Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein IDOphun1|1898
Gene name
LocationContig_185:19759..20894
Strand-
Gene length (bp)1135
Transcript length (bp)1083
Coding sequence length (bp)1083
Protein length (aa) 361

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PFAM Domains

(None)

Swissprot hits

(None)

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]
SignalP signal predicted Location
(based on Ymax)
D score
(significance: > 0.45)
Yes 1 - 16 0.45

Transmembrane Domains

Domain # Start End Length
1 337 359 22

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

No expression data available for this genome

Sequences

Type of sequenceSequence
Locus Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein >Ophun1|1898
MRFITVAAMAGSALAHYPTDYENNSPSYGDSPSYGNYPPPQGGNYPPAQSYPMPQPQVSTAYTTNLVTVTACPPS
VPNCPVKSMTSSVITSVQAVPTTSAYGIQTSSQAVPMTTSTVYSTKVHTITSCGPTVTNCPAHSTVVSTETVAVS
TTVCPVVPTAGPPAPPAPVYTPPVVSSAPQPKYPISSAPAPVPSAPVHQYPPPAPMPVYPAPSSPAVSSAEVPVP
KNPIYNTMPAVSSTTLSPQVSQPAVPQVPAVPQAPEAPKPMPSCPSGMTSGYPGGPCVPTTSAPVGTGSVPSYNP
PAASSPAYPPVHGGNNQTIPQPGGNPSQPGANKPPVTAGAASLTVPAFAAVAGLLAVVLA*
Coding >Ophun1|1898
ATGCGTTTCATCACCGTGGCCGCCATGGCCGGTTCGGCGCTGGCTCACTACCCTACCGACTATGAGAACAACTCG
CCCAGCTACGGCGACTCGCCCAGCTATGGCAACTACCCTCCTCCTCAGGGGGGCAACTACCCCCCTGCTCAGAGC
TATCCCATGCCCCAGCCTCAGGTGTCGACGGCTTACACCACCAACCTGGTCACCGTCACGGCTTGCCCGCCCTCG
GTCCCCAACTGCCCGGTCAAGTCCATGACCAGCAGCGTCATCACCAGTGTCCAGGCCGTCCCCACCACCAGCGCC
TATGGCATCCAGACCAGCTCGCAGGCCGTCCCCATGACGACGTCGACCGTCTACTCGACCAAGGTTCACACCATC
ACGTCTTGCGGTCCTACCGTCACCAACTGCCCGGCTCACAGCACCGTCGTGTCTACTGAGACCGTCGCCGTCTCT
ACCACGGTCTGCCCTGTTGTCCCCACTGCTGGCCCTCCCGCTCCCCCGGCTCCCGTCTACACGCCTCCGGTCGTT
AGCTCGGCCCCGCAGCCCAAGTACCCCATCAGCTCGGCTCCGGCTCCGGTCCCTTCGGCTCCGGTCCACCAGTAC
CCGCCCCCTGCTCCGATGCCCGTCTACCCGGCCCCGAGCAGCCCTGCCGTGTCGTCGGCTGAGGTCCCGGTTCCC
AAGAACCCGATCTACAACACGATGCCCGCCGTCAGCAGCACCACCCTGTCTCCCCAGGTCAGCCAGCCCGCCGTT
CCTCAGGTCCCTGCCGTTCCCCAGGCCCCCGAGGCTCCCAAGCCGATGCCCTCGTGCCCCTCTGGCATGACCAGC
GGATACCCTGGTGGCCCCTGTGTCCCCACGACGTCTGCTCCTGTTGGCACCGGCTCTGTTCCCTCCTACAACCCG
CCTGCTGCGTCTTCTCCTGCCTACCCCCCTGTCCACGGTGGCAACAACCAGACCATCCCTCAGCCTGGTGGCAAC
CCCAGCCAGCCTGGTGCCAACAAGCCCCCGGTCACGGCCGGCGCTGCCTCCCTGACGGTCCCGGCCTTTGCCGCG
GTGGCCGGTCTGCTCGCTGTTGTTCTTGCTTAG
Transcript >Ophun1|1898
ATGCGTTTCATCACCGTGGCCGCCATGGCCGGTTCGGCGCTGGCTCACTACCCTACCGACTATGAGAACAACTCG
CCCAGCTACGGCGACTCGCCCAGCTATGGCAACTACCCTCCTCCTCAGGGGGGCAACTACCCCCCTGCTCAGAGC
TATCCCATGCCCCAGCCTCAGGTGTCGACGGCTTACACCACCAACCTGGTCACCGTCACGGCTTGCCCGCCCTCG
GTCCCCAACTGCCCGGTCAAGTCCATGACCAGCAGCGTCATCACCAGTGTCCAGGCCGTCCCCACCACCAGCGCC
TATGGCATCCAGACCAGCTCGCAGGCCGTCCCCATGACGACGTCGACCGTCTACTCGACCAAGGTTCACACCATC
ACGTCTTGCGGTCCTACCGTCACCAACTGCCCGGCTCACAGCACCGTCGTGTCTACTGAGACCGTCGCCGTCTCT
ACCACGGTCTGCCCTGTTGTCCCCACTGCTGGCCCTCCCGCTCCCCCGGCTCCCGTCTACACGCCTCCGGTCGTT
AGCTCGGCCCCGCAGCCCAAGTACCCCATCAGCTCGGCTCCGGCTCCGGTCCCTTCGGCTCCGGTCCACCAGTAC
CCGCCCCCTGCTCCGATGCCCGTCTACCCGGCCCCGAGCAGCCCTGCCGTGTCGTCGGCTGAGGTCCCGGTTCCC
AAGAACCCGATCTACAACACGATGCCCGCCGTCAGCAGCACCACCCTGTCTCCCCAGGTCAGCCAGCCCGCCGTT
CCTCAGGTCCCTGCCGTTCCCCAGGCCCCCGAGGCTCCCAAGCCGATGCCCTCGTGCCCCTCTGGCATGACCAGC
GGATACCCTGGTGGCCCCTGTGTCCCCACGACGTCTGCTCCTGTTGGCACCGGCTCTGTTCCCTCCTACAACCCG
CCTGCTGCGTCTTCTCCTGCCTACCCCCCTGTCCACGGTGGCAACAACCAGACCATCCCTCAGCCTGGTGGCAAC
CCCAGCCAGCCTGGTGCCAACAAGCCCCCGGTCACGGCCGGCGCTGCCTCCCTGACGGTCCCGGCCTTTGCCGCG
GTGGCCGGTCTGCTCGCTGTTGTTCTTGCTTAG
Gene >Ophun1|1898
ATGCGTTTCATCACCGTGGCCGCCATGGCCGGTTCGGCGCTGGCTCACTACCCTACCGACTATGAGAACAACTCG
CCCAGCTACGGCGACTCGCCCAGCTATGGCAACTACCCTCCTCCTCAGGGGGGCAACTACCCCCCTGCTCAGAGC
TATCCCATGCCCCAGCCTCAGGTGTCGACGGCTTACACCACCAACCTGGTCACCGTCACGGCTTGCCCGCCCTCG
GTCCCCAACTGCCCGGTCAAGTCCATGACCAGCAGCGTCATCACCAGTGTCCAGGCCGTCCCCACCACCAGCGCC
TATGGCATCCAGACCAGCTCGCAGGCCGTCCCCATGACGACGTCGACCGTCTACTCGACCAAGGTTCACACCATC
ACGTCTTGCGGTCCTACCGTCACCAACTGCCCGGCTCACAGCACCGTCGTGTCTACTGAGACCGTCGCCGTCTCT
ACCACGGTCTGCCCTGTTGTCCCCACTGCTGGCCCTCCCGCTCCCCCGGCTCCCGTCTACACGCCTCCGGTCGTT
AGCTCGGCCCCGCAGCCCAAGTACCCCATCAGCTCGGCTCCGGCTCCGGTCCCTTCGGCTCCGGTCCACCAGTAC
CCGCCCCCTGCTCCGATGCCCGTCTACCCGGCCCCGAGCAGCCCTGCCGTGTCGTCGGCTGAGGTCCCGGTTCCC
AAGAACCCGATCTACAACACGATGCCCGCCGTCAGCAGCACCACCCTGTCTCCCCAGGTCAGCCAGCCCGCCGTT
CCTCAGGTCCCTGCCGTTCCCCAGGCCCCCGAGGCTCCCAAGCCGATGCCCTCGTGCCCCTCTGGCATGACCAGC
GGATACCCTGGTGGCCCCTGTGTCCCCACGACGTCTGCTCCTGTTGGCACCGGCTCTGTTCCCTCCTACAACCCG
CCTGCTGCGTCTTCTCCTGCCTACCCCCCTGTCCACGGTGGCAACAACCAGACCATCCCGTGAGTATTCCTCTTC
ACCCGTAGTCGAGAGCAGCTACTGACAGCACAATAGTCAGCCTGGTGGCAACCCCAGCCAGCCTGGTGCCAACAA
GCCCCCGGTCACGGCCGGCGCTGCCTCCCTGACGGTCCCGGCCTTTGCCGCGGTGGCCGGTCTGCTCGCTGTTGT
TCTTGCTTAG

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