Protein ID | Ani_SJS72_1|g6802.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_052:168276..170079 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 1803 |
Transcript length (bp) | 1683 |
Coding sequence length (bp) | 1683 |
Protein length (aa) | 561 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00083 | Sugar_tr | Sugar (and other) transporter | 5.7E-140 | 57 | 512 |
PF07690 | MFS_1 | Major Facilitator Superfamily | 1.7E-19 | 95 | 456 |
GO Term | Description | Terminal node |
---|---|---|
GO:0055085 | transmembrane transport | Yes |
GO:0016021 | integral component of membrane | Yes |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity | Yes |
GO:0009987 | cellular process | No |
GO:0110165 | cellular anatomical entity | No |
GO:0005215 | transporter activity | No |
GO:0005575 | cellular_component | No |
GO:0031224 | intrinsic component of membrane | No |
GO:0003674 | molecular_function | No |
GO:0006810 | transport | No |
GO:0008150 | biological_process | No |
GO:0051234 | establishment of localization | No |
GO:0051179 | localization | No |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 31 | 0.5 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 54 | 76 | 22 |
2 | 102 | 124 | 22 |
3 | 131 | 150 | 19 |
4 | 154 | 176 | 22 |
5 | 189 | 211 | 22 |
6 | 221 | 243 | 22 |
7 | 308 | 330 | 22 |
8 | 345 | 367 | 22 |
9 | 376 | 398 | 22 |
10 | 413 | 435 | 22 |
11 | 447 | 466 | 19 |
12 | 476 | 498 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS72_1|g6802.t1 MGVSNMMSRFKPQADHSESSTEAPTPARSNSAVEKDNVLLDDSPVKYLTWRSFILGIVVSMGGFIFGYSTGQISG FETMDDFLQRFGQEQADGSYAFSNVRSGLIVGLLCIGTMIGALVAAPIADRMGRKLSICLWSVIHIVGIIIQIAT DSNWVQVAMGRWVAGLGVGALSSIVPMYQSESAPRQVRGAMVSAFQLFVAFGIFISYIINFGTERIQSTASWRIT MGIGFAWPLILAVGSLFLPESPRFAYRQGRIDEAREVMCKLYGVSPNHRVIAQEMKDMKDKLDEEKAAGQAAWHE LFTGPRMLYRTLLGIALQSLQQLTGANFIFYYGNSIFTSTGLSNSYVTQIILGAVNFGMTLPGLYVVEHFGRRNS LMVGAAWMFICFMIWASVGHFALDLADPQATPAAGKAMIIFTCFFIVGFATTWGPIVWAICGEMYPARYRALCIG IATAANWTWNFLISFFTPFISSSIDFAYGYVFAGCCFAAIFVVFFFVNETQGRTLEEVDTMYVLHVKPWQSASWV PPEGIVQDMHRPPSSSKQEGQAEMAEHTEPTELRE* |
Coding | >Ani_SJS72_1|g6802.t1 ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACT CCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTCAAATCTCTGGT TTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTC CGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGAC CGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACC GACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTC CCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCC TTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACC ATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCC TACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTC ATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAG CTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGT GCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATC ATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGT CTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTT GCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCC ACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGT ATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGAC TTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACC CAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTT CCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCT GAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAGTAA |
Transcript | >Ani_SJS72_1|g6802.t1 ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACT CCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTCAAATCTCTGGT TTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTC CGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGAC CGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACC GACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTC CCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCC TTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACC ATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCC TACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTC ATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAG CTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGT GCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATC ATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGT CTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTT GCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCC ACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGT ATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGAC TTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACC CAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTT CCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCT GAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAGTAA |
Gene | >Ani_SJS72_1|g6802.t1 ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACT CCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTATGGTGACATCG ATTCTCTGCAGCTAGTCCCCTCGGTTGCTAACCTTTTCCACCACCAGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGA TGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCAT TGTCGGTCTGGTAAGTGGCATACATCATGGACTGTCCCTAGAGACCAACCCGACTGACAATCTCTTCAGCTGTGT ATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTC TGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGT CGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGT CAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAAC TTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATT CTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGT GAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGAC AAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGT ACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGT ATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACC CTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATT TGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGT AAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATC TGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAAC TTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGC TGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACC ATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCAC CGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAG TAA |