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| Protein ID | Ani_SJS72_1|g1299.t1 |
| Gene name | |
| Location | scaffold_006:86393..89256 |
| Strand | - |
| Gene length (bp) | 2863 |
| Transcript length (bp) | 2796 |
| Coding sequence length (bp) | 2796 |
| Protein length (aa) | 932 |
| PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
|---|---|---|---|---|---|
| PF16010 | CDH-cyt | Cytochrome domain of cellobiose dehydrogenase | 8.3E-57 | 28 | 204 |
| PF00732 | GMC_oxred_N | GMC oxidoreductase | 9.0E-33 | 245 | 543 |
| PF05199 | GMC_oxred_C | GMC oxidoreductase | 3.0E-15 | 684 | 755 |
| PF00890 | FAD_binding_2 | FAD binding domain | 6.9E-05 | 246 | 276 |
| PF03486 | HI0933_like | HI0933-like protein | 1.2E-05 | 246 | 277 |
| PF13450 | NAD_binding_8 | NAD(P)-binding Rossmann-like domain | 1.7E-05 | 249 | 276 |
| GO Term | Description | Terminal node |
|---|---|---|
| GO:0050660 | flavin adenine dinucleotide binding | Yes |
| GO:0016614 | oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors | Yes |
| GO:0000166 | nucleotide binding | No |
| GO:0003824 | catalytic activity | No |
| GO:0016491 | oxidoreductase activity | No |
| GO:1901363 | heterocyclic compound binding | No |
| GO:0036094 | small molecule binding | No |
| GO:0003674 | molecular_function | No |
| GO:0043167 | ion binding | No |
| GO:0043168 | anion binding | No |
| GO:1901265 | nucleoside phosphate binding | No |
| GO:0097159 | organic cyclic compound binding | No |
| GO:0005488 | binding | No |
| SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
|---|---|---|
| Yes | 1 - 21 | 0.45 |
| Type of sequence | Sequence |
|---|---|
| Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
| Protein | >Ani_SJS72_1|g1299.t1 MRSVLLSGVAALSYALGVSANAYNTSAYTDSASGIDFQRWCDTDDTGFCFGIALPEDVSTDFIGQLTVPLSSSKG WGGVSMSGSMTNVLLIAAWPDGDSAVGTLREATSYVSPSVYSGDASIEEIPDGTSVNSTYLTYTFLCKGCIIGQP TTFDANSTQYYFGWALSASNPTTPSSASSKMPYHAAGYGGFEVQLANAKSSKYSTWASKAVSTQSTATSASASSS ASASASPSASVAATVSNTTYDYIVVGGGAAGLVAAERLAETKKSVLLIERGVAPTVELGATDSLSWNSSITAYDL PALGTYIQSSDYVSQYLCDDTAGMAGCVLGGGTIVNAMSFIYPQEADFDDKWPTGWKWKDVKAAAERLYARNPGS TLPSADGKRYDQGMYTVLSSFLKGLGWKSVDSQEQPNEKHMVYSYPSWDVGNGIRAGPVRSYLPLVEDADNFHMS LNTKVRRVVRRGGRITGVEVETSSGSVEIINVRAGGKVVLAAGSMSTPRILFNSGIGPSEQIKTVQSGSTGITVP PSAEWINLPVGENLRDHPMFTVTVNTNSNFTHFNTSSAVSDPAAPIRNLYAEGSGVLTQGGHRLQFWTSNVGTDG VTRFYQASCSTTEDGVITMKLYLTHGATSTGVLGIDSTGSTTIETSPYLNTAADKEALTRFLNGLIADMKNSTAG FSIQGSATASSILDKLTAGDHYVGTAKMGVDDGRESNGTSVVDLNTKVYGTENLYIVDGSIHPDLPTGNSQAIIQ IAAEAAVARIIAQGTSATSASASASVSVAASTQAAYASTTSEAAAATETETAAVTSTEAVTASAVPTTGTISSTT GSSSSSSSSSAGSSSESESSTGADDNEGDDDDEEYDCDDEDDEDDSSSGVETSESVTAKVAVATSAAADSGASTT TVWVTSTAWTTTTDMVVATSTSTVTVWPTYA* |
| Coding | >Ani_SJS72_1|g1299.t1 ATGCGTTCCGTTCTGCTTAGTGGCGTGGCCGCCCTGAGCTACGCTTTGGGCGTCTCGGCCAATGCCTACAACACC TCCGCCTATACCGATTCGGCCTCTGGCATCGACTTCCAGAGATGGTGTGATACCGACGATACCGGTTTCTGTTTC GGTATCGCCCTGCCCGAGGATGTCAGCACCGACTTCATCGGTCAGCTGACCGTCCCCCTGTCCAGCTCCAAGGGT TGGGGTGGTGTCAGTATGTCGGGTTCCATGACCAACGTCCTCCTGATTGCCGCCTGGCCCGATGGTGATTCGGCC GTGGGTACTCTGCGTGAGGCCACGTCCTATGTCTCCCCATCTGTCTACAGCGGTGATGCTTCGATCGAGGAGATC CCCGACGGCACCTCCGTCAACAGCACCTACCTGACCTACACCTTCCTGTGCAAGGGCTGCATCATCGGTCAGCCC ACCACCTTCGACGCCAACTCGACCCAGTACTACTTCGGCTGGGCTCTCAGTGCCTCCAACCCCACGACTCCCTCC TCCGCCTCCTCCAAGATGCCCTACCACGCTGCCGGCTATGGTGGTTTCGAGGTGCAGCTGGCCAACGCCAAGTCG TCCAAGTACTCCACCTGGGCTTCCAAGGCTGTCTCGACCCAGTCCACTGCTACTTCTGCTTCCGCCTCCTCCAGT GCCTCCGCATCCGCCTCTCCCTCCGCCAGCGTTGCCGCCACCGTCTCAAACACGACCTACGATTACATTGTTGTC GGTGGTGGTGCTGCTGGTCTGGTTGCCGCTGAGCGCCTGGCCGAGACCAAGAAGAGCGTCCTGCTCATCGAGCGT GGTGTGGCCCCGACCGTCGAGCTGGGTGCTACCGACTCCCTGTCATGGAACTCTTCCATCACCGCGTACGACCTG CCGGCTCTGGGCACCTACATCCAGAGCTCCGACTACGTCAGCCAGTACCTCTGTGATGACACTGCCGGTATGGCT GGTTGTGTTCTCGGTGGTGGCACCATCGTCAACGCCATGTCTTTCATCTACCCCCAGGAGGCTGATTTCGACGAC AAGTGGCCCACCGGCTGGAAGTGGAAGGACGTCAAGGCTGCTGCCGAGCGCCTCTACGCCCGCAACCCCGGTAGC ACCCTCCCTTCGGCTGATGGCAAGCGTTACGACCAGGGCATGTACACCGTTCTCTCCTCTTTCCTGAAGGGTCTC GGCTGGAAGTCTGTCGACTCTCAGGAGCAGCCCAACGAGAAGCACATGGTCTACAGCTACCCCTCCTGGGATGTC GGCAATGGTATCCGTGCCGGTCCTGTCCGTTCCTACCTGCCCCTGGTCGAGGACGCTGACAACTTCCACATGAGC CTGAACACCAAGGTCCGCCGCGTCGTCCGCCGCGGTGGTCGCATCACTGGTGTTGAGGTCGAGACCTCCTCTGGC AGCGTCGAAATCATCAATGTCCGCGCCGGTGGTAAGGTTGTTCTTGCTGCTGGTTCCATGTCCACTCCCCGTATC CTGTTCAACTCCGGTATCGGTCCCTCTGAACAGATCAAGACCGTCCAGAGCGGCAGCACTGGCATCACCGTGCCT CCCTCCGCTGAATGGATCAACCTGCCCGTCGGCGAGAACCTCCGTGACCACCCCATGTTCACTGTCACCGTCAAC ACCAACAGCAACTTCACCCACTTCAACACCTCCAGTGCCGTCTCCGACCCCGCTGCTCCCATCCGCAACCTCTAC GCCGAGGGCTCCGGTGTCCTGACTCAGGGTGGCCACCGTCTCCAGTTCTGGACCTCCAACGTCGGCACCGACGGC GTCACTCGCTTCTACCAGGCCTCCTGCAGTACCACCGAGGATGGTGTCATCACCATGAAGCTGTACCTCACCCAC GGTGCCACCTCCACCGGTGTTCTCGGCATTGACTCGACCGGCTCCACCACCATCGAGACTTCCCCTTACCTGAAC ACCGCCGCCGACAAGGAAGCCCTTACCCGCTTCCTCAACGGCCTGATCGCCGACATGAAGAACTCGACCGCTGGC TTCTCCATCCAGGGTAGTGCGACCGCGTCGAGCATCCTGGACAAGCTGACTGCCGGTGACCACTACGTTGGTACT GCCAAGATGGGTGTCGACGATGGCCGTGAGAGCAATGGCACCTCCGTTGTTGACCTCAACACCAAGGTCTACGGT ACTGAGAACTTGTACATCGTCGACGGCAGTATCCACCCCGACCTTCCCACCGGTAACTCCCAGGCCATCATCCAG ATCGCCGCCGAGGCCGCCGTTGCCCGCATTATCGCCCAGGGCACCAGCGCCACCTCTGCCTCCGCCTCTGCCTCC GTCTCCGTTGCTGCTTCCACCCAGGCCGCCTACGCCTCGACTACTTCCGAGGCTGCTGCCGCCACCGAGACCGAG ACCGCGGCCGTCACCTCCACTGAGGCTGTCACCGCCTCTGCCGTCCCCACCACCGGTACCATCTCGTCTACCACC GGCTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCCGCTGGTTCCTCCAGCGAGTCGGAGAGCAGCACCGGTGCTGATGAC AACGAGGGTGATGATGATGACGAGGAGTACGACTGCGACGACGAGGATGATGAGGATGACAGCAGCAGCGGAGTC GAGACCTCCGAGTCCGTGACCGCCAAGGTCGCCGTGGCTACCTCTGCCGCTGCTGACTCGGGTGCCTCTACCACC ACCGTGTGGGTGACCTCGACTGCCTGGACCACTACCACTGATATGGTGGTGGCTACCAGCACTTCGACCGTGACT GTCTGGCCCACCTATGCTTAG |
| Transcript | >Ani_SJS72_1|g1299.t1 ATGCGTTCCGTTCTGCTTAGTGGCGTGGCCGCCCTGAGCTACGCTTTGGGCGTCTCGGCCAATGCCTACAACACC TCCGCCTATACCGATTCGGCCTCTGGCATCGACTTCCAGAGATGGTGTGATACCGACGATACCGGTTTCTGTTTC GGTATCGCCCTGCCCGAGGATGTCAGCACCGACTTCATCGGTCAGCTGACCGTCCCCCTGTCCAGCTCCAAGGGT TGGGGTGGTGTCAGTATGTCGGGTTCCATGACCAACGTCCTCCTGATTGCCGCCTGGCCCGATGGTGATTCGGCC GTGGGTACTCTGCGTGAGGCCACGTCCTATGTCTCCCCATCTGTCTACAGCGGTGATGCTTCGATCGAGGAGATC CCCGACGGCACCTCCGTCAACAGCACCTACCTGACCTACACCTTCCTGTGCAAGGGCTGCATCATCGGTCAGCCC ACCACCTTCGACGCCAACTCGACCCAGTACTACTTCGGCTGGGCTCTCAGTGCCTCCAACCCCACGACTCCCTCC TCCGCCTCCTCCAAGATGCCCTACCACGCTGCCGGCTATGGTGGTTTCGAGGTGCAGCTGGCCAACGCCAAGTCG TCCAAGTACTCCACCTGGGCTTCCAAGGCTGTCTCGACCCAGTCCACTGCTACTTCTGCTTCCGCCTCCTCCAGT GCCTCCGCATCCGCCTCTCCCTCCGCCAGCGTTGCCGCCACCGTCTCAAACACGACCTACGATTACATTGTTGTC GGTGGTGGTGCTGCTGGTCTGGTTGCCGCTGAGCGCCTGGCCGAGACCAAGAAGAGCGTCCTGCTCATCGAGCGT GGTGTGGCCCCGACCGTCGAGCTGGGTGCTACCGACTCCCTGTCATGGAACTCTTCCATCACCGCGTACGACCTG CCGGCTCTGGGCACCTACATCCAGAGCTCCGACTACGTCAGCCAGTACCTCTGTGATGACACTGCCGGTATGGCT GGTTGTGTTCTCGGTGGTGGCACCATCGTCAACGCCATGTCTTTCATCTACCCCCAGGAGGCTGATTTCGACGAC AAGTGGCCCACCGGCTGGAAGTGGAAGGACGTCAAGGCTGCTGCCGAGCGCCTCTACGCCCGCAACCCCGGTAGC ACCCTCCCTTCGGCTGATGGCAAGCGTTACGACCAGGGCATGTACACCGTTCTCTCCTCTTTCCTGAAGGGTCTC GGCTGGAAGTCTGTCGACTCTCAGGAGCAGCCCAACGAGAAGCACATGGTCTACAGCTACCCCTCCTGGGATGTC GGCAATGGTATCCGTGCCGGTCCTGTCCGTTCCTACCTGCCCCTGGTCGAGGACGCTGACAACTTCCACATGAGC CTGAACACCAAGGTCCGCCGCGTCGTCCGCCGCGGTGGTCGCATCACTGGTGTTGAGGTCGAGACCTCCTCTGGC AGCGTCGAAATCATCAATGTCCGCGCCGGTGGTAAGGTTGTTCTTGCTGCTGGTTCCATGTCCACTCCCCGTATC CTGTTCAACTCCGGTATCGGTCCCTCTGAACAGATCAAGACCGTCCAGAGCGGCAGCACTGGCATCACCGTGCCT CCCTCCGCTGAATGGATCAACCTGCCCGTCGGCGAGAACCTCCGTGACCACCCCATGTTCACTGTCACCGTCAAC ACCAACAGCAACTTCACCCACTTCAACACCTCCAGTGCCGTCTCCGACCCCGCTGCTCCCATCCGCAACCTCTAC GCCGAGGGCTCCGGTGTCCTGACTCAGGGTGGCCACCGTCTCCAGTTCTGGACCTCCAACGTCGGCACCGACGGC GTCACTCGCTTCTACCAGGCCTCCTGCAGTACCACCGAGGATGGTGTCATCACCATGAAGCTGTACCTCACCCAC GGTGCCACCTCCACCGGTGTTCTCGGCATTGACTCGACCGGCTCCACCACCATCGAGACTTCCCCTTACCTGAAC ACCGCCGCCGACAAGGAAGCCCTTACCCGCTTCCTCAACGGCCTGATCGCCGACATGAAGAACTCGACCGCTGGC TTCTCCATCCAGGGTAGTGCGACCGCGTCGAGCATCCTGGACAAGCTGACTGCCGGTGACCACTACGTTGGTACT GCCAAGATGGGTGTCGACGATGGCCGTGAGAGCAATGGCACCTCCGTTGTTGACCTCAACACCAAGGTCTACGGT ACTGAGAACTTGTACATCGTCGACGGCAGTATCCACCCCGACCTTCCCACCGGTAACTCCCAGGCCATCATCCAG ATCGCCGCCGAGGCCGCCGTTGCCCGCATTATCGCCCAGGGCACCAGCGCCACCTCTGCCTCCGCCTCTGCCTCC GTCTCCGTTGCTGCTTCCACCCAGGCCGCCTACGCCTCGACTACTTCCGAGGCTGCTGCCGCCACCGAGACCGAG ACCGCGGCCGTCACCTCCACTGAGGCTGTCACCGCCTCTGCCGTCCCCACCACCGGTACCATCTCGTCTACCACC GGCTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCCGCTGGTTCCTCCAGCGAGTCGGAGAGCAGCACCGGTGCTGATGAC AACGAGGGTGATGATGATGACGAGGAGTACGACTGCGACGACGAGGATGATGAGGATGACAGCAGCAGCGGAGTC GAGACCTCCGAGTCCGTGACCGCCAAGGTCGCCGTGGCTACCTCTGCCGCTGCTGACTCGGGTGCCTCTACCACC ACCGTGTGGGTGACCTCGACTGCCTGGACCACTACCACTGATATGGTGGTGGCTACCAGCACTTCGACCGTGACT GTCTGGCCCACCTATGCTTAG |
| Gene | >Ani_SJS72_1|g1299.t1 ATGCGTTCCGTTCTGCTTAGTGGCGTGGCCGCCCTGAGCTACGCTTTGGGCGTCTCGGCCAATGCCTACAACACC TCCGCCTATACCGATTCGGCCTCTGGCATCGACTTCCAGAGATGGTGTGATACCGACGATACCGGTTTCTGTTTC GGTATCGCCCTGCCCGAGGATGTCAGCACCGACTTCATCGGTCAGCTGACCGTCCCCCTGTCCAGCTCCAAGGGT TGGGGTGGTGTCAGTATGTCGGGTTCCATGACCAACGTCCTCCTGATTGCCGCCTGGCCCGATGGTGATTCGGCC GTGGGTACTCTGCGTGAGGCCACGTCCTATGTCTCCCCATCTGTCTACAGCGGTGATGCTTCGATCGAGGAGATC CCCGACGGCACCTCCGTCAACAGCACCTACCTGACCTACACCTTCCTGTGCAAGGGCTGCATCATCGGTCAGCCC ACCACCTTCGACGCCAACTCGACCCAGTACTACTTCGGCTGGGCTCTCAGTGCCTCCAACCCCACGACTCCCTCC TCCGCCTCCTCCAAGATGCCCTACCACGCTGCCGGCTATGGTGGTTTCGAGGTGCAGCTGGCCAACGCCAAGTCG TCCAAGTACTCCACCTGGGCTTCCAAGGCTGTCTCGACCCAGTCCACTGCTACTTCTGCTTCCGCCTCCTCCAGT GCCTCCGCATCCGCCTCTCCCTCCGCCAGCGTTGCCGCCACCGTCTCAAACACGACCTACGATTACATTGTTGTC GGTGGTGGTGCTGCTGGTCTGGTTGCCGCTGAGCGCCTGGCCGAGACCAAGAAGAGCGTCCTGCTCATCGAGCGT GGTGTGGCCCCGACCGTCGAGCTGGGTGCTACCGACTCCCTGTCATGGAACTCTTCCATCACCGCGTACGACCTG CCGGCTCTGGGCACCTACATCCAGAGCTCCGACTACGTCAGCCAGTACCTCTGTGATGACACTGCCGGTATGGCT GGTTGTGTTCTCGGTGGTGGCACCATCGTCAACGCCATGTCTTTCATCTACCCCCAGGAGGCTGATTTCGACGAC AAGTGGCCCACCGGCTGGAAGTGGAAGGACGTCAAGGCTGCTGCCGAGCGCCTCTACGCCCGCAACCCCGGTAGC ACCCTCCCTTCGGCTGATGGCAAGCGTTACGACCAGGGCATGTACACCGTTCTCTCCTCTTTCCTGAAGGGTCTC GGCTGGAAGTCTGTCGACTCTCAGGAGCAGCCCAACGAGAAGCACATGGTCTACAGCTACCCCTCCTGGGATGTC GGCAATGGTATCCGTGCCGGTCCTGTCCGTTCCTACCTGCCCCTGGTCGAGGACGCTGACAACTTCCACATGAGC CTGAACACCAAGGTCCGCCGCGTCGTCCGCCGCGGTGGTCGCATCACTGGTGTTGAGGTCGAGACCTCCTCTGGC AGCGTCGAAATCATCAATGTCCGCGCCGGTGGTAAGGTTGTTCTTGCTGCTGGTTCCATGTCCACTCCCCGTATC CTGTTCAACTCCGGTATCGGTCCCTCTGAACAGATCAAGACCGTCCAGAGCGGCAGCACTGGCATCACCGTGCCT CCCTCCGCTGAATGGATCAACCTGCCCGTCGGCGAGAACCTCCGTGACCACCCCATGTTCACTGTCACCGTCAAC ACCAACAGCAACTTCACCCACTTCAACACCTCCAGTGCCGTCTCCGACCCCGCTGCTCCCATCCGCAACCTCTAC GCCGAGGGCTCCGGTGTCCTGACTCAGGGTGGCCACCGTCTCCAGTTCTGGACCTCCAACGTCGGCACCGACGGC GTCACTCGCTTCTACCAGGCCTCCTGCAGTACCACCGAGGATGGTGTCATCACCATGAAGCTGTACCTCACCCAC GGTGCCACCTCCACCGGTGTTCTCGGCATTGACTCGACCGGCTCCACCACCATCGAGACTTCCCCTTACCTGAAC ACCGCCGCCGACAAGGAAGCCCTTACCCGCTTCCTCAACGGCCTGATCGCCGACATGAAGAACTCGACCGCTGGC TTCTCCATCCAGGGTAGTGCGACCGCGTCGAGCATCCTGGACAAGCTGACTGCCGGTGACCACTACGTTGGTACT GCCAAGATGGGTGTCGACGATGGCCGTGAGAGCAATGGCACCTCCGTTGTTGACCTCAACACCAAGGTCTACGGT ACTGAGAACTTGGTACGTTAACCACTCCCCTATTTCCTTCTGTCTGAGACCATCTCTTCTAACCTCATATCTGCA ATAGTACATCGTCGACGGCAGTATCCACCCCGACCTTCCCACCGGTAACTCCCAGGCCATCATCCAGATCGCCGC CGAGGCCGCCGTTGCCCGCATTATCGCCCAGGGCACCAGCGCCACCTCTGCCTCCGCCTCTGCCTCCGTCTCCGT TGCTGCTTCCACCCAGGCCGCCTACGCCTCGACTACTTCCGAGGCTGCTGCCGCCACCGAGACCGAGACCGCGGC CGTCACCTCCACTGAGGCTGTCACCGCCTCTGCCGTCCCCACCACCGGTACCATCTCGTCTACCACCGGCTCTTC TTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCCGCTGGTTCCTCCAGCGAGTCGGAGAGCAGCACCGGTGCTGATGACAACGAGGG TGATGATGATGACGAGGAGTACGACTGCGACGACGAGGATGATGAGGATGACAGCAGCAGCGGAGTCGAGACCTC CGAGTCCGTGACCGCCAAGGTCGCCGTGGCTACCTCTGCCGCTGCTGACTCGGGTGCCTCTACCACCACCGTGTG GGTGACCTCGACTGCCTGGACCACTACCACTGATATGGTGGTGGCTACCAGCACTTCGACCGTGACTGTCTGGCC CACCTATGCTTAG |