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| Protein ID | Ani_SJS72_1|g4520.t1 |
| Gene name | |
| Location | scaffold_028:118652..119830 |
| Strand | - |
| Gene length (bp) | 1178 |
| Transcript length (bp) | 912 |
| Coding sequence length (bp) | 912 |
| Protein length (aa) | 304 |
| PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
|---|---|---|---|---|---|
| PF11911 | DUF3429 | Protein of unknown function (DUF3429) | 6.1E-44 | 100 | 258 |
| SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
|---|---|---|
| No | 1 - 29 | 0.45 |
| Domain # | Start | End | Length |
|---|---|---|---|
| 1 | 104 | 126 | 22 |
| 2 | 158 | 180 | 22 |
| 3 | 200 | 222 | 22 |
| 4 | 237 | 259 | 22 |
| Type of sequence | Sequence |
|---|---|
| Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
| Protein | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 MLYRTTAARSVLRAISSSNASVARSALSNNVFKAPLTSSARFPARPTTSPSLALAARKPVTTALVRYASTSAKEG EEPDMMAGIKTEAKVIKDTFSLEAVPKEALYLGMAGVIPYVATSLQTVALAYEVKTAALAGDGLIFSGQSAELML HMIEPIQVGYGAVILSFLGAIHWGLEWAGYGGKYGYKRYAAGVIAPAVAWPTLLLPVEYALISQFLAFTFLYYND ARAAASGRAPAWYGMYRFVLTFIVGASIVVSLIGREQIAGTLSTEHTIKDKINALIFLQKKEKEEVEARRRAELE DAE* |
| Coding | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCG GCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCCCCC AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGGAAGGC GAGGAGCCCGACATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTAAAGTCATCAAGGACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTC CCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTC GCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGCCTGATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTG CACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTC GAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGG CCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGAC GCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGT GCTAGCATTGTTGTCAGCTTGATCGGCCGTGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGAC AAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCTGAGCTCGAG GATGCTGAGTAA |
| Transcript | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCG GCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCCCCC AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGGAAGGC GAGGAGCCCGACATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTAAAGTCATCAAGGACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTC CCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTC GCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGCCTGATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTG CACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTC GAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGG CCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGAC GCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGT GCTAGCATTGTTGTCAGCTTGATCGGCCGTGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGAC AAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCTGAGCTCGAG GATGCTGAGTAA |
| Gene | >Ani_SJS72_1|g4520.t1 ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCG GCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCCCCC AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGGTGAGA TTGAACTGAAGCATACTGAGTACTATAATTGAGTCAATTGCTGATCAAAGAACCACAGGAAGGCGAGGAGCCCGA CATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTGTATGTGTTTTCCATTCTTCCCCAGATATCGCTTCCTCTGCGGGGCA ATCTAGCCTCTCGGCGGCACATCTGGGACTCAATGCGCTAATGAGTCTCTTTCCGATCTATAGAAAGTCATCAAG GACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTCCCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCT ACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTCGCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGCCTGATCTTCTCC GGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTGCACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTGTAAGTAACCCA TGAGCCATCTTGAAACCCTTCAACAATTCCCCCTACCCAAGGAGAACCCCTCAAAAGCTAATCAACTTAAACAAC AACAGATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTCGAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACA AGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGGCCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGA TCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGACGCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCT GGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGTGCTAGCATTGTTGTCAGCTTGATCGGCCGTGAGC AGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGACAAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGG AGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCTGAGCTCGAGGATGCTGAGTAA |