© 2022 - Robin Ohm - Utrecht University - The Netherlands
Built with Python Django and Wagtail
| Protein ID | Pro_DTO377G3_2|g1066.t1 |
| Gene name | |
| Location | scaffold_01:2831222..2834281 |
| Strand | + |
| Gene length (bp) | 3059 |
| Transcript length (bp) | 2985 |
| Coding sequence length (bp) | 2985 |
| Protein length (aa) | 995 |
| PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
|---|---|---|---|---|---|
| PF00122 | E1-E2_ATPase | E1-E2 ATPase | 1.5E-36 | 186 | 408 |
| PF00702 | Hydrolase | haloacid dehalogenase-like hydrolase | 2.1E-17 | 426 | 692 |
| PF00690 | Cation_ATPase_N | Cation transporter/ATPase, N-terminus | 2.5E-10 | 88 | 142 |
| SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
|---|---|---|
| No | 1 - 32 | 0.45 |
| Domain # | Start | End | Length |
|---|---|---|---|
| 1 | 124 | 146 | 22 |
| 2 | 150 | 168 | 18 |
| 3 | 338 | 360 | 22 |
| 4 | 380 | 402 | 22 |
| 5 | 737 | 759 | 22 |
| 6 | 802 | 824 | 22 |
| 7 | 867 | 889 | 22 |
| 8 | 917 | 939 | 22 |
| Type of sequence | Sequence |
|---|---|
| Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
| Protein | >Pro_DTO377G3_2|g1066.t1 MAERRISYAVDVENGGEHRTREADDGNLDEYSALNRYISTAQNNRRGSTSSAAGKSGDDSEKKKPWWKFGGKVVG GVEEGFVTPDDWLETDLRAGLSSSDIEPRRKKIGWNELVTEKTNIFLQFLGYFQGPILYVMELAVCLAAGLRDWI DLGVICGILLLNALVGWYQEKQAADVVASLKGDIAMRALVIRDGHEEEILARELVAGDIVIVEEGTVIPADVRLI CDYTKPEMFETYKEYLANTNSDDLKEKHGDDEDDDIETHQGPSLIACDQSAITGESLAVDKYMADVCYYTTGCKR GKAYGIVTATARHSFVGKTAALVQGANDTGHFKAVMDNIGTTLLVLVMFWILAAWIGGFFRHLKIATPEDNDNNL LHYTLILLIIGVPVGLPVVTTTTLAVGAAYLAEQKAIVQKLTAIESLAGVDILCSDKTGTLTANQLSIREPYVSE GVDVNWMMAVAAIASSHNIKNLDPIDKVTVLTLRRYPKAREILSRNWITEKYTPFDPVSKRITTICTCDGVRYVC AKGAPRAILAMSDCSPEEAKLYREKVTEFARRGFRSLGVAVQKEGEPWQLLGMYPMFDPPREDTAHTIAEAQVLG LSVKMLTGDAISIAKETCKMLALGTKVYNSERLIHGGLAGSAQHDLVEKADGFAEVFPEHKYQVVEMLQQRGHLI AMTGDGVNDAPSLKKADCGIAVEGSTEAAQAAADIVFLAPGLSTIVDAIKLARQIFQRMKAYIQYRIALCLHLEI YLVTSMIIINETVDSSLVVFIALFADLATIAVAYDNAHFEARPVEWQLPKIWVISVVLGFLLAAATWIIRGTLFL KNGGIIQNFGSPQEILFLEIALTENWLIFVTRGAKTWPSWQLVIAIFIVDVLSTLFCVFGWLAPDWKQTSPVDAG GPGFSHNNDVDIVTVVVIWGYSIGVTIIIAVVYYLLTIVPALDNLGRKTRSKADTKIENMIAHLSKLAIEMERDA EGKTRYTIGARAEEIEDNE* |
| Coding | >Pro_DTO377G3_2|g1066.t1 ATGGCGGAGCGGAGAATTTCCTATGCTGTTGATGTCGAAAATGGTGGTGAGCATCGCACCCGTGAGGCTGATGAT GGCAATCTCGACGAGTACTCTGCTTTGAACCGATACATCTCCACTGCCCAAAACAACCGTCGTGGCTCGACCTCC AGCGCCGCTGGTAAGAGCGGCGATGACTCCGAGAAGAAGAAGCCCTGGTGGAAGTTCGGTGGCAAGGTCGTGGGA GGTGTCGAGGAAGGTTTCGTTACCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACCTGCGCGCTGGTCTCAGCAGCAGCGAC ATCGAGCCTCGTCGCAAGAAGATCGGCTGGAACGAGCTGGTGACTGAGAAGACCAACATCTTCCTTCAGTTCCTG GGTTACTTCCAAGGTCCTATTCTTTATGTTATGGAACTTGCTGTCTGTCTCGCTGCCGGTCTGCGTGACTGGATC GATCTCGGTGTTATCTGTGGTATTCTTTTGCTTAACGCTCTCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGAT GTCGTGGCTTCTCTGAAGGGTGATATTGCTATGCGTGCTCTCGTTATCCGTGACGGCCATGAGGAGGAGATTCTC GCTCGTGAGCTCGTTGCTGGTGATATTGTTATCGTCGAGGAGGGTACCGTTATCCCTGCCGATGTCCGCCTGATC TGTGACTACACCAAGCCCGAGATGTTCGAGACCTACAAGGAATACCTCGCCAACACCAACTCCGACGACCTCAAG GAGAAGCACGGTGACGATGAGGATGATGATATTGAGACCCACCAGGGTCCCTCCCTCATTGCTTGTGATCAGTCC GCTATCACTGGTGAATCCCTCGCTGTCGACAAGTACATGGCCGATGTCTGTTACTACACCACCGGTTGCAAGCGC GGCAAGGCCTACGGTATTGTCACTGCTACTGCTCGTCACTCCTTCGTCGGTAAGACCGCCGCCCTGGTCCAGGGT GCCAACGACACTGGTCACTTCAAGGCTGTCATGGACAACATCGGTACCACTTTGCTCGTTCTCGTCATGTTCTGG ATTCTCGCCGCCTGGATTGGTGGTTTCTTCCGTCACTTGAAGATTGCTACCCCCGAGGACAACGACAACAACCTG CTCCACTACACTTTGATTCTCCTGATTATCGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTTGTTACCACCACCACCCTCGCT GTCGGTGCCGCCTACCTCGCCGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGCTATCGAGTCCCTCGCTGGTGTC GATATTCTCTGCTCTGACAAGACCGGTACTCTCACTGCCAACCAGCTTTCCATCCGTGAGCCCTACGTCTCCGAG GGTGTCGATGTCAACTGGATGATGGCCGTCGCCGCTATTGCCTCTTCCCACAACATCAAGAACCTCGACCCCATT GATAAGGTTACCGTCCTCACTCTCCGCCGTTACCCCAAGGCCCGTGAGATCCTCTCCCGCAACTGGATCACCGAG AAGTACACTCCCTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACTATCTGTACTTGCGATGGTGTCCGTTACGTTTGC GCCAAGGGTGCCCCCCGTGCTATTCTCGCCATGTCCGACTGCTCCCCCGAGGAGGCCAAGCTCTACCGTGAGAAG GTCACCGAGTTCGCCCGCCGTGGTTTCCGTTCCCTTGGTGTCGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAGCTT CTGGGCATGTACCCCATGTTCGATCCCCCCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGGTCCTCGGT CTCTCCGTTAAGATGCTTACTGGTGACGCTATCTCCATCGCCAAGGAGACTTGCAAGATGCTTGCCCTCGGTACC AAGGTTTACAACTCTGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTCGCTGGTTCCGCCCAGCACGACCTTGTCGAGAAGGCT GATGGTTTCGCTGAGGTGTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGTTGCAGCAGCGTGGTCACTTGATT GCCATGACTGGTGACGGTGTTAACGATGCTCCCTCCCTCAAGAAGGCCGATTGTGGTATTGCCGTCGAAGGTTCC ACTGAGGCTGCCCAGGCTGCCGCCGATATTGTCTTCCTCGCCCCCGGTCTCTCCACCATCGTCGATGCTATCAAG TTGGCCCGCCAGATTTTCCAGCGTATGAAGGCTTACATCCAGTACCGTATCGCTCTGTGTCTCCACCTCGAGATC TACCTCGTTACCTCCATGATCATCATCAACGAGACTGTCGACTCCTCCCTGGTTGTCTTCATCGCCCTGTTCGCT GATCTTGCCACCATTGCCGTTGCTTACGATAACGCTCACTTCGAGGCCCGCCCCGTCGAGTGGCAGTTGCCCAAG ATCTGGGTTATCTCCGTTGTTCTTGGATTCCTCCTCGCTGCCGCTACCTGGATCATCCGTGGTACCCTCTTCCTC AAGAACGGTGGTATCATCCAGAACTTCGGTTCTCCCCAGGAAATTCTCTTCCTCGAGATCGCCCTCACTGAGAAC TGGCTCATCTTCGTTACCCGTGGTGCTAAGACATGGCCCTCGTGGCAGTTGGTTATTGCCATCTTCATCGTCGAT GTCCTCTCTACCTTGTTCTGTGTCTTCGGCTGGCTCGCACCCGACTGGAAGCAGACCTCCCCCGTCGATGCCGGC GGTCCTGGCTTCTCCCACAACAACGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTCATCTGGGGCTACTCCATCGGTGTG ACTATCATCATCGCCGTTGTGTACTACCTCCTGACCATCGTTCCCGCTCTTGACAACCTTGGCCGCAAGACCCGC TCCAAGGCCGACACCAAGATCGAGAACATGATCGCCCACCTTTCCAAGCTTGCCATCGAGATGGAGCGCGACGCG GAAGGAAAGACTCGTTACACCATCGGTGCTCGCGCCGAGGAGATCGAGGACAACGAGTAA |
| Transcript | >Pro_DTO377G3_2|g1066.t1 ATGGCGGAGCGGAGAATTTCCTATGCTGTTGATGTCGAAAATGGTGGTGAGCATCGCACCCGTGAGGCTGATGAT GGCAATCTCGACGAGTACTCTGCTTTGAACCGATACATCTCCACTGCCCAAAACAACCGTCGTGGCTCGACCTCC AGCGCCGCTGGTAAGAGCGGCGATGACTCCGAGAAGAAGAAGCCCTGGTGGAAGTTCGGTGGCAAGGTCGTGGGA GGTGTCGAGGAAGGTTTCGTTACCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACCTGCGCGCTGGTCTCAGCAGCAGCGAC ATCGAGCCTCGTCGCAAGAAGATCGGCTGGAACGAGCTGGTGACTGAGAAGACCAACATCTTCCTTCAGTTCCTG GGTTACTTCCAAGGTCCTATTCTTTATGTTATGGAACTTGCTGTCTGTCTCGCTGCCGGTCTGCGTGACTGGATC GATCTCGGTGTTATCTGTGGTATTCTTTTGCTTAACGCTCTCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGAT GTCGTGGCTTCTCTGAAGGGTGATATTGCTATGCGTGCTCTCGTTATCCGTGACGGCCATGAGGAGGAGATTCTC GCTCGTGAGCTCGTTGCTGGTGATATTGTTATCGTCGAGGAGGGTACCGTTATCCCTGCCGATGTCCGCCTGATC TGTGACTACACCAAGCCCGAGATGTTCGAGACCTACAAGGAATACCTCGCCAACACCAACTCCGACGACCTCAAG GAGAAGCACGGTGACGATGAGGATGATGATATTGAGACCCACCAGGGTCCCTCCCTCATTGCTTGTGATCAGTCC GCTATCACTGGTGAATCCCTCGCTGTCGACAAGTACATGGCCGATGTCTGTTACTACACCACCGGTTGCAAGCGC GGCAAGGCCTACGGTATTGTCACTGCTACTGCTCGTCACTCCTTCGTCGGTAAGACCGCCGCCCTGGTCCAGGGT GCCAACGACACTGGTCACTTCAAGGCTGTCATGGACAACATCGGTACCACTTTGCTCGTTCTCGTCATGTTCTGG ATTCTCGCCGCCTGGATTGGTGGTTTCTTCCGTCACTTGAAGATTGCTACCCCCGAGGACAACGACAACAACCTG CTCCACTACACTTTGATTCTCCTGATTATCGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTTGTTACCACCACCACCCTCGCT GTCGGTGCCGCCTACCTCGCCGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGCTATCGAGTCCCTCGCTGGTGTC GATATTCTCTGCTCTGACAAGACCGGTACTCTCACTGCCAACCAGCTTTCCATCCGTGAGCCCTACGTCTCCGAG GGTGTCGATGTCAACTGGATGATGGCCGTCGCCGCTATTGCCTCTTCCCACAACATCAAGAACCTCGACCCCATT GATAAGGTTACCGTCCTCACTCTCCGCCGTTACCCCAAGGCCCGTGAGATCCTCTCCCGCAACTGGATCACCGAG AAGTACACTCCCTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACTATCTGTACTTGCGATGGTGTCCGTTACGTTTGC GCCAAGGGTGCCCCCCGTGCTATTCTCGCCATGTCCGACTGCTCCCCCGAGGAGGCCAAGCTCTACCGTGAGAAG GTCACCGAGTTCGCCCGCCGTGGTTTCCGTTCCCTTGGTGTCGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAGCTT CTGGGCATGTACCCCATGTTCGATCCCCCCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGGTCCTCGGT CTCTCCGTTAAGATGCTTACTGGTGACGCTATCTCCATCGCCAAGGAGACTTGCAAGATGCTTGCCCTCGGTACC AAGGTTTACAACTCTGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTCGCTGGTTCCGCCCAGCACGACCTTGTCGAGAAGGCT GATGGTTTCGCTGAGGTGTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGTTGCAGCAGCGTGGTCACTTGATT GCCATGACTGGTGACGGTGTTAACGATGCTCCCTCCCTCAAGAAGGCCGATTGTGGTATTGCCGTCGAAGGTTCC ACTGAGGCTGCCCAGGCTGCCGCCGATATTGTCTTCCTCGCCCCCGGTCTCTCCACCATCGTCGATGCTATCAAG TTGGCCCGCCAGATTTTCCAGCGTATGAAGGCTTACATCCAGTACCGTATCGCTCTGTGTCTCCACCTCGAGATC TACCTCGTTACCTCCATGATCATCATCAACGAGACTGTCGACTCCTCCCTGGTTGTCTTCATCGCCCTGTTCGCT GATCTTGCCACCATTGCCGTTGCTTACGATAACGCTCACTTCGAGGCCCGCCCCGTCGAGTGGCAGTTGCCCAAG ATCTGGGTTATCTCCGTTGTTCTTGGATTCCTCCTCGCTGCCGCTACCTGGATCATCCGTGGTACCCTCTTCCTC AAGAACGGTGGTATCATCCAGAACTTCGGTTCTCCCCAGGAAATTCTCTTCCTCGAGATCGCCCTCACTGAGAAC TGGCTCATCTTCGTTACCCGTGGTGCTAAGACATGGCCCTCGTGGCAGTTGGTTATTGCCATCTTCATCGTCGAT GTCCTCTCTACCTTGTTCTGTGTCTTCGGCTGGCTCGCACCCGACTGGAAGCAGACCTCCCCCGTCGATGCCGGC GGTCCTGGCTTCTCCCACAACAACGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTCATCTGGGGCTACTCCATCGGTGTG ACTATCATCATCGCCGTTGTGTACTACCTCCTGACCATCGTTCCCGCTCTTGACAACCTTGGCCGCAAGACCCGC TCCAAGGCCGACACCAAGATCGAGAACATGATCGCCCACCTTTCCAAGCTTGCCATCGAGATGGAGCGCGACGCG GAAGGAAAGACTCGTTACACCATCGGTGCTCGCGCCGAGGAGATCGAGGACAACGAGTAA |
| Gene | >Pro_DTO377G3_2|g1066.t1 ATGGCGGAGCGGAGAATTTCCTATGCTGTTGATGTCGAAAATGGTGGTGAGCATCGCACCCGTGAGGCTGATGAT GGCAATCTCGACGAGTACTCTGCTTTGAACCGATACATCTCCACTGCCCAAAACAACCGTCGTGGCTCGACCTCC AGCGCCGCTGGTAAGAGCGGCGATGACTCCGAGAAGAAGAAGCCCTGGTGGAAGTTCGGTGGCAAGGTCGTGGGA GGTGTCGAGGAAGGTTTCGTTACCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACCTGCGCGCTGGTCTCAGCAGCAGCGAC ATCGAGCCTCGTCGCAAGAAGATCGGCTGGAACGAGCTGGTGACTGAGAAGACCAACATCTTCCTTCAGTTCCTG GGTTACTTCCAAGGTCCTATTCTTTATGGTAAGTGACCTGGACTTCCGTCTTCAGGACGCGTTTCCAGCCAATCA GCCCACTAACGCCTTGCTCTCCCACAGTTATGGAACTTGCTGTCTGTCTCGCTGCCGGTCTGCGTGACTGGATCG ATCTCGGTGTTATCTGTGGTATTCTTTTGCTTAACGCTCTCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGATG TCGTGGCTTCTCTGAAGGGTGATATTGCTATGCGTGCTCTCGTTATCCGTGACGGCCATGAGGAGGAGATTCTCG CTCGTGAGCTCGTTGCTGGTGATATTGTTATCGTCGAGGAGGGTACCGTTATCCCTGCCGATGTCCGCCTGATCT GTGACTACACCAAGCCCGAGATGTTCGAGACCTACAAGGAATACCTCGCCAACACCAACTCCGACGACCTCAAGG AGAAGCACGGTGACGATGAGGATGATGATATTGAGACCCACCAGGGTCCCTCCCTCATTGCTTGTGATCAGTCCG CTATCACTGGTGAATCCCTCGCTGTCGACAAGTACATGGCCGATGTCTGTTACTACACCACCGGTTGCAAGCGCG GCAAGGCCTACGGTATTGTCACTGCTACTGCTCGTCACTCCTTCGTCGGTAAGACCGCCGCCCTGGTCCAGGGTG CCAACGACACTGGTCACTTCAAGGCTGTCATGGACAACATCGGTACCACTTTGCTCGTTCTCGTCATGTTCTGGA TTCTCGCCGCCTGGATTGGTGGTTTCTTCCGTCACTTGAAGATTGCTACCCCCGAGGACAACGACAACAACCTGC TCCACTACACTTTGATTCTCCTGATTATCGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTTGTTACCACCACCACCCTCGCTG TCGGTGCCGCCTACCTCGCCGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGCTATCGAGTCCCTCGCTGGTGTCG ATATTCTCTGCTCTGACAAGACCGGTACTCTCACTGCCAACCAGCTTTCCATCCGTGAGCCCTACGTCTCCGAGG GTGTCGATGTCAACTGGATGATGGCCGTCGCCGCTATTGCCTCTTCCCACAACATCAAGAACCTCGACCCCATTG ATAAGGTTACCGTCCTCACTCTCCGCCGTTACCCCAAGGCCCGTGAGATCCTCTCCCGCAACTGGATCACCGAGA AGTACACTCCCTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACTATCTGTACTTGCGATGGTGTCCGTTACGTTTGCG CCAAGGGTGCCCCCCGTGCTATTCTCGCCATGTCCGACTGCTCCCCCGAGGAGGCCAAGCTCTACCGTGAGAAGG TCACCGAGTTCGCCCGCCGTGGTTTCCGTTCCCTTGGTGTCGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAGCTTC TGGGCATGTACCCCATGTTCGATCCCCCCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGGTCCTCGGTC TCTCCGTTAAGATGCTTACTGGTGACGCTATCTCCATCGCCAAGGAGACTTGCAAGATGCTTGCCCTCGGTACCA AGGTTTACAACTCTGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTCGCTGGTTCCGCCCAGCACGACCTTGTCGAGAAGGCTG ATGGTTTCGCTGAGGTGTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGTTGCAGCAGCGTGGTCACTTGATTG CCATGACTGGTGACGGTGTTAACGATGCTCCCTCCCTCAAGAAGGCCGATTGTGGTATTGCCGTCGAAGGTTCCA CTGAGGCTGCCCAGGCTGCCGCCGATATTGTCTTCCTCGCCCCCGGTCTCTCCACCATCGTCGATGCTATCAAGT TGGCCCGCCAGATTTTCCAGCGTATGAAGGCTTACATCCAGTACCGTATCGCTCTGTGTCTCCACCTCGAGATCT ACCTCGTTACCTCCATGATCATCATCAACGAGACTGTCGACTCCTCCCTGGTTGTCTTCATCGCCCTGTTCGCTG ATCTTGCCACCATTGCCGTTGCTTACGATAACGCTCACTTCGAGGCCCGCCCCGTCGAGTGGCAGTTGCCCAAGA TCTGGGTTATCTCCGTTGTTCTTGGATTCCTCCTCGCTGCCGCTACCTGGATCATCCGTGGTACCCTCTTCCTCA AGAACGGTGGTATCATCCAGAACTTCGGTTCTCCCCAGGAAATTCTCTTCCTCGAGATCGCCCTCACTGAGAACT GGCTCATCTTCGTTACCCGTGGTGCTAAGACATGGCCCTCGTGGCAGTTGGTTATTGCCATCTTCATCGTCGATG TCCTCTCTACCTTGTTCTGTGTCTTCGGCTGGCTCGCACCCGACTGGAAGCAGACCTCCCCCGTCGATGCCGGCG GTCCTGGCTTCTCCCACAACAACGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTCATCTGGGGCTACTCCATCGGTGTGA CTATCATCATCGCCGTTGTGTACTACCTCCTGACCATCGTTCCCGCTCTTGACAACCTTGGCCGCAAGACCCGCT CCAAGGCCGACACCAAGATCGAGAACATGATCGCCCACCTTTCCAAGCTTGCCATCGAGATGGAGCGCGACGCGG AAGGAAAGACTCGTTACACCATCGGTGCTCGCGCCGAGGAGATCGAGGACAACGAGTAA |