Protein ID | Ophcf2|05048 |
Gene name | |
Location | scaffold_05:2367052..2368198 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 1146 |
Transcript length (bp) | 1146 |
Coding sequence length (bp) | 1146 |
Protein length (aa) | 382 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 32 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 10 | 27 | 17 |
2 | 145 | 167 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ophcf2|05048 MLLPRDSPSAFASTLTTTIIVVSSFGSRTMAQQMASSDPPPARTPQGKAPSPTPDQTTPAPTPTSEDATTTTTTT TPSSTPDATSDSGLTANPTITRGPQATAGGELSGLPTLTRNIIPTYPPPAVPPTRDAPFMRHSTLPEGTVFIAVG AFLGLLGLAILVYRAIVSLLLHRSVKRAAMAQHMSNSKAGFPAPPAPFYKYTDQESTMSLSAAGRGARRAARGPV SSANPSHSNLFFSPTAVNANAGSRASSLLPSGFYGAGTAPGSSAAIHANSISLHNLRPDSRGHYTNGSRHTLTGT PPDSPQYHPRRDAAAAAAASASSLHINPGSSSARRAPSAYLEDLLADDAVSLPPPPPPMQPSELPGSSVYGERTD GGHSRI* |
Coding | >Ophcf2|05048 ATGTTGCTCCCGCGCGACTCACCCTCGGCTTTTGCCTCGACTCTCACCACCACCATCATCGTCGTCTCTTCCTTC GGCTCTCGAACCATGGCTCAGCAAATGGCCAGTTCCGATCCACCGCCAGCCCGCACTCCGCAAGGCAAGGCGCCC TCTCCGACGCCAGACCAGACGACGCCCGCGCCTACGCCTACCTCGGAAGATGCGACGACGACGACGACGACGACG ACGCCCTCGTCTACCCCCGACGCGACTTCAGATTCCGGTCTGACGGCCAACCCTACCATCACCAGAGGTCCACAG GCAACGGCTGGTGGCGAGCTCAGCGGCCTCCCTACTCTCACGAGAAACATCATCCCGACTTATCCCCCTCCAGCC GTGCCTCCCACCCGCGACGCCCCCTTCATGCGCCATTCAACCCTTCCAGAAGGCACCGTCTTCATCGCCGTCGGT GCTTTCCTCGGCCTCCTCGGTCTCGCCATCCTCGTTTATCGCGCCATTGTCAGTCTCCTCCTCCACCGCTCCGTC AAGCGCGCCGCCATGGCCCAGCACATGTCCAACTCCAAGGCTGGCTTCCCCGCGCCCCCGGCCCCTTTCTACAAG TACACCGATCAGGAGTCCACCATGTCGCTCTCCGCCGCCGGACGCGGAGCCCGAAGAGCCGCTCGAGGACCCGTC TCCTCCGCCAACCCAAGCCACTCCAACCTCTTCTTCTCCCCCACTGCCGTCAACGCCAACGCCGGCTCCCGCGCC TCTTCACTCCTGCCCTCGGGCTTCTACGGCGCAGGCACGGCCCCTGGCTCCTCGGCCGCCATCCACGCAAACTCC ATCAGCCTGCACAACCTCCGGCCCGACTCGCGCGGCCACTACACCAACGGCTCCCGTCACACCCTCACCGGCACA CCGCCCGACTCGCCCCAGTATCACCCCCGGAGAGACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCATCCTCCTTGCAC ATCAACCCGGGCTCCTCGTCGGCCAGGCGAGCTCCCAGCGCCTATCTCGAGGACCTACTGGCCGACGACGCCGTC TCCCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCCATGCAGCCGTCAGAGCTTCCGGGCAGCTCCGTCTACGGCGAGAGGACCGAC GGCGGCCACAGCCGCATCTGA |
Transcript | >Ophcf2|05048 ATGTTGCTCCCGCGCGACTCACCCTCGGCTTTTGCCTCGACTCTCACCACCACCATCATCGTCGTCTCTTCCTTC GGCTCTCGAACCATGGCTCAGCAAATGGCCAGTTCCGATCCACCGCCAGCCCGCACTCCGCAAGGCAAGGCGCCC TCTCCGACGCCAGACCAGACGACGCCCGCGCCTACGCCTACCTCGGAAGATGCGACGACGACGACGACGACGACG ACGCCCTCGTCTACCCCCGACGCGACTTCAGATTCCGGTCTGACGGCCAACCCTACCATCACCAGAGGTCCACAG GCAACGGCTGGTGGCGAGCTCAGCGGCCTCCCTACTCTCACGAGAAACATCATCCCGACTTATCCCCCTCCAGCC GTGCCTCCCACCCGCGACGCCCCCTTCATGCGCCATTCAACCCTTCCAGAAGGCACCGTCTTCATCGCCGTCGGT GCTTTCCTCGGCCTCCTCGGTCTCGCCATCCTCGTTTATCGCGCCATTGTCAGTCTCCTCCTCCACCGCTCCGTC AAGCGCGCCGCCATGGCCCAGCACATGTCCAACTCCAAGGCTGGCTTCCCCGCGCCCCCGGCCCCTTTCTACAAG TACACCGATCAGGAGTCCACCATGTCGCTCTCCGCCGCCGGACGCGGAGCCCGAAGAGCCGCTCGAGGACCCGTC TCCTCCGCCAACCCAAGCCACTCCAACCTCTTCTTCTCCCCCACTGCCGTCAACGCCAACGCCGGCTCCCGCGCC TCTTCACTCCTGCCCTCGGGCTTCTACGGCGCAGGCACGGCCCCTGGCTCCTCGGCCGCCATCCACGCAAACTCC ATCAGCCTGCACAACCTCCGGCCCGACTCGCGCGGCCACTACACCAACGGCTCCCGTCACACCCTCACCGGCACA CCGCCCGACTCGCCCCAGTATCACCCCCGGAGAGACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCATCCTCCTTGCAC ATCAACCCGGGCTCCTCGTCGGCCAGGCGAGCTCCCAGCGCCTATCTCGAGGACCTACTGGCCGACGACGCCGTC TCCCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCCATGCAGCCGTCAGAGCTTCCGGGCAGCTCCGTCTACGGCGAGAGGACCGAC GGCGGCCACAGCCGCATCTGA |
Gene | >Ophcf2|05048 ATGTTGCTCCCGCGCGACTCACCCTCGGCTTTTGCCTCGACTCTCACCACCACCATCATCGTCGTCTCTTCCTTC GGCTCTCGAACCATGGCTCAGCAAATGGCCAGTTCCGATCCACCGCCAGCCCGCACTCCGCAAGGCAAGGCGCCC TCTCCGACGCCAGACCAGACGACGCCCGCGCCTACGCCTACCTCGGAAGATGCGACGACGACGACGACGACGACG ACGCCCTCGTCTACCCCCGACGCGACTTCAGATTCCGGTCTGACGGCCAACCCTACCATCACCAGAGGTCCACAG GCAACGGCTGGTGGCGAGCTCAGCGGCCTCCCTACTCTCACGAGAAACATCATCCCGACTTATCCCCCTCCAGCC GTGCCTCCCACCCGCGACGCCCCCTTCATGCGCCATTCAACCCTTCCAGAAGGCACCGTCTTCATCGCCGTCGGT GCTTTCCTCGGCCTCCTCGGTCTCGCCATCCTCGTTTATCGCGCCATTGTCAGTCTCCTCCTCCACCGCTCCGTC AAGCGCGCCGCCATGGCCCAGCACATGTCCAACTCCAAGGCTGGCTTCCCCGCGCCCCCGGCCCCTTTCTACAAG TACACCGATCAGGAGTCCACCATGTCGCTCTCCGCCGCCGGACGCGGAGCCCGAAGAGCCGCTCGAGGACCCGTC TCCTCCGCCAACCCAAGCCACTCCAACCTCTTCTTCTCCCCCACTGCCGTCAACGCCAACGCCGGCTCCCGCGCC TCTTCACTCCTGCCCTCGGGCTTCTACGGCGCAGGCACGGCCCCTGGCTCCTCGGCCGCCATCCACGCAAACTCC ATCAGCCTGCACAACCTCCGGCCCGACTCGCGCGGCCACTACACCAACGGCTCCCGTCACACCCTCACCGGCACA CCGCCCGACTCGCCCCAGTATCACCCCCGGAGAGACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCATCCTCCTTGCAC ATCAACCCGGGCTCCTCGTCGGCCAGGCGAGCTCCCAGCGCCTATCTCGAGGACCTACTGGCCGACGACGCCGTC TCCCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCCATGCAGCCGTCAGAGCTTCCGGGCAGCTCCGTCTACGGCGAGAGGACCGAC GGCGGCCACAGCCGCATCTGA |