Protein ID | Ani_SJS100_1|g9623.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_091:54235..55301 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 1066 |
Transcript length (bp) | 1002 |
Coding sequence length (bp) | 1002 |
Protein length (aa) | 334 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF01027 | Bax1-I | Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 | 8.1E-33 | 110 | 325 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 25 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 77 | 96 | 19 |
2 | 116 | 134 | 18 |
3 | 146 | 168 | 22 |
4 | 201 | 223 | 22 |
5 | 230 | 252 | 22 |
6 | 267 | 284 | 17 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g9623.t1 MAFFLRRPFAVPTALRQISKPANSARFIHNTPFKPQSKPTGPISIFAKSRQTFQNAFRRTYMQPSYNVQGGNITQ KLIYGATIIGGTILATNFIFNRETREDGGMPPFERSYLNETFMHTGLGIGIIGIAARALHTNGWSYRLMAASPWA VIGLGLVASVGTMYGTLYTNPDNYVMKYGLWAAFNVTQAALLSPLMFMHPAILARAGLYTAGMMGAIAFVGATAK QEKYMYLGAPLLAGVTIVALSGFAPLVLPATATRALLWSEKIWLYGGLAVFGGFTLYDVQKILHHARMAQRGLVR KDVVNESISLELDFINIFVRMVQILGMRNNNRR* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g9623.t1 ATGGCGTTCTTCTTGCGACGCCCGTTCGCCGTCCCTACGGCGCTTCGGCAAATCTCCAAACCTGCGAATAGCGCT CGTTTCATCCACAATACGCCCTTCAAGCCCCAGTCCAAGCCTACCGGTCCCATCTCCATCTTCGCAAAGTCCCGT CAGACCTTCCAAAATGCTTTCCGTCGCACCTACATGCAGCCCTCCTACAATGTTCAGGGTGGCAACATCACCCAG AAGCTGATCTACGGTGCCACTATCATCGGTGGTACTATCCTGGCAACGAACTTCATCTTCAACCGCGAAACCAGA GAGGATGGTGGCATGCCTCCGTTTGAGCGCAGCTACCTGAACGAGACGTTTATGCACACTGGACTTGGTATTGGT ATCATTGGTATCGCTGCTCGCGCTCTGCACACCAACGGATGGTCTTACCGTTTGATGGCTGCCAGCCCCTGGGCT GTCATCGGTCTTGGTCTGGTTGCCAGCGTCGGAACCATGTATGGTACTCTGTACACCAACCCTGACAACTACGTC ATGAAGTATGGTCTCTGGGCAGCTTTCAACGTCACCCAGGCCGCGCTCCTGTCTCCCCTGATGTTCATGCACCCG GCTATCCTTGCTCGTGCTGGTCTTTACACCGCTGGAATGATGGGTGCGATCGCTTTCGTCGGTGCCACTGCTAAG CAGGAGAAGTACATGTACCTGGGTGCTCCTTTGCTCGCTGGTGTGACCATTGTCGCTCTCTCCGGTTTCGCTCCT CTCGTCCTCCCCGCTACTGCCACCCGCGCTCTGCTGTGGTCTGAGAAGATCTGGCTGTACGGTGGTCTCGCTGTC TTCGGTGGTTTCACCCTCTATGACGTCCAGAAGATTCTCCACCACGCCCGCATGGCTCAGAGAGGCCTGGTCCGC AAGGATGTCGTCAACGAGAGTATCAGCCTTGAGTTGGACTTCATCAATATCTTCGTCCGTATGGTCCAGATCCTG GGCATGCGCAACAACAACCGGAGGTAA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g9623.t1 ATGGCGTTCTTCTTGCGACGCCCGTTCGCCGTCCCTACGGCGCTTCGGCAAATCTCCAAACCTGCGAATAGCGCT CGTTTCATCCACAATACGCCCTTCAAGCCCCAGTCCAAGCCTACCGGTCCCATCTCCATCTTCGCAAAGTCCCGT CAGACCTTCCAAAATGCTTTCCGTCGCACCTACATGCAGCCCTCCTACAATGTTCAGGGTGGCAACATCACCCAG AAGCTGATCTACGGTGCCACTATCATCGGTGGTACTATCCTGGCAACGAACTTCATCTTCAACCGCGAAACCAGA GAGGATGGTGGCATGCCTCCGTTTGAGCGCAGCTACCTGAACGAGACGTTTATGCACACTGGACTTGGTATTGGT ATCATTGGTATCGCTGCTCGCGCTCTGCACACCAACGGATGGTCTTACCGTTTGATGGCTGCCAGCCCCTGGGCT GTCATCGGTCTTGGTCTGGTTGCCAGCGTCGGAACCATGTATGGTACTCTGTACACCAACCCTGACAACTACGTC ATGAAGTATGGTCTCTGGGCAGCTTTCAACGTCACCCAGGCCGCGCTCCTGTCTCCCCTGATGTTCATGCACCCG GCTATCCTTGCTCGTGCTGGTCTTTACACCGCTGGAATGATGGGTGCGATCGCTTTCGTCGGTGCCACTGCTAAG CAGGAGAAGTACATGTACCTGGGTGCTCCTTTGCTCGCTGGTGTGACCATTGTCGCTCTCTCCGGTTTCGCTCCT CTCGTCCTCCCCGCTACTGCCACCCGCGCTCTGCTGTGGTCTGAGAAGATCTGGCTGTACGGTGGTCTCGCTGTC TTCGGTGGTTTCACCCTCTATGACGTCCAGAAGATTCTCCACCACGCCCGCATGGCTCAGAGAGGCCTGGTCCGC AAGGATGTCGTCAACGAGAGTATCAGCCTTGAGTTGGACTTCATCAATATCTTCGTCCGTATGGTCCAGATCCTG GGCATGCGCAACAACAACCGGAGGTAA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g9623.t1 ATGGCGTTCTTCTTGCGACGCCCGTTCGCCGTCCCTACGGCGCTTCGGCAAATCTCCAAACCTGCGAATAGCGCT CGTTTCATCCACAATACGCCCTTCAAGCCCCAGTCCAAGCCTACCGGTCCCATCTCCATCTTCGCAAAGTCCCGT CAGACCTTCCAAAATGCTTTCCGTCGCACCTACATGCAGCCCTCCTACAATGTTCAGGGTGGCAACATCACCCAG AAGCTGATCTACGGTGCCACTATCATCGGTGGTACTATCCTGGCAACGAACTTCATCTTCAACCGCGAAACCAGA GAGGATGGTGGCATGCCTCCGTTTGAGCGCAGCTACCTGAACGAGACGTTTATGCACACTGGACTTGGTATTGGT ATCATTGGTATCGCTGCTCGCGCTCTGCACACCAACGGATGGTCTTACCGTTTGATGGCTGCCAGCCCCTGGGCT GTCATCGGTCTTGGTCTGGTTGCCAGCGTCGGAACCATGTATGGTACTCTGTACACCAACCCTGACAAGTAAGTA CTTTCACCAGCGCAGGTCTTTTTTTTCCTATGCGACAGTTTTCTGACAAGTTATTAGCTACGTCATGAAGTATGG TCTCTGGGCAGCTTTCAACGTCACCCAGGCCGCGCTCCTGTCTCCCCTGATGTTCATGCACCCGGCTATCCTTGC TCGTGCTGGTCTTTACACCGCTGGAATGATGGGTGCGATCGCTTTCGTCGGTGCCACTGCTAAGCAGGAGAAGTA CATGTACCTGGGTGCTCCTTTGCTCGCTGGTGTGACCATTGTCGCTCTCTCCGGTTTCGCTCCTCTCGTCCTCCC CGCTACTGCCACCCGCGCTCTGCTGTGGTCTGAGAAGATCTGGCTGTACGGTGGTCTCGCTGTCTTCGGTGGTTT CACCCTCTATGACGTCCAGAAGATTCTCCACCACGCCCGCATGGCTCAGAGAGGCCTGGTCCGCAAGGATGTCGT CAACGAGAGTATCAGCCTTGAGTTGGACTTCATCAATATCTTCGTCCGTATGGTCCAGATCCTGGGCATGCGCAA CAACAACCGGAGGTAA |