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGATCCATGACTCTGGAGA
TCCGTGAGGGCCGTGGTGTTGGTCCCGAGAAGGACCACCTCTACCTTCAGCTCAGCCACTTGCCCGCTGAGCTCC
TGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACTGCCTCGATTTTCGCCGGTGTTGATGTTACCAAGCAGCCCATCC
CTGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAACCACACTGGTGAGGTTCTCAATGTCGATG
AGAACGGCCAGGAGAAGCCTGTTCCCGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCCTGTGTGTCTGTCCACGGTGCTA
ACCGCCTGGGTGCCAACTCCCTGCTTGATTTGGTTGTCTTCGGCCGCGCTGTGTCTCACCGTGTTCGTGACATTT
CCAGCCCTGGCCAGCCCCACAAGCCCCTTGCAGCCGATGCTGGTGCTCAGTCTGTCAAGGACCTCGACCACGCCC
GTAATGCCGATGGCCCCAAGTCGACTTTTGAAGTCCGCAACGCTATGCAGAAGGTCATGCAGACCGATGTCAGCG
TCTTCCGTACCCAGTCGAGCTTGGACGAGGGTGTTGAGAAGATCAACAAGGTTGATCAGCTGTACGAACAGGTCG
GCACTAAGGACCGCAGCATGATCTGGAATTCCGACTTGGTGGAGACTCTTGAGCTCCGCAACCTGCTCACTTGCG
CGTACGTAACTCCGAATAACTGATCTAGGAATCGCTTGCTAACATTGGATCTCACAGTACCCAAACCGCTGCTTC
CGCTGCAGCTCGTAAGGAGTCTCGTGGTGCTCACGCCCGTGAGGATTACCCCGAGCGTGATGACGAGCACTGGAT
GAAGCACACTCTCTCCTGGCAGAAGGTTCCCCACGGCGAGATCAAGCTTGGCTACCGTCCCGTTCAGTCCCACAC
CTTGGATGAGTCGGAGTGCAAGTCTGTTCCTCCTTTCAAGCGTGTCTACTAA

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