Protein ID | Ophun1|2793 |
Gene name | |
Location | Contig_249:21912..24628 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2716 |
Transcript length (bp) | 1827 |
Coding sequence length (bp) | 1827 |
Protein length (aa) | 609 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
Yes | 1 - 18 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 34 | 56 | 22 |
2 | 69 | 86 | 17 |
3 | 169 | 191 | 22 |
4 | 201 | 223 | 22 |
5 | 236 | 258 | 22 |
6 | 302 | 324 | 22 |
7 | 337 | 359 | 22 |
8 | 372 | 394 | 22 |
9 | 407 | 429 | 22 |
10 | 439 | 461 | 22 |
11 | 473 | 495 | 22 |
12 | 526 | 548 | 22 |
13 | 582 | 604 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ophun1|2793 MKGAAVITVLAANLTLAQPTDPLATAKLQARDPSGVAGGIGGGIGGGIGGGLGAGVPNFLRSRQNNRPIGGGIGG GLGGGIGGGIGSMKKVRRNKRPAQQRGGGIGGGTGGGIGAAAPKIRRRKTPIGFGPGTIGGGINGGIRRGSGGGI NGAIRSASISRVLRRKSSGAASRGLGGGIGGGIGGGIGASVPNFQRSKSPGVASGLGGGIGGGIGGGVGASVPNF QRSKSPGAASGLGGGIGGGIGGGIGGGIGGGVGASVPNFQRSKSPGAASGLGGVAGVQRDRQAAGAAAGLGGGIG GGIGGGIGGGIGGGIGGGVGVPGVQRNKQSAGASSRAIGGGFGGGIGGGIGGGVGAPGVQRNTQVPSGLGGDIGG GIGGGIGGGIGGGFGASGVQRNKQSAGAYSQAIGGGFGGGIGGGIGGGVPASGVQRNTQAPSGIGGGIGGGIGGG IGGGVGGGVGAPGHQRNKQPAGSASGGGLGGGIGGGIGGGVGGSVPNFNFRRHEQEGELNGDDSDDLEASEANFP LYIRTAGGAIGGGFGGGVGGGVGGSVPNFNLRRHEEEQFSPDDVEAFEDSFPLDARAAGGAIGGGFGGGIGGGIG GGFGGELS* |
Coding | >Ophun1|2793 ATGAAGGGAGCCGCCGTCATCACCGTCCTCGCCGCTAACCTCACCCTCGCCCAACCCACCGACCCACTCGCAACC GCCAAGCTTCAAGCACGAGACCCCAGCGGTGTCGCGGGCGGCATCGGCGGCGGCATCGGTGGCGGTATCGGAGGC GGCCTTGGAGCTGGCGTTCCCAACTTCCTGCGGAGTAGGCAAAACAACCGGCCGATCGGCGGTGGCATCGGCGGT GGCCTTGGTGGCGGCATTGGCGGTGGCATTGGTTCGATGAAAAAGGTTCGGCGAAACAAGCGGCCTGCTCAGCAG CGTGGTGGCGGCATCGGAGGCGGTACGGGAGGTGGCATTGGAGCTGCCGCCCCCAAGATCCGGCGGCGCAAGACT CCCATCGGCTTCGGCCCTGGAACCATCGGAGGTGGCATCAACGGTGGTATCCGGCGTGGTAGCGGAGGTGGCATC AACGGTGCTATCCGGAGTGCTTCCATCTCAAGGGTCCTGCGGAGGAAGTCCTCCGGAGCCGCCTCTCGCGGTCTT GGAGGGGGAATTGGAGGCGGTATTGGAGGTGGTATTGGAGCTTCCGTTCCTAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCC GGAGTTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGCATTGGAGGGGGCATTGGTGGTGGTGTTGGAGCTTCTGTTCCCAACTTT CAGCGAAGCAAGTCTCCTGGAGCTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGTATCGGTGGTGGTATCGGAGGAGGCATCGGA GGGGGCATCGGTGGTGGTGTTGGAGCTTCTGTTCCTAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCCGGAGCTGCTTCTGGG CTAGGAGGAGTTGCCGGCGTGCAGAGAGACAGACAGGCTGCTGGGGCTGCTGCTGGGCTTGGTGGCGGCATCGGT GGCGGCATCGGTGGCGGCATCGGCGGAGGCATTGGTGGTGGCATTGGAGGAGGTGTTGGGGTACCTGGCGTCCAG AGGAACAAGCAGTCTGCTGGGGCTTCTTCTAGAGCCATCGGCGGTGGTTTCGGCGGTGGAATTGGAGGGGGGATT GGTGGTGGTGTTGGTGCTCCTGGCGTCCAGCGAAACACGCAGGTTCCTTCTGGACTCGGAGGGGACATCGGAGGA GGTATTGGCGGTGGCATCGGAGGGGGCATCGGAGGGGGCTTTGGCGCCTCTGGCGTACAGAGAAACAAGCAGTCT GCCGGAGCTTATTCTCAAGCTATTGGCGGTGGTTTCGGCGGTGGTATCGGAGGTGGCATTGGCGGTGGTGTTCCC GCTTCTGGCGTCCAGCGAAACACGCAGGCTCCTTCTGGCATTGGCGGTGGTATTGGCGGTGGCATTGGAGGTGGC ATTGGAGGTGGTGTTGGAGGTGGTGTTGGCGCTCCTGGCCACCAGCGCAATAAGCAGCCTGCCGGATCTGCTTCT GGAGGTGGTCTCGGAGGCGGCATCGGAGGCGGCATCGGTGGTGGTGTTGGCGGTTCCGTCCCCAACTTCAACTTC CGCCGACATGAACAAGAGGGCGAGCTCAACGGCGATGACAGCGATGACCTTGAAGCTTCCGAGGCCAACTTTCCC CTGTATATTCGGACTGCAGGTGGTGCTATCGGTGGCGGCTTCGGCGGTGGTGTTGGCGGCGGTGTTGGCGGTTCG GTTCCCAACTTCAATCTCCGTCGGCATGAGGAGGAGCAGTTCAGCCCCGACGACGTCGAAGCTTTCGAGGACAGC TTCCCTCTGGATGCTCGGGCTGCAGGTGGTGCCATTGGAGGCGGCTTCGGCGGTGGTATTGGCGGTGGTATTGGT GGTGGTTTTGGTGGTGAGCTATCCTGA |
Transcript | >Ophun1|2793 ATGAAGGGAGCCGCCGTCATCACCGTCCTCGCCGCTAACCTCACCCTCGCCCAACCCACCGACCCACTCGCAACC GCCAAGCTTCAAGCACGAGACCCCAGCGGTGTCGCGGGCGGCATCGGCGGCGGCATCGGTGGCGGTATCGGAGGC GGCCTTGGAGCTGGCGTTCCCAACTTCCTGCGGAGTAGGCAAAACAACCGGCCGATCGGCGGTGGCATCGGCGGT GGCCTTGGTGGCGGCATTGGCGGTGGCATTGGTTCGATGAAAAAGGTTCGGCGAAACAAGCGGCCTGCTCAGCAG CGTGGTGGCGGCATCGGAGGCGGTACGGGAGGTGGCATTGGAGCTGCCGCCCCCAAGATCCGGCGGCGCAAGACT CCCATCGGCTTCGGCCCTGGAACCATCGGAGGTGGCATCAACGGTGGTATCCGGCGTGGTAGCGGAGGTGGCATC AACGGTGCTATCCGGAGTGCTTCCATCTCAAGGGTCCTGCGGAGGAAGTCCTCCGGAGCCGCCTCTCGCGGTCTT GGAGGGGGAATTGGAGGCGGTATTGGAGGTGGTATTGGAGCTTCCGTTCCTAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCC GGAGTTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGCATTGGAGGGGGCATTGGTGGTGGTGTTGGAGCTTCTGTTCCCAACTTT CAGCGAAGCAAGTCTCCTGGAGCTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGTATCGGTGGTGGTATCGGAGGAGGCATCGGA GGGGGCATCGGTGGTGGTGTTGGAGCTTCTGTTCCTAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCCGGAGCTGCTTCTGGG CTAGGAGGAGTTGCCGGCGTGCAGAGAGACAGACAGGCTGCTGGGGCTGCTGCTGGGCTTGGTGGCGGCATCGGT GGCGGCATCGGTGGCGGCATCGGCGGAGGCATTGGTGGTGGCATTGGAGGAGGTGTTGGGGTACCTGGCGTCCAG AGGAACAAGCAGTCTGCTGGGGCTTCTTCTAGAGCCATCGGCGGTGGTTTCGGCGGTGGAATTGGAGGGGGGATT GGTGGTGGTGTTGGTGCTCCTGGCGTCCAGCGAAACACGCAGGTTCCTTCTGGACTCGGAGGGGACATCGGAGGA GGTATTGGCGGTGGCATCGGAGGGGGCATCGGAGGGGGCTTTGGCGCCTCTGGCGTACAGAGAAACAAGCAGTCT GCCGGAGCTTATTCTCAAGCTATTGGCGGTGGTTTCGGCGGTGGTATCGGAGGTGGCATTGGCGGTGGTGTTCCC GCTTCTGGCGTCCAGCGAAACACGCAGGCTCCTTCTGGCATTGGCGGTGGTATTGGCGGTGGCATTGGAGGTGGC ATTGGAGGTGGTGTTGGAGGTGGTGTTGGCGCTCCTGGCCACCAGCGCAATAAGCAGCCTGCCGGATCTGCTTCT GGAGGTGGTCTCGGAGGCGGCATCGGAGGCGGCATCGGTGGTGGTGTTGGCGGTTCCGTCCCCAACTTCAACTTC CGCCGACATGAACAAGAGGGCGAGCTCAACGGCGATGACAGCGATGACCTTGAAGCTTCCGAGGCCAACTTTCCC CTGTATATTCGGACTGCAGGTGGTGCTATCGGTGGCGGCTTCGGCGGTGGTGTTGGCGGCGGTGTTGGCGGTTCG GTTCCCAACTTCAATCTCCGTCGGCATGAGGAGGAGCAGTTCAGCCCCGACGACGTCGAAGCTTTCGAGGACAGC TTCCCTCTGGATGCTCGGGCTGCAGGTGGTGCCATTGGAGGCGGCTTCGGCGGTGGTATTGGCGGTGGTATTGGT GGTGGTTTTGGTGGTGAGCTATCCTGA |
Gene | >Ophun1|2793 ATGAAGGGAGCCGCCGTCATCACCGTCCTCGCCGCTAACCTCACCCTCGCCCAACCCACCGACCCACTCGCAACC GCCAAGCTTCAAGCACGAGACCCCAGCGGTGTCGCGGGCGGCATCGGCGGCGGCATCGGTGGCGGTATCGGAGGC GGCCTTGGAGGTGAGCGTCTTGACATGCCGATGGCTAGTCGCTTGCTGACAACTACAGCTGGCGTTCCCAACTTC CTGCGGAGTAGGCAAAACAACCGGCCGATCGGCGGTGGCATCGGCGGTGGCCTTGGTGGCGGCATTGGCGGTGGC ATTGGTGAGCGGTCTCGAATATCGATTGCAATGGACTTTGTTGACATCCACCAGGTTCGATGAAAAAGGTTCGGC GAAACAAGCGGCCTGCTCAGCAGCGTGGTGGCGGCATCGGAGGCGGTACGGGAGGTGGCATTGGAGGTGAGCATC TCTTGATACTGGTTGCGAGACGAACCTGCTGACAGCCACAGCTGCCGCCCCCAAGATCCGGCGGCGCAAGACTCC CATCGGCTTCGGCCCTGGAACCATCGGAGGTGGCATCAACGGTGGTATCCGGCGTGGTAGCGGAGGTGGCATCAA CGGTGCTATCCGGAGTGGTATCGGAGGGGGCATGGGTAGGAGACTTCAAACACCTCGATGTAGACCTTGTTGACA TTCGCCAGCTTCCATCTCAAGGGTCCTGCGGAGGAAGTCCTCCGGAGCCGCCTCTCGCGGTCTTGGAGGGGGAAT TGGAGGCGGTATTGGAGGTGGTATTGGAGGTGAGCTCTTCGAGACGGCCATCTTGGATCTTTGCTGACAGCTTCT AGCTTCCGTTCCTAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCCGGAGTTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGCATTGGAGGGGG CATTGGTGGTGGTGTTGGAGGTGAGCTGTTCGAGACGGCCATCTTGGATCTTTGCTGACAGCCTCCAGCTTCTGT TCCCAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCTGGAGCTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGTATCGGTGGTGGTATCGGAGG AGGCATCGGAGGGGGCATCGGTGGTGGTGTTGGAGGTGAGCTCTTCGAGACGGCCATCTTGGATCTTTACTGATA GCCTCCAGCTTCTGTTCCTAACTTTCAGCGAAGCAAGTCTCCCGGAGCTGCTTCTGGGCTAGGAGGAGGTATCGG AGGGGGCATCGGAGGGGGCATTGGTGGTGGCGTTGGCGGTAAGCATCCCGGAGATCTCCCAGGCCTTGTGCTGAT AAATTCTAGTTGCCGGCGTGCAGAGAGACAGACAGGCTGCTGGGGCTGCTGCTGGGCTTGGTGGCGGCATCGGTG GCGGCATCGGTGGCGGCATCGGCGGAGGCATTGGTGGTGGCATTGGAGGAGGTGTTGGGGGTAGGCCGTCTCGAG ATCAGATCATCTTTCAGGCCTTTTGCTAACAACATCTAGTACCTGGCGTCCAGAGGAACAAGCAGTCTGCTGGGG CTTCTTCTAGAGCCATCGGCGGTGGTTTCGGCGGTGGAATTGGAGGGGGGATTGGTGGTGGTGTTGGTGGTAAGT CGTCCGAGATGATGGTCGGACTTGTGCTCATATCTTCTAGCTCCTGGCGTCCAGCGAAACACGCAGGTTCCTTCT GGACTCGGAGGGGACATCGGAGGAGGTATTGGCGGTGGCATCGGAGGGGGCATCGGAGGGGGCTTTGGCGGTAAG TCGTCTGAGTTGATTGTCGGGCTTGTGCTGATGTCTTATAGCCTCTGGCGTACAGAGAAACAAGCAGTCTGCCGG AGCTTATTCTCAAGCTATTGGCGGTGGTTTCGGCGGTGGTATCGGAGGTGGCATTGGCGGTGGTGTTCCCGGTAA GGCGTCCCGACGTGATTCCCTTGAGTCCTGTGTTGATATCTTCTAGCTTCTGGCGTCCAGCGAAACACGCAGGCT CCTTCTGGCATTGGCGGTGGTATTGGCGGTGGCATTGGAGGTGGCATTGGAGGTGGTGTTGGAGGTGGTGTTGGC GGTAAGCCCCTGAGATGGATCTCTTCGACCTTTCATGTGCTAACAACCTCTAGCTCCTGGCCACCAGCGCAATAA GCAGCCTGCCGGATCTGCTTCTGGAGGTGGTCTCGGAGGCGGCATCGGAGGCGGCATCGGTGGTGGTGTTGGCGG TAGGCTATTCAAGATGGATCCAGCATGAATCGTGCTGACAACGTCTAGGTTCCGTCCCCAACTTCAACTTCCGCC GACATGAACAAGAGGGCGAGCTCAACGGCGATGACAGCGATGACCTTGAAGGTGAGTCCTGAGATGGCATGCCGT TCGACCTTTGCTGACGATCCCTAGCTTCCGAGGCCAACTTTCCCCTGTATATTCGGACTGCAGGTGGTGCTATCG GTGGCGGCTTCGGCGGTGGTGTTGGCGGCGGTGTTGGCGGTGAGTTTCGAGATGGTTTCTAACATGAACCATGCT GACAATATCTAGGTTCGGTTCCCAACTTCAATCTCCGTCGGCATGAGGAGGAGCAGTTCAGCCCCGACGACGTCG AAGGTGAGCTCGACATGACTTGCAATTCGACCTTTGCTGACGATGACTAGCTTTCGAGGACAGCTTCCCTCTGGA TGCTCGGGCTGCAGGTGGTGCCATTGGAGGCGGCTTCGGCGGTGGTATTGGCGGTGGTATTGGTGGTGGTTTTGG TGGTGAGCTATCCTGA |