Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein ID	Ophun1\|3554
Gene name
Location	Contig_317:5452..6493
Strand	-
Gene length (bp)	1041
Transcript length (bp)	1041
Coding sequence length (bp)	1041
Protein length (aa)	347

PFAM Domains

(None)

Swissprot hits

(None)

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]

SignalP signal predicted	Location (based on Ymax)	D score (significance: > 0.45)
No	1 - 48	0.5

Transmembrane Domains

Domain #	Start	End	Length
1	107	129	22
2	139	161	22
3	174	196	22
4	216	238	22
5	271	290	19
6	294	316	22

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

No expression data available for this genome

Sequences

Type of sequence	Sequence
Locus	Download genbank file of locus The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein	>Ophun1\|3554 MLTTASTWATPLLSGLTSSLTPSNPPAAPFRLIAGLHLVSLPLLILCAPETVFDRSDSSDSDSDASTKASRGYIR NVIRFRPPLTSSSSSAARAVRAVVAPSTCLVSALSAVPYAALWGLAAVGAILVVPEPLELGPVVVGALLTGPWVL ATLVVGGLACFYRGFHDRFTRRAGCVVVAVGAFLVVVGLLSFGLGLDNFMIKPVPSSPPYFTPSAAQQLSPPLLA LQLGILAAGIHVLDTATRPLIARSASFSSSSVAAAQGSIGDMHAAIVAFRSFAAAIGIATLRASPLRPAVIAMTV VQILVVPAVLLLCWYAGEAVWRADGRVLRLVDARELKQSGSFFDHD*
Coding	>Ophun1\|3554 ATGCTCACCACAGCCTCAACCTGGGCCACCCCCCTCCTCTCAGGCCTAACCTCCAGCCTCACGCCCTCCAACCCT CCCGCCGCGCCCTTCCGCCTGATAGCCGGCCTCCACCTCGTCTCCCTCCCGCTCCTCATCCTCTGCGCGCCGGAA ACCGTCTTCGACCGGTCCGACAGCTCCGACTCCGACTCCGATGCCTCGACCAAAGCCTCCAGAGGCTACATCCGC AACGTAATCCGCTTCCGCCCTCCTCTAACCTCGTCATCGTCTTCTGCTGCCCGGGCTGTCCGTGCCGTTGTCGCG CCGTCGACGTGTCTCGTCTCGGCCCTCTCAGCTGTTCCTTATGCTGCGCTCTGGGGTCTCGCTGCCGTCGGGGCC ATCTTGGTTGTGCCGGAGCCGCTGGAACTCGGCCCTGTTGTTGTCGGGGCGCTTCTCACCGGGCCGTGGGTGTTG GCTACCCTCGTCGTCGGTGGTCTGGCCTGCTTCTATCGTGGCTTTCACGATCGCTTCACTCGTCGAGCTGGCTGT GTTGTTGTGGCTGTCGGGGCCTTTCTCGTCGTTGTCGGCCTGCTCTCCTTTGGTCTTGGACTCGACAACTTCATG ATAAAGCCCGTTCCATCGTCACCCCCTTACTTTACCCCTTCAGCTGCTCAACAGCTCTCTCCGCCGCTGTTAGCC CTGCAACTCGGCATACTGGCAGCAGGCATCCACGTTCTCGACACAGCTACTCGACCTCTAATTGCCCGCTCAGCC TCCTTCAGCTCATCCAGCGTGGCAGCAGCTCAGGGCTCTATAGGCGATATGCACGCCGCCATCGTCGCTTTCCGC AGCTTCGCGGCCGCCATCGGCATCGCCACTCTACGAGCCTCACCGCTACGTCCAGCCGTCATTGCCATGACGGTC GTTCAGATACTCGTTGTTCCCGCTGTTCTTCTGCTATGTTGGTACGCTGGTGAGGCTGTCTGGCGCGCAGACGGT CGTGTTCTCCGGCTGGTAGACGCCCGTGAGCTGAAGCAGTCGGGGAGTTTCTTTGATCACGATTGA
Transcript	>Ophun1\|3554 ATGCTCACCACAGCCTCAACCTGGGCCACCCCCCTCCTCTCAGGCCTAACCTCCAGCCTCACGCCCTCCAACCCT CCCGCCGCGCCCTTCCGCCTGATAGCCGGCCTCCACCTCGTCTCCCTCCCGCTCCTCATCCTCTGCGCGCCGGAA ACCGTCTTCGACCGGTCCGACAGCTCCGACTCCGACTCCGATGCCTCGACCAAAGCCTCCAGAGGCTACATCCGC AACGTAATCCGCTTCCGCCCTCCTCTAACCTCGTCATCGTCTTCTGCTGCCCGGGCTGTCCGTGCCGTTGTCGCG CCGTCGACGTGTCTCGTCTCGGCCCTCTCAGCTGTTCCTTATGCTGCGCTCTGGGGTCTCGCTGCCGTCGGGGCC ATCTTGGTTGTGCCGGAGCCGCTGGAACTCGGCCCTGTTGTTGTCGGGGCGCTTCTCACCGGGCCGTGGGTGTTG GCTACCCTCGTCGTCGGTGGTCTGGCCTGCTTCTATCGTGGCTTTCACGATCGCTTCACTCGTCGAGCTGGCTGT GTTGTTGTGGCTGTCGGGGCCTTTCTCGTCGTTGTCGGCCTGCTCTCCTTTGGTCTTGGACTCGACAACTTCATG ATAAAGCCCGTTCCATCGTCACCCCCTTACTTTACCCCTTCAGCTGCTCAACAGCTCTCTCCGCCGCTGTTAGCC CTGCAACTCGGCATACTGGCAGCAGGCATCCACGTTCTCGACACAGCTACTCGACCTCTAATTGCCCGCTCAGCC TCCTTCAGCTCATCCAGCGTGGCAGCAGCTCAGGGCTCTATAGGCGATATGCACGCCGCCATCGTCGCTTTCCGC AGCTTCGCGGCCGCCATCGGCATCGCCACTCTACGAGCCTCACCGCTACGTCCAGCCGTCATTGCCATGACGGTC GTTCAGATACTCGTTGTTCCCGCTGTTCTTCTGCTATGTTGGTACGCTGGTGAGGCTGTCTGGCGCGCAGACGGT CGTGTTCTCCGGCTGGTAGACGCCCGTGAGCTGAAGCAGTCGGGGAGTTTCTTTGATCACGATTGA
Gene	>Ophun1\|3554 ATGCTCACCACAGCCTCAACCTGGGCCACCCCCCTCCTCTCAGGCCTAACCTCCAGCCTCACGCCCTCCAACCCT CCCGCCGCGCCCTTCCGCCTGATAGCCGGCCTCCACCTCGTCTCCCTCCCGCTCCTCATCCTCTGCGCGCCGGAA ACCGTCTTCGACCGGTCCGACAGCTCCGACTCCGACTCCGATGCCTCGACCAAAGCCTCCAGAGGCTACATCCGC AACGTAATCCGCTTCCGCCCTCCTCTAACCTCGTCATCGTCTTCTGCTGCCCGGGCTGTCCGTGCCGTTGTCGCG CCGTCGACGTGTCTCGTCTCGGCCCTCTCAGCTGTTCCTTATGCTGCGCTCTGGGGTCTCGCTGCCGTCGGGGCC ATCTTGGTTGTGCCGGAGCCGCTGGAACTCGGCCCTGTTGTTGTCGGGGCGCTTCTCACCGGGCCGTGGGTGTTG GCTACCCTCGTCGTCGGTGGTCTGGCCTGCTTCTATCGTGGCTTTCACGATCGCTTCACTCGTCGAGCTGGCTGT GTTGTTGTGGCTGTCGGGGCCTTTCTCGTCGTTGTCGGCCTGCTCTCCTTTGGTCTTGGACTCGACAACTTCATG ATAAAGCCCGTTCCATCGTCACCCCCTTACTTTACCCCTTCAGCTGCTCAACAGCTCTCTCCGCCGCTGTTAGCC CTGCAACTCGGCATACTGGCAGCAGGCATCCACGTTCTCGACACAGCTACTCGACCTCTAATTGCCCGCTCAGCC TCCTTCAGCTCATCCAGCGTGGCAGCAGCTCAGGGCTCTATAGGCGATATGCACGCCGCCATCGTCGCTTTCCGC AGCTTCGCGGCCGCCATCGGCATCGCCACTCTACGAGCCTCACCGCTACGTCCAGCCGTCATTGCCATGACGGTC GTTCAGATACTCGTTGTTCCCGCTGTTCTTCTGCTATGTTGGTACGCTGGTGAGGCTGTCTGGCGCGCAGACGGT CGTGTTCTCCGGCTGGTAGACGCCCGTGAGCTGAAGCAGTCGGGGAGTTTCTTTGATCACGATTGA

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