Protein ID | Ani_SJS72_1|g5511.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_038:74083..76982 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2899 |
Transcript length (bp) | 2850 |
Coding sequence length (bp) | 2850 |
Protein length (aa) | 950 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF12708 | Pectate_lyase_3 | Pectate lyase superfamily protein | 1.1E-88 | 71 | 294 |
PF12708 | Pectate_lyase_3 | Pectate lyase superfamily protein | 2.8E-13 | 580 | 654 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
Yes | 1 - 29 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 7 | 29 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS72_1|g5511.t1 MASLHTSIMLFVSYVFLLLSVPVALVNAVPTSGSVDVTSHLAVRASDYWVGTIKRQGSVPFGNTTSSYAIYRNVK DYGAKGDGSTDDTDAINKAISSGGRCGSGCDSSTTTPALVYFPAGTYVVSKPIVQYYYTQLVGDANDLPVLKAAS SFSGMAVIDADPYDSNGSNWYTNQNNFFRAVRNFVIDLTAMPASSGAGIHWQVGQATSLQNIRFEMVKGGSNNKQ QGIFMDNGSGGFMSDLTFNGGNYGAFFGNQQFTTRNLTFNDCNTAIYMNWNWAWTFKSVSINNCQVGLNMSASPS NQTVGSVLMLDSTFTSTPTGVVTAFSSDSIPTGGGALVLENVDFSGATVAIASVNGDTILKGGSVVSNYVQGNVY TPGSTSNSTVSKRSPAVEAEDVHVVTQTITETITACGADYATETAAGSFGTASEAGAEGSTTTAAGGVLPLPSMS VQYPSAGSYSWEGFDSETSQATTATNEASVPAAGTSGGSSPAVPTSQSAGASVVAQGSGSASTASSTSSSGSYFG TSSNSTGQCSTKTVTKTRIETTIPSQAMASSLLTSSGSVFEKSKPLYASYAASSFVSVKSAGAKGDGTTDDTAII QSVLNNATEDQIVYFDHGAYIITDTIKVPKNIKITGEVWPMLMAYGDKFSDQKNPIPMLQVGEAGESGSVEISDL VLETKGPAPGAILVQWNLQAASQGSVGMWDVHARIGGSAGTELQSDTCAKTPSQTTTANEKCIGAFLLFHATQNA SVYLENTWFWTADHDLDASGHGQINIYNGRGVLLESEGPAWLYGTAAEHNQLYNYQVSNAKNVFMGLIQTETPYY QANPNALTPFTPQTSWNDPDFSYCTTDSCRKAWGLRVINSSETYIYGAGLYSFFDNYSQTCLATESCQENIVEVD CSDVHIYGLSTKASTNMITSSSGDGLVPQEGNESTYCSTIALFEQSSSI* |
Coding | >Ani_SJS72_1|g5511.t1 ATGGCGTCTCTCCACACTTCCATCATGTTGTTTGTGTCGTACGTTTTCCTGCTGCTGAGTGTGCCAGTGGCCTTG GTCAATGCTGTCCCTACGTCCGGCTCTGTCGATGTGACATCCCATCTGGCGGTGCGCGCGTCGGACTACTGGGTG GGAACAATCAAGCGTCAGGGCTCTGTGCCCTTTGGCAACACCACCAGCAGCTATGCAATCTACCGCAACGTTAAG GACTACGGTGCCAAGGGTGACGGTTCTACCGATGATACTGATGCTATCAACAAGGCCATCTCCTCTGGTGGCCGC TGCGGTTCCGGTTGCGACTCGTCTACCACCACCCCGGCCCTGGTGTACTTCCCAGCGGGTACCTACGTGGTGTCC AAGCCCATTGTGCAGTACTACTACACCCAGCTGGTCGGTGATGCCAACGACTTGCCTGTCCTCAAGGCTGCTTCG AGCTTCAGCGGCATGGCCGTCATTGATGCCGACCCCTACGACAGCAATGGCTCCAACTGGTACACCAACCAGAAC AACTTCTTCCGTGCTGTCCGCAACTTTGTCATCGATCTGACGGCCATGCCTGCATCCTCGGGCGCGGGTATTCAC TGGCAGGTCGGCCAGGCCACCAGTCTGCAGAACATTCGCTTCGAGATGGTCAAGGGTGGCAGCAACAACAAGCAG CAGGGTATCTTCATGGACAACGGATCGGGTGGTTTTATGTCTGACCTCACCTTCAACGGCGGTAACTACGGTGCC TTCTTCGGTAACCAGCAGTTCACCACCCGCAACCTGACCTTCAACGACTGCAACACGGCCATCTACATGAACTGG AACTGGGCCTGGACTTTCAAGTCGGTGTCGATCAACAACTGCCAGGTCGGCTTGAACATGTCCGCATCGCCGTCC AACCAGACCGTCGGATCTGTCCTGATGCTAGACAGCACATTCACTAGCACTCCTACTGGTGTGGTGACTGCCTTC AGCAGCGACAGCATTCCTACTGGTGGTGGTGCATTGGTCCTCGAAAATGTCGACTTCTCCGGCGCTACGGTGGCC ATTGCTAGTGTGAACGGCGACACCATTCTCAAGGGCGGCTCTGTTGTCTCGAACTACGTGCAGGGCAATGTCTAC ACGCCGGGCAGCACCTCCAACAGCACCGTCAGCAAGCGCTCCCCTGCCGTTGAGGCCGAGGATGTTCATGTGGTC ACCCAGACCATTACCGAGACCATTACAGCCTGCGGTGCCGACTACGCCACTGAAACCGCTGCGGGTTCGTTCGGC ACGGCCTCTGAGGCCGGAGCAGAGGGTTCGACCACTACCGCGGCCGGTGGTGTGCTGCCTTTGCCATCCATGTCT GTGCAGTACCCGTCCGCCGGTAGCTACAGCTGGGAAGGATTTGACAGCGAAACCTCTCAGGCAACCACGGCCACC AACGAGGCTTCTGTCCCTGCCGCCGGAACTTCTGGCGGGTCATCTCCTGCCGTGCCCACTTCCCAGTCGGCCGGT GCCTCTGTTGTTGCCCAGGGCTCTGGCTCTGCGTCCACTGCCTCCAGCACCTCGTCTTCCGGCTCCTACTTTGGT ACTTCCAGCAACTCCACCGGCCAGTGCTCGACCAAGACTGTCACCAAGACTCGTATCGAGACCACTATTCCTTCC CAGGCCATGGCTAGCTCGCTTTTGACTAGCTCTGGTAGTGTGTTCGAGAAGTCCAAGCCTTTGTACGCCTCCTAT GCCGCTTCTTCCTTCGTCAGCGTCAAGTCGGCCGGTGCCAAGGGTGACGGTACCACCGATGACACGGCCATCATC CAGAGCGTTCTGAACAACGCGACCGAGGACCAGATCGTGTACTTCGATCACGGTGCCTACATCATCACTGATACC ATCAAGGTCCCCAAGAACATCAAGATCACTGGTGAGGTGTGGCCCATGCTCATGGCGTATGGCGACAAGTTCTCC GACCAGAAGAACCCCATCCCTATGCTCCAGGTCGGTGAAGCCGGCGAGTCTGGCTCGGTTGAGATCAGCGACCTC GTTCTGGAGACCAAGGGACCCGCTCCTGGTGCCATCCTGGTGCAGTGGAACCTCCAGGCCGCTTCCCAGGGCTCT GTTGGTATGTGGGATGTCCATGCCCGCATTGGTGGCTCTGCCGGCACTGAACTTCAGTCCGATACCTGCGCGAAG ACCCCCAGCCAGACCACCACGGCCAACGAGAAGTGCATTGGCGCTTTCCTCCTCTTCCACGCCACCCAGAACGCC AGCGTCTACCTGGAGAACACCTGGTTCTGGACTGCTGACCACGACCTTGACGCGTCCGGCCACGGGCAGATTAAC ATTTACAACGGTCGCGGTGTCCTCCTCGAGAGTGAGGGACCAGCCTGGCTGTATGGCACGGCTGCCGAGCACAAC CAGCTGTACAACTACCAGGTCTCCAATGCTAAGAACGTTTTCATGGGCCTGATCCAGACCGAGACTCCCTACTAC CAGGCCAACCCCAACGCTCTGACTCCCTTCACCCCGCAGACCTCCTGGAATGACCCCGACTTCTCGTACTGCACC ACGGACTCCTGCCGCAAGGCGTGGGGTCTCCGTGTCATCAACAGCTCCGAGACCTACATCTACGGTGCGGGTCTC TACAGCTTCTTCGACAACTACTCGCAGACATGTCTGGCCACGGAGTCCTGCCAGGAGAACATTGTTGAGGTGGAC TGCTCCGACGTGCACATCTACGGGCTGAGCACCAAGGCCAGCACCAACATGATCACTTCGTCCAGCGGCGATGGC CTTGTCCCGCAAGAGGGCAACGAGAGCACATACTGCTCGACGATCGCTTTGTTCGAGCAGTCCTCCTCTATTTAA |
Transcript | >Ani_SJS72_1|g5511.t1 ATGGCGTCTCTCCACACTTCCATCATGTTGTTTGTGTCGTACGTTTTCCTGCTGCTGAGTGTGCCAGTGGCCTTG GTCAATGCTGTCCCTACGTCCGGCTCTGTCGATGTGACATCCCATCTGGCGGTGCGCGCGTCGGACTACTGGGTG GGAACAATCAAGCGTCAGGGCTCTGTGCCCTTTGGCAACACCACCAGCAGCTATGCAATCTACCGCAACGTTAAG GACTACGGTGCCAAGGGTGACGGTTCTACCGATGATACTGATGCTATCAACAAGGCCATCTCCTCTGGTGGCCGC TGCGGTTCCGGTTGCGACTCGTCTACCACCACCCCGGCCCTGGTGTACTTCCCAGCGGGTACCTACGTGGTGTCC AAGCCCATTGTGCAGTACTACTACACCCAGCTGGTCGGTGATGCCAACGACTTGCCTGTCCTCAAGGCTGCTTCG AGCTTCAGCGGCATGGCCGTCATTGATGCCGACCCCTACGACAGCAATGGCTCCAACTGGTACACCAACCAGAAC AACTTCTTCCGTGCTGTCCGCAACTTTGTCATCGATCTGACGGCCATGCCTGCATCCTCGGGCGCGGGTATTCAC TGGCAGGTCGGCCAGGCCACCAGTCTGCAGAACATTCGCTTCGAGATGGTCAAGGGTGGCAGCAACAACAAGCAG CAGGGTATCTTCATGGACAACGGATCGGGTGGTTTTATGTCTGACCTCACCTTCAACGGCGGTAACTACGGTGCC TTCTTCGGTAACCAGCAGTTCACCACCCGCAACCTGACCTTCAACGACTGCAACACGGCCATCTACATGAACTGG AACTGGGCCTGGACTTTCAAGTCGGTGTCGATCAACAACTGCCAGGTCGGCTTGAACATGTCCGCATCGCCGTCC AACCAGACCGTCGGATCTGTCCTGATGCTAGACAGCACATTCACTAGCACTCCTACTGGTGTGGTGACTGCCTTC AGCAGCGACAGCATTCCTACTGGTGGTGGTGCATTGGTCCTCGAAAATGTCGACTTCTCCGGCGCTACGGTGGCC ATTGCTAGTGTGAACGGCGACACCATTCTCAAGGGCGGCTCTGTTGTCTCGAACTACGTGCAGGGCAATGTCTAC ACGCCGGGCAGCACCTCCAACAGCACCGTCAGCAAGCGCTCCCCTGCCGTTGAGGCCGAGGATGTTCATGTGGTC ACCCAGACCATTACCGAGACCATTACAGCCTGCGGTGCCGACTACGCCACTGAAACCGCTGCGGGTTCGTTCGGC ACGGCCTCTGAGGCCGGAGCAGAGGGTTCGACCACTACCGCGGCCGGTGGTGTGCTGCCTTTGCCATCCATGTCT GTGCAGTACCCGTCCGCCGGTAGCTACAGCTGGGAAGGATTTGACAGCGAAACCTCTCAGGCAACCACGGCCACC AACGAGGCTTCTGTCCCTGCCGCCGGAACTTCTGGCGGGTCATCTCCTGCCGTGCCCACTTCCCAGTCGGCCGGT GCCTCTGTTGTTGCCCAGGGCTCTGGCTCTGCGTCCACTGCCTCCAGCACCTCGTCTTCCGGCTCCTACTTTGGT ACTTCCAGCAACTCCACCGGCCAGTGCTCGACCAAGACTGTCACCAAGACTCGTATCGAGACCACTATTCCTTCC CAGGCCATGGCTAGCTCGCTTTTGACTAGCTCTGGTAGTGTGTTCGAGAAGTCCAAGCCTTTGTACGCCTCCTAT GCCGCTTCTTCCTTCGTCAGCGTCAAGTCGGCCGGTGCCAAGGGTGACGGTACCACCGATGACACGGCCATCATC CAGAGCGTTCTGAACAACGCGACCGAGGACCAGATCGTGTACTTCGATCACGGTGCCTACATCATCACTGATACC ATCAAGGTCCCCAAGAACATCAAGATCACTGGTGAGGTGTGGCCCATGCTCATGGCGTATGGCGACAAGTTCTCC GACCAGAAGAACCCCATCCCTATGCTCCAGGTCGGTGAAGCCGGCGAGTCTGGCTCGGTTGAGATCAGCGACCTC GTTCTGGAGACCAAGGGACCCGCTCCTGGTGCCATCCTGGTGCAGTGGAACCTCCAGGCCGCTTCCCAGGGCTCT GTTGGTATGTGGGATGTCCATGCCCGCATTGGTGGCTCTGCCGGCACTGAACTTCAGTCCGATACCTGCGCGAAG ACCCCCAGCCAGACCACCACGGCCAACGAGAAGTGCATTGGCGCTTTCCTCCTCTTCCACGCCACCCAGAACGCC AGCGTCTACCTGGAGAACACCTGGTTCTGGACTGCTGACCACGACCTTGACGCGTCCGGCCACGGGCAGATTAAC ATTTACAACGGTCGCGGTGTCCTCCTCGAGAGTGAGGGACCAGCCTGGCTGTATGGCACGGCTGCCGAGCACAAC CAGCTGTACAACTACCAGGTCTCCAATGCTAAGAACGTTTTCATGGGCCTGATCCAGACCGAGACTCCCTACTAC CAGGCCAACCCCAACGCTCTGACTCCCTTCACCCCGCAGACCTCCTGGAATGACCCCGACTTCTCGTACTGCACC ACGGACTCCTGCCGCAAGGCGTGGGGTCTCCGTGTCATCAACAGCTCCGAGACCTACATCTACGGTGCGGGTCTC TACAGCTTCTTCGACAACTACTCGCAGACATGTCTGGCCACGGAGTCCTGCCAGGAGAACATTGTTGAGGTGGAC TGCTCCGACGTGCACATCTACGGGCTGAGCACCAAGGCCAGCACCAACATGATCACTTCGTCCAGCGGCGATGGC CTTGTCCCGCAAGAGGGCAACGAGAGCACATACTGCTCGACGATCGCTTTGTTCGAGCAGTCCTCCTCTATTTAA |
Gene | >Ani_SJS72_1|g5511.t1 ATGGCGTCTCTCCACACTTCCATCATGTTGTTTGTGTCGTACGTTTTCCTGCTGCTGAGTGTGCCAGTGGCCTTG GTCAATGCTGTCCCTACGTCCGGCTCTGTCGATGTGACATCCCATCTGGCGGTGCGCGCGTCGGACTACTGGGTG GGAACAATCAAGCGTCAGGGCTCTGTGCCCTTTGGCAACACCACCAGCAGCTATGCAATCTACCGCAACGTTAAG GACTACGGTGCCAAGGGTGAGTCAGACCTCCTTACATGACTGGTATCTGGCGCTGACCCAGACAGGTGACGGTTC TACCGATGATACTGATGCTATCAACAAGGCCATCTCCTCTGGTGGCCGCTGCGGTTCCGGTTGCGACTCGTCTAC CACCACCCCGGCCCTGGTGTACTTCCCAGCGGGTACCTACGTGGTGTCCAAGCCCATTGTGCAGTACTACTACAC CCAGCTGGTCGGTGATGCCAACGACTTGCCTGTCCTCAAGGCTGCTTCGAGCTTCAGCGGCATGGCCGTCATTGA TGCCGACCCCTACGACAGCAATGGCTCCAACTGGTACACCAACCAGAACAACTTCTTCCGTGCTGTCCGCAACTT TGTCATCGATCTGACGGCCATGCCTGCATCCTCGGGCGCGGGTATTCACTGGCAGGTCGGCCAGGCCACCAGTCT GCAGAACATTCGCTTCGAGATGGTCAAGGGTGGCAGCAACAACAAGCAGCAGGGTATCTTCATGGACAACGGATC GGGTGGTTTTATGTCTGACCTCACCTTCAACGGCGGTAACTACGGTGCCTTCTTCGGTAACCAGCAGTTCACCAC CCGCAACCTGACCTTCAACGACTGCAACACGGCCATCTACATGAACTGGAACTGGGCCTGGACTTTCAAGTCGGT GTCGATCAACAACTGCCAGGTCGGCTTGAACATGTCCGCATCGCCGTCCAACCAGACCGTCGGATCTGTCCTGAT GCTAGACAGCACATTCACTAGCACTCCTACTGGTGTGGTGACTGCCTTCAGCAGCGACAGCATTCCTACTGGTGG TGGTGCATTGGTCCTCGAAAATGTCGACTTCTCCGGCGCTACGGTGGCCATTGCTAGTGTGAACGGCGACACCAT TCTCAAGGGCGGCTCTGTTGTCTCGAACTACGTGCAGGGCAATGTCTACACGCCGGGCAGCACCTCCAACAGCAC CGTCAGCAAGCGCTCCCCTGCCGTTGAGGCCGAGGATGTTCATGTGGTCACCCAGACCATTACCGAGACCATTAC AGCCTGCGGTGCCGACTACGCCACTGAAACCGCTGCGGGTTCGTTCGGCACGGCCTCTGAGGCCGGAGCAGAGGG TTCGACCACTACCGCGGCCGGTGGTGTGCTGCCTTTGCCATCCATGTCTGTGCAGTACCCGTCCGCCGGTAGCTA CAGCTGGGAAGGATTTGACAGCGAAACCTCTCAGGCAACCACGGCCACCAACGAGGCTTCTGTCCCTGCCGCCGG AACTTCTGGCGGGTCATCTCCTGCCGTGCCCACTTCCCAGTCGGCCGGTGCCTCTGTTGTTGCCCAGGGCTCTGG CTCTGCGTCCACTGCCTCCAGCACCTCGTCTTCCGGCTCCTACTTTGGTACTTCCAGCAACTCCACCGGCCAGTG CTCGACCAAGACTGTCACCAAGACTCGTATCGAGACCACTATTCCTTCCCAGGCCATGGCTAGCTCGCTTTTGAC TAGCTCTGGTAGTGTGTTCGAGAAGTCCAAGCCTTTGTACGCCTCCTATGCCGCTTCTTCCTTCGTCAGCGTCAA GTCGGCCGGTGCCAAGGGTGACGGTACCACCGATGACACGGCCATCATCCAGAGCGTTCTGAACAACGCGACCGA GGACCAGATCGTGTACTTCGATCACGGTGCCTACATCATCACTGATACCATCAAGGTCCCCAAGAACATCAAGAT CACTGGTGAGGTGTGGCCCATGCTCATGGCGTATGGCGACAAGTTCTCCGACCAGAAGAACCCCATCCCTATGCT CCAGGTCGGTGAAGCCGGCGAGTCTGGCTCGGTTGAGATCAGCGACCTCGTTCTGGAGACCAAGGGACCCGCTCC TGGTGCCATCCTGGTGCAGTGGAACCTCCAGGCCGCTTCCCAGGGCTCTGTTGGTATGTGGGATGTCCATGCCCG CATTGGTGGCTCTGCCGGCACTGAACTTCAGTCCGATACCTGCGCGAAGACCCCCAGCCAGACCACCACGGCCAA CGAGAAGTGCATTGGCGCTTTCCTCCTCTTCCACGCCACCCAGAACGCCAGCGTCTACCTGGAGAACACCTGGTT CTGGACTGCTGACCACGACCTTGACGCGTCCGGCCACGGGCAGATTAACATTTACAACGGTCGCGGTGTCCTCCT CGAGAGTGAGGGACCAGCCTGGCTGTATGGCACGGCTGCCGAGCACAACCAGCTGTACAACTACCAGGTCTCCAA TGCTAAGAACGTTTTCATGGGCCTGATCCAGACCGAGACTCCCTACTACCAGGCCAACCCCAACGCTCTGACTCC CTTCACCCCGCAGACCTCCTGGAATGACCCCGACTTCTCGTACTGCACCACGGACTCCTGCCGCAAGGCGTGGGG TCTCCGTGTCATCAACAGCTCCGAGACCTACATCTACGGTGCGGGTCTCTACAGCTTCTTCGACAACTACTCGCA GACATGTCTGGCCACGGAGTCCTGCCAGGAGAACATTGTTGAGGTGGACTGCTCCGACGTGCACATCTACGGGCT GAGCACCAAGGCCAGCACCAACATGATCACTTCGTCCAGCGGCGATGGCCTTGTCCCGCAAGAGGGCAACGAGAG CACATACTGCTCGACGATCGCTTTGTTCGAGCAGTCCTCCTCTATTTAA |