Protein ID | Hirsu2|8984 |
Gene name | |
Location | Contig_621:1933..3742 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 1809 |
Transcript length (bp) | 1467 |
Coding sequence length (bp) | 1467 |
Protein length (aa) | 489 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 12 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 184 | 206 | 22 |
2 | 213 | 230 | 17 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Hirsu2|8984 MAGALSQPTAPANGRALTAVEQRPIRRVGAVGGERRCLPLPTSACLGLDVAPSPLAVRSGRSIAPGSSHPFHTET FVAALRSRLLSPPLISSARQGPVQVHARTLMHHPSGYRERQRQRYLRKVRIRRSEYPRLRPPPHLSPGTRLPAQS STPRYLPLKLLLWRRCVRSSVSTPKSGHSPSRLICLSLSFVPQSLSFFIFFYSLRLRLGRRPLLLLLLLLLLLLL LPLPPHHRSLFISRYRSRRCPPLSLSLALSLSLSHTRNTHSLSICLVGLLPLESLCRPPALAATGTSPCSPPPWP EPPPVSRSPHRLPYPRLACLGVQTACQPASQPAGQPAREPASQLPTIVTHRHTLPSRTTGSPTDRIRLPCVSPYL PAPARPQSATLQRGPYLVCSPEHLVPSLPAQHVVGQHLPRRFCPRPRSIPLPRAVRLAPLHLPFSPPNPHLEPAP LPPTGAAGRIGQPTSTRRISTAHFRSPPHFDRPRPRTA* |
Coding | >Hirsu2|8984 ATGGCCGGCGCGCTGAGCCAACCGACGGCGCCGGCCAACGGCCGCGCCTTGACAGCTGTCGAACAGCGGCCGATC CGCCGCGTCGGGGCCGTGGGCGGCGAGCGTCGATGCCTGCCTCTGCCTACCTCTGCCTGCCTCGGCCTGGATGTA GCGCCCAGTCCCCTGGCCGTCCGTTCTGGACGCTCCATCGCTCCCGGTTCCAGTCATCCGTTCCACACGGAAACC TTCGTTGCAGCTCTCCGCTCTCGGCTCTTGTCCCCCCCTCTCATTTCTTCCGCCAGACAAGGTCCCGTCCAGGTA CATGCGCGCACCTTGATGCATCACCCGTCCGGGTACCGTGAGCGACAGAGACAGAGGTACCTGCGCAAGGTACGC ATACGCCGCTCGGAGTACCCACGCCTGCGCCCCCCGCCGCACCTAAGCCCAGGTACCCGGCTACCGGCCCAGTCC TCCACCCCGAGGTACCTACCGCTCAAGCTCCTCCTGTGGCGCCGTTGCGTGCGAAGTAGCGTTTCCACTCCCAAA TCAGGGCACTCACCATCTCGACTCATCTGCCTTTCGCTATCCTTCGTCCCGCAATCTCTCTCCTTCTTTATCTTC TTCTACTCCCTCCGACTCCGACTCGGACGACGTCCTCTTCTACTTCTCCTCCTTCTTCTGCTCCTCCTCCTCCTC CTCCCTCTTCCACCTCACCACCGCTCCCTCTTTATCTCTCGCTATCGCAGCCGACGCTGTCCTCCACTCTCTCTC TCTCTCGCTCTCTCGCTCTCGCTCTCTCACACACGCAACACACACTCTCTGTCTATTTGCCTCGTCGGTCTTCTC CCGCTCGAGTCGCTCTGCCGTCCTCCCGCGCTCGCTGCAACCGGCACCTCTCCCTGCTCACCACCTCCCTGGCCC GAGCCGCCTCCCGTCTCGAGATCGCCGCATCGCCTGCCCTATCCTCGCCTCGCCTGCCTGGGGGTACAGACGGCC TGCCAACCAGCCAGCCAGCCTGCCGGCCAGCCTGCCCGCGAGCCAGCCAGCCAGCTCCCGACGATAGTCACGCAC CGTCACACGCTCCCCTCACGAACAACCGGCTCGCCAACTGACCGAATCCGACTCCCGTGCGTTTCTCCTTATCTG CCGGCTCCTGCTCGCCCGCAAAGTGCGACGCTGCAACGCGGTCCCTATCTCGTCTGCTCGCCTGAGCACCTCGTC CCGTCCCTGCCTGCACAACACGTGGTCGGCCAGCATTTGCCACGACGCTTTTGCCCGCGCCCTCGCTCGATCCCT CTTCCTCGAGCCGTCCGTCTTGCTCCTTTGCATCTCCCCTTTTCCCCCCCAAACCCCCATCTGGAACCTGCTCCT CTGCCGCCGACCGGGGCCGCTGGACGGATCGGGCAGCCCACGTCGACACGGCGAATCTCGACGGCCCATTTCCGG TCGCCGCCGCATTTCGACCGTCCTCGTCCACGCACCGCCTAA |
Transcript | >Hirsu2|8984 ATGGCCGGCGCGCTGAGCCAACCGACGGCGCCGGCCAACGGCCGCGCCTTGACAGCTGTCGAACAGCGGCCGATC CGCCGCGTCGGGGCCGTGGGCGGCGAGCGTCGATGCCTGCCTCTGCCTACCTCTGCCTGCCTCGGCCTGGATGTA GCGCCCAGTCCCCTGGCCGTCCGTTCTGGACGCTCCATCGCTCCCGGTTCCAGTCATCCGTTCCACACGGAAACC TTCGTTGCAGCTCTCCGCTCTCGGCTCTTGTCCCCCCCTCTCATTTCTTCCGCCAGACAAGGTCCCGTCCAGGTA CATGCGCGCACCTTGATGCATCACCCGTCCGGGTACCGTGAGCGACAGAGACAGAGGTACCTGCGCAAGGTACGC ATACGCCGCTCGGAGTACCCACGCCTGCGCCCCCCGCCGCACCTAAGCCCAGGTACCCGGCTACCGGCCCAGTCC TCCACCCCGAGGTACCTACCGCTCAAGCTCCTCCTGTGGCGCCGTTGCGTGCGAAGTAGCGTTTCCACTCCCAAA TCAGGGCACTCACCATCTCGACTCATCTGCCTTTCGCTATCCTTCGTCCCGCAATCTCTCTCCTTCTTTATCTTC TTCTACTCCCTCCGACTCCGACTCGGACGACGTCCTCTTCTACTTCTCCTCCTTCTTCTGCTCCTCCTCCTCCTC CTCCCTCTTCCACCTCACCACCGCTCCCTCTTTATCTCTCGCTATCGCAGCCGACGCTGTCCTCCACTCTCTCTC TCTCTCGCTCTCTCGCTCTCGCTCTCTCACACACGCAACACACACTCTCTGTCTATTTGCCTCGTCGGTCTTCTC CCGCTCGAGTCGCTCTGCCGTCCTCCCGCGCTCGCTGCAACCGGCACCTCTCCCTGCTCACCACCTCCCTGGCCC GAGCCGCCTCCCGTCTCGAGATCGCCGCATCGCCTGCCCTATCCTCGCCTCGCCTGCCTGGGGGTACAGACGGCC TGCCAACCAGCCAGCCAGCCTGCCGGCCAGCCTGCCCGCGAGCCAGCCAGCCAGCTCCCGACGATAGTCACGCAC CGTCACACGCTCCCCTCACGAACAACCGGCTCGCCAACTGACCGAATCCGACTCCCGTGCGTTTCTCCTTATCTG CCGGCTCCTGCTCGCCCGCAAAGTGCGACGCTGCAACGCGGTCCCTATCTCGTCTGCTCGCCTGAGCACCTCGTC CCGTCCCTGCCTGCACAACACGTGGTCGGCCAGCATTTGCCACGACGCTTTTGCCCGCGCCCTCGCTCGATCCCT CTTCCTCGAGCCGTCCGTCTTGCTCCTTTGCATCTCCCCTTTTCCCCCCCAAACCCCCATCTGGAACCTGCTCCT CTGCCGCCGACCGGGGCCGCTGGACGGATCGGGCAGCCCACGTCGACACGGCGAATCTCGACGGCCCATTTCCGG TCGCCGCCGCATTTCGACCGTCCTCGTCCACGCACCGCCTAA |
Gene | >Hirsu2|8984 ATGGCCGGCGCGCTGAGCCAACCGACGGCGCCGGCCAACGGCCGCGCCTTGACAGCTGTCGAACAGCGGCCGATC CGCCGCGTCGGGGCCGTGGGCGGCGAGCGTCGATGCCTGCCTCTGCCTACCTCTGCCTGCCTCGGCCTGGATGTA GCGCCCAGTCCCCTGGCCGTCCGTTCTGGACGCTCCATCGCTCCCGGTTCCAGTCATCCGTTCCACACGGAAACC TTCGTTGCAGCTCTCCGCTCTCGGCTCTTGTCCCCCCCTCGTTAGTCATTACTCGCTCCTCGACGAGCAGGCCGC GAGAGAGAAAGCCAGGCCTCCGGCCGAGGCAGAGACGGACACCGACCTAATTACCCCCCCCCCCCTCTTCCTCTG TGTCTGTGGTTTTTATCATTAATTATTCTTATCATGATTATTTCCCTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTGCGCCCCCC CCCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCGTCGTCCGTCCTAAAACCTCTTTGGTCTATGGCTTGTGACCCCTTTCGACC TCCCTGACCTAGTCATTTCTTCCGCCAGACAAGGTCCCGTCCAGGTACATGCGCGCACCTTGATGCATCACCCGT CCGGGTACCGTGAGCGACAGAGACAGAGGTACCGCTACCCGTCCTGTCCGTCGCTCTCCACGCACGCCATTCGCA CGCCCGTCAACGCATACACACAGGTACCTGCGCAAGGTACGCATACGCCGCTCGGAGTACCCACGCCTGCGCCCC CCGCCGCACCTAAGCCCAGGTACCCGGCTACCGGCCCAGTCCTCCACCCCGAGGTACCTACCGCTCAAGCTCCTC CTGTGGCGCCGTTGCGTGCGAAGTAGCGTTTCCACTCCCAAATCAGGGCACTCACCATCTCGACTCATCTGCCTT TCGCTATCCTTCGTCCCGCAATCTCTCTCCTTCTTTATCTTCTTCTACTCCCTCCGACTCCGACTCGGACGACGT CCTCTTCTACTTCTCCTCCTTCTTCTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCTCTTCCACCTCACCACCGCTCCCTCTTT ATCTCTCGCTATCGCAGCCGACGCTGTCCTCCACTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGCTCTCGCTCTCTCACACA CGCAACACACACTCTCTGTCTATTTGCCTCGTCGGTCTTCTCCCGCTCGAGTCGCTCTGCCGTCCTCCCGCGCTC GCTGCAACCGGCACCTCTCCCTGCTCACCACCTCCCTGGCCCGAGCCGCCTCCCGTCTCGAGATCGCCGCATCGC CTGCCCTATCCTCGCCTCGCCTGCCTGGGGGTACAGACGGCCTGCCAACCAGCCAGCCAGCCTGCCGGCCAGCCT GCCCGCGAGCCAGCCAGCCAGCTCCCGACGATAGTCACGCACCGTCACACGCTCCCCTCACGAACAACCGGCTCG CCAACTGACCGAATCCGACTCCCGTGCGTTTCTCCTTATCTGCCGGCTCCTGCTCGCCCGCAAAGTGCGACGCTG CAACGCGGTCCCTATCTCGTCTGCTCGCCTGAGCACCTCGTCCCGTCCCTGCCTGCACAACACGTGGTCGGCCAG CATTTGCCACGACGCTTTTGCCCGCGCCCTCGCTCGATCCCTCTTCCTCGAGCCGTCCGTCTTGCTCCTTTGCAT CTCCCCTTTTCCCCCCCAAACCCCCATCTGGAACCTGCTCCTCTGCCGCCGACCGGGGCCGCTGGACGGATCGGG CAGCCCACGTCGACACGGCGAATCTCGACGGCCCATTTCCGGTCGCCGCCGCATTTCGACCGTCCTCGTCCACGC ACCGCCTAA |