Protein ID | Ani_SJS72_1|g4520.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_028:118652..119830 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 1178 |
Transcript length (bp) | 912 |
Coding sequence length (bp) | 912 |
Protein length (aa) | 304 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF11911 | DUF3429 | Protein of unknown function (DUF3429) | 6.1E-44 | 100 | 258 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 29 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 104 | 126 | 22 |
2 | 158 | 180 | 22 |
3 | 200 | 222 | 22 |
4 | 237 | 259 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 MLYRTTAARSVLRAISSSNASVARSALSNNVFKAPLTSSARFPARPTTSPSLALAARKPVTTALVRYASTSAKEG EEPDMMAGIKTEAKVIKDTFSLEAVPKEALYLGMAGVIPYVATSLQTVALAYEVKTAALAGDGLIFSGQSAELML HMIEPIQVGYGAVILSFLGAIHWGLEWAGYGGKYGYKRYAAGVIAPAVAWPTLLLPVEYALISQFLAFTFLYYND ARAAASGRAPAWYGMYRFVLTFIVGASIVVSLIGREQIAGTLSTEHTIKDKINALIFLQKKEKEEVEARRRAELE DAE* |
Coding | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCG GCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCCCCC AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGGAAGGC GAGGAGCCCGACATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTAAAGTCATCAAGGACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTC CCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTC GCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGCCTGATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTG CACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTC GAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGG CCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGAC GCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGT GCTAGCATTGTTGTCAGCTTGATCGGCCGTGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGAC AAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCTGAGCTCGAG GATGCTGAGTAA |
Transcript | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCG GCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCCCCC AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGGAAGGC GAGGAGCCCGACATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTAAAGTCATCAAGGACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTC CCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTC GCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGCCTGATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTG CACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTC GAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGG CCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGAC GCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGT GCTAGCATTGTTGTCAGCTTGATCGGCCGTGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGAC AAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCTGAGCTCGAG GATGCTGAGTAA |
Gene | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCG GCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCCCCC AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGGTGAGA TTGAACTGAAGCATACTGAGTACTATAATTGAGTCAATTGCTGATCAAAGAACCACAGGAAGGCGAGGAGCCCGA CATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTGTATGTGTTTTCCATTCTTCCCCAGATATCGCTTCCTCTGCGGGGCA ATCTAGCCTCTCGGCGGCACATCTGGGACTCAATGCGCTAATGAGTCTCTTTCCGATCTATAGAAAGTCATCAAG GACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTCCCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCT ACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTCGCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGCCTGATCTTCTCC GGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTGCACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTGTAAGTAACCCA TGAGCCATCTTGAAACCCTTCAACAATTCCCCCTACCCAAGGAGAACCCCTCAAAAGCTAATCAACTTAAACAAC AACAGATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTCGAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACA AGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGGCCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGA TCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGACGCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCT GGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGTGCTAGCATTGTTGTCAGCTTGATCGGCCGTGAGC AGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGACAAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGG AGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCTGAGCTCGAGGATGCTGAGTAA |