Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein ID	OphauG2\|1877
Gene name
Location	Contig_160:1304..2887
Strand	-
Gene length (bp)	1583
Transcript length (bp)	426
Coding sequence length (bp)	426
Protein length (aa)	142

PFAM Domains

(None)

Swissprot hits

(None)

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]

SignalP signal predicted	Location (based on Ymax)	D score (significance: > 0.45)
No	1 - 21	0.45

Transmembrane Domains

Domain #	Start	End	Length
1	75	97	22

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

No expression data available for this genome

Sequences

Type of sequence	Sequence
Locus	Download genbank file of locus The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein	>OphauG2\|1877 MARHASDQVLQAAWPHVVFSHQGSREAYAIAADADYWQALDWLYDCKPIAAAQWTILPREADYHVMAAATTTDTV IATATVVATATVVATAGVIATATVVATATVAHATATATATAPPYHTSQILVAFCKRQVSTLMGKQS*
Coding	>OphauG2\|1877 ATGGCTCGACATGCGTCTGACCAAGTGCTACAAGCTGCCTGGCCCCACGTTGTCTTCTCGCACCAAGGAAGTCGA GAAGCTTATGCCATTGCGGCCGATGCTGACTATTGGCAGGCCCTTGACTGGCTATACGACTGCAAGCCTATTGCC GCTGCTCAATGGACGATTTTGCCGCGGGAAGCTGATTACCATGTTATGGCTGCTGCTACGACTACTGATACTGTT ATTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTACTGCTGGTGTTATTGCTACTGCTACTGTTGTT GCTACTGCTACTGTTGCACATGCTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCTCCTCCATACCATACGAGCCAAATATTG GTTGCCTTTTGCAAGCGCCAAGTGTCCACCTTGATGGGCAAGCAAAGTTGA
Transcript	>OphauG2\|1877 ATGGCTCGACATGCGTCTGACCAAGTGCTACAAGCTGCCTGGCCCCACGTTGTCTTCTCGCACCAAGGAAGTCGA GAAGCTTATGCCATTGCGGCCGATGCTGACTATTGGCAGGCCCTTGACTGGCTATACGACTGCAAGCCTATTGCC GCTGCTCAATGGACGATTTTGCCGCGGGAAGCTGATTACCATGTTATGGCTGCTGCTACGACTACTGATACTGTT ATTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTACTGCTGGTGTTATTGCTACTGCTACTGTTGTT GCTACTGCTACTGTTGCACATGCTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCTCCTCCATACCATACGAGCCAAATATTG GTTGCCTTTTGCAAGCGCCAAGTGTCCACCTTGATGGGCAAGCAAAGTTGA
Gene	>OphauG2\|1877 ATGGCTCGACATGCGTCTGACCAAGTGCTACAAGCTGCCTGGCCCCACGTTGTCTTCTCGCACCAAGGAAGTCGA GAAGCTTATGCCATTGCGGCCGATGCTGACTATTGGCAGGCCCTTGACTGGCTATACGAGTAAGTTTTGCATGTC AAAAAAAAAATTAAAAAAGAAAAGCATAAAATACTCGGTCTGTAATGCATGTAAGACAAAGAGGGGTCTTGATGG ACGCTGAGGCGGCTGTGCTGCGGGTTGTACGAGATCTGTGAAATGTGTCATGCCGACACACAAGACAGCGTCACT TTGAGATGATTTGTAATGGCATGCCTGTCATATGCAGCTGCAAGCCTATTGCCGCTGCTCAATGGACGATTTTGC CGCGGGAAGCTGATTACCATGTTATGGGTGTGACGCTAGCGTGGACGAGTGGTCGCTTAGGACGCAGGAAAAGGA CCAAGTCTCTTGTATACAGAGTAGTCTGATGTGTGTGCAGTCTGATGTGTGCCGTCTGATGTGTTCCATGTTAGA AGTAAAGACTGCTTATGCGCCACCATGTGCTGCCTCTCTAAGCGACCAGCTGGTTGTTTTGAAGAGAGGCTTAGG ATTCATACAATGTGCCCAGGTAAGCGACTCGATGTGCAATGTTACATCAAGGAGACTGGCATGCAGCAGTGCCTC GAGCCGTCAAACTTTGCACAGAGGATGGACAGGGGAACAGGATGACGGGGAGGAGAGACAATGGATGTGCTGAGA CTTGGTGGTTAGTAGGCCAAATGCCGAGGATTGGTGGCCAAGTTGGCGAGCCGGAAAAGGGAAGAGAGGAGAAAA CAAAAGGAGAAAAAAAAAAGCTCAGCCGCCAAAACTAATTAATTCCAGAGATTGACGTCTTGGTAAAAGCCGGTG GATACGGCCAAACGTGGTAGGATGGCCGGGCGGATACTACTTGGTGGATGCTCTGTTCAGTGCATGGTGGTAGCC AGCAAGATTGTAGGCTTTGGCAGGTTAAGAAGACATGAGTAACTCGTGGCAAGGTGTAAAGACAATGGCTGTGAG GATTGCAGAGGATGAATGGCAGAGTCGTGGGTGGCAAAAGCTTTGGACATGGACGAGGCTGGAGGTGATGCCAAG ACGGGCTTGGAGACAGGACGAGGCTGTACAATGGTTGGATGCTGTATCTTTATTGGATCGGAGGACTGACTAGGT TTTACTCTTTGAAAGTCTTTGCGTAGTCAAAGTTGCGGATATTCCTACTATGATTCCTACTACATACGGAGTATG TATTATGTATAATTCCTATACAGCTGCTGCTACTGTTACTGCTGAAGTGTATTCCTACTGCTATTCCTTGAGCCG CTATAGCTGCTGCTACGACTACTGATACTGTTATTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTA CTGCTGGTGTTATTGCTACTGCTACTGTTGTTGCTACTGCTACTGTTGCACATGCTACTGCTACTGCTACTGCTA CTGCTCCTCCATACCATACGAGCCAAATATTGGTTGCCTTTTGCAAGCGCCAAGTGTCCACCTTGATGGGCAAGC AAAGTTGA

© 2022 - Robin Ohm - Utrecht University - The Netherlands

Built with Python Django and Wagtail