© 2023 - Robin Ohm - Utrecht University - The Netherlands
Built with Python Django and Wagtail
| Protein ID | Hirsu2|2332 |
| Gene name | |
| Location | Contig_1551:1499..2547 |
| Strand | + |
| Gene length (bp) | 1048 |
| Transcript length (bp) | 744 |
| Coding sequence length (bp) | 744 |
| Protein length (aa) | 248 |
| Localizations | Signals | Cytoplasm | Nucleus | Extracellular | Cell membrane | Mitochondrion | Plastid | Endoplasmic reticulum | Lysosome vacuole | Golgi apparatus | Peroxisome |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cytoplasm | 0.6432 | 0.5173 | 0.2287 | 0.0615 | 0.1866 | 0.1943 | 0.2289 | 0.3738 | 0.357 | 0.022 |
| Orthofinder run ID | 4 |
| Orthogroup | 9037 |
| Change Orthofinder run |
| Species | Protein ID |
|---|---|
| Ophiocordyceps subramaniannii | Hirsu2|2332 (this protein) |
| Type of sequence | Sequence |
|---|---|
| Locus | Download genbank file of locus
Download genbank file of locus (reverse complement)
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
| Protein | >Hirsu2|2332 MTLAPISAPRFVPASAATQDDGRAVPWASLLQPDGEDPRSVKPDGATSACQAKLLQDSRTVSLVYPSLGSAREQG SRSLLPREQGSRSLLPREQASPYLLPEEQASPSLLPGCYLPPAPWYSAVVFGRWSAAPSADSPLRSGRGLSLGRA PLPLTPPSGDMAYWIPLPCPLSLAAPPSYVCGFVGLDLCRRPPSSISPQPPRHARSSSQMPPPPPPPPPPSLPRC RAAHAQAGPADGPIEVAPVRSK* |
| Coding | >Hirsu2|2332 ATGACGCTCGCCCCCATCTCCGCCCCCCGCTTCGTGCCGGCCTCTGCCGCCACGCAGGACGACGGCCGGGCGGTT CCTTGGGCGTCGTTGTTGCAGCCCGATGGGGAAGACCCCCGGTCGGTGAAACCAGATGGCGCCACGTCTGCATGT CAGGCCAAGCTGCTGCAGGATTCCAGGACCGTGTCGTTGGTGTACCCATCACTCGGGTCTGCTCGAGAGCAAGGC TCGCGCTCTCTGCTCCCTCGAGAGCAAGGCTCGCGCTCTCTGCTCCCTCGAGAGCAGGCCTCGCCCTATCTGCTC CCTGAAGAGCAAGCCTCGCCTTCTCTGCTCCCTGGCTGCTACCTACCGCCTGCGCCGTGGTATTCGGCCGTGGTA TTCGGCCGCTGGTCCGCCGCGCCCTCGGCCGATTCTCCCCTTCGGTCGGGGAGGGGCCTTTCTCTTGGCAGAGCT CCCCTGCCTCTGACACCACCCTCCGGCGACATGGCTTATTGGATCCCTCTCCCTTGTCCCCTCTCTTTGGCTGCT CCCCCATCCTACGTGTGCGGCTTCGTCGGTCTTGATCTGTGCCGCCGCCCGCCCTCTTCGATAAGCCCGCAGCCC CCTCGTCATGCCAGATCCAGCTCACAGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCTCCCGCGCTGC CGTGCCGCACACGCCCAGGCCGGTCCAGCGGATGGCCCGATCGAGGTGGCGCCAGTGAGGAGCAAATAA |
| Transcript | >Hirsu2|2332 ATGACGCTCGCCCCCATCTCCGCCCCCCGCTTCGTGCCGGCCTCTGCCGCCACGCAGGACGACGGCCGGGCGGTT CCTTGGGCGTCGTTGTTGCAGCCCGATGGGGAAGACCCCCGGTCGGTGAAACCAGATGGCGCCACGTCTGCATGT CAGGCCAAGCTGCTGCAGGATTCCAGGACCGTGTCGTTGGTGTACCCATCACTCGGGTCTGCTCGAGAGCAAGGC TCGCGCTCTCTGCTCCCTCGAGAGCAAGGCTCGCGCTCTCTGCTCCCTCGAGAGCAGGCCTCGCCCTATCTGCTC CCTGAAGAGCAAGCCTCGCCTTCTCTGCTCCCTGGCTGCTACCTACCGCCTGCGCCGTGGTATTCGGCCGTGGTA TTCGGCCGCTGGTCCGCCGCGCCCTCGGCCGATTCTCCCCTTCGGTCGGGGAGGGGCCTTTCTCTTGGCAGAGCT CCCCTGCCTCTGACACCACCCTCCGGCGACATGGCTTATTGGATCCCTCTCCCTTGTCCCCTCTCTTTGGCTGCT CCCCCATCCTACGTGTGCGGCTTCGTCGGTCTTGATCTGTGCCGCCGCCCGCCCTCTTCGATAAGCCCGCAGCCC CCTCGTCATGCCAGATCCAGCTCACAGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCTCCCGCGCTGC CGTGCCGCACACGCCCAGGCCGGTCCAGCGGATGGCCCGATCGAGGTGGCGCCAGTGAGGAGCAAATAA |
| Gene | >Hirsu2|2332 ATGACGCTCGCCCCCATCTCCGCCCCCCGCTTCGTGCCGGCCTCTGCCGCCACGCAGGACGACGGCCGGGCGGTT CCTTGGGCGTCGTTGTTGCAGCCCGATGGGGAAGACCCCCGGTTCGTTGCCACGGCCCGAGTACACGTGGGCCGC CCTCGCTCGCACCCCCCTCCCCCTTGAAGAGAACGGCCCCCCCCTGGCTCAGGATCTCGGGATGCCGCTCTGCTC GACGGGCGGTCCCCATTCGGCCTCGGGCCTTCTCACCGTGGTTTCAATACATACACCTGGCCTGCAGGTCGGTGA AACCAGATGGCGCCACGTCTGCATGTCAGGCCAAGCTGCTGCAGGATTCCAGGACCGTGTCGTTGGTGTACCCAT CACTCGGGTCTGCTCGAGAGCAAGGCTCGCGCTCTCTGCTCCCTCGAGAGCAAGGCTCGCGCTCTCTGCTCCCTC GAGAGCAGGCCTCGCCCTATCTGCTCCCTGAAGAGCAAGCCTCGCCTTCTCTGCTCCCTGGCTGCTACCTACCGC CTGCGCCGTGGTATTCGGCCGTGGTATTCGGCCGCTGGTCCGCCGCGCCCTCGGCCGATTCTCCCCTTCGGTCGG GGAGGGGCCTTTCTCTTGGCAGAGCTCCCCTGCCTCTGACACCACCCTCCGGCGACATGGCTTATTGGAGTATGT GCCGACCTGTAAACCATGGGTAGGGGAGGGCCCTGCGGGTCATCGGCTGGGGGGCGACGGATCGTCATCGTCATC ACCTACATACAGGCAACGATATAATCAAAGTAGACTCTCTCCCTCAGTCCCTCTCCCTTGTCCCCTCTCTTTGGC TGCTCCCCCATCCTACGTGTGCGGCTTCGTCGGTCTTGATCTGTGCCGCCGCCCGCCCTCTTCGATAAGCCCGCA GCCCCCTCGTCATGCCAGATCCAGCTCACAGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCTCCCGCG CTGCCGTGCCGCACACGCCCAGGCCGGTCCAGCGGATGGCCCGATCGAGGTGGCGCCAGTGAGGAGCAAATAA |