Protein ID | Ani_SJS100_1|g8718.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_071:60204..61794 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 1590 |
Transcript length (bp) | 1590 |
Coding sequence length (bp) | 1590 |
Protein length (aa) | 530 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF13813 | MBOAT_2 | Membrane bound O-acyl transferase family | 2.6E-22 | 335 | 428 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 46 | 0.5 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 33 | 52 | 19 |
2 | 59 | 78 | 19 |
3 | 88 | 107 | 19 |
4 | 295 | 317 | 22 |
5 | 337 | 359 | 22 |
6 | 391 | 410 | 19 |
7 | 425 | 447 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g8718.t1 MAASQPPFSYRRLIHDNQAQFESLVQNGDVKPVLLWHLMLPLVLSILALLVPQQRGGRYVRPLVLACVIGITSNV LQHRRMLTGGNGYMGGLIPVWSTIWSATILLFRDVERDFKRIERHPLSSTMTISNGDAALNGHAKESKCMVTTHN SSAEPVSWQPYPQTLSRRLNWVISVATSMRGPEWNWRISTMGALPASVQAQLNNSSEHHSEEEKATTTTNTNPEP ITMRTRLRATLTLFIQSYLLLDLIKLLMIRDQYFMGSVSPPAPPPFPFHHLIPYPILIHIYRCLVTGTGVLAALN YVTCLNPLIFGGLSLAFPNAAKSLTSVPLSAPYLYPPAFGPFFTSILDHSLAGCWSLWWHQLFRYGFISAAHWLL SLLPSRLSTSRSVRRVLTAFVAFSLSGLVHASGSYVQNRETYPFAGPFRFFVLQAVGVLLQGVISPLWLWMPRPA RRACNAVFAVTWLLGSAGSLVEDFSRGGLWFTEPLPVSLLRGLGVGVDDGDKGWWWWSGKWFGRWDGGGGFWDRG VRFY* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g8718.t1 ATGGCCGCCTCTCAACCGCCTTTTTCATACCGCCGCCTTATCCACGACAATCAGGCCCAGTTCGAGTCCCTTGTT CAAAATGGCGATGTAAAGCCCGTGCTCTTATGGCATCTGATGTTACCCCTCGTGCTGTCCATTCTAGCGCTCCTT GTCCCGCAGCAAAGAGGTGGCCGCTATGTCCGTCCCCTGGTGCTGGCGTGCGTCATAGGCATCACCAGCAATGTC CTCCAACATCGACGCATGCTCACAGGAGGCAATGGCTACATGGGCGGCCTTATTCCCGTCTGGAGCACCATCTGG TCCGCGACGATTCTTCTCTTCCGCGATGTTGAGCGCGACTTCAAACGCATCGAGCGCCACCCATTGTCATCTACC ATGACTATCTCAAACGGCGATGCCGCCCTCAACGGCCATGCTAAAGAATCAAAATGCATGGTCACTACCCACAAC AGCAGCGCCGAACCTGTCTCATGGCAACCATATCCGCAGACGCTATCCCGCCGTCTCAACTGGGTCATAAGTGTA GCCACCAGCATGCGTGGGCCTGAATGGAACTGGCGCATCTCCACCATGGGCGCCTTACCGGCCTCAGTCCAGGCG CAGCTCAACAACTCCTCAGAGCATCACAGCGAAGAAGAAAAAGCAACCACAACCACAAACACCAACCCAGAACCT ATCACCATGCGCACTCGTCTCCGTGCCACACTCACCCTCTTCATCCAATCCTACCTCCTCCTCGACCTGATCAAG CTCCTCATGATCCGCGACCAATACTTCATGGGCAGCGTATCTCCTCCTGCACCTCCCCCCTTCCCCTTCCACCAT CTAATCCCCTACCCCATCCTCATCCACATCTACCGCTGTCTAGTAACAGGCACCGGCGTCCTCGCCGCCCTCAAC TACGTGACCTGCCTCAACCCCCTCATCTTCGGCGGCCTCTCCCTCGCCTTCCCCAACGCCGCCAAATCCCTCACC TCCGTCCCCCTCTCCGCTCCCTACCTCTACCCCCCAGCCTTCGGCCCCTTCTTCACCTCCATCCTCGACCACAGC CTTGCCGGCTGCTGGAGCCTCTGGTGGCACCAGCTCTTCCGCTACGGCTTCATCTCCGCCGCCCACTGGCTCCTC TCTCTCCTTCCCTCCCGTCTATCAACTTCCCGCTCCGTCCGCCGTGTACTCACTGCCTTCGTCGCATTCTCTCTC AGCGGCTTGGTTCATGCCTCCGGCAGCTACGTCCAGAACCGCGAGACGTATCCCTTTGCAGGCCCGTTCCGCTTC TTTGTTCTCCAGGCGGTGGGGGTTCTCCTTCAGGGTGTTATTTCTCCGCTGTGGTTATGGATGCCGCGGCCGGCG AGGCGGGCTTGTAATGCCGTGTTTGCAGTGACTTGGCTGTTGGGGTCGGCGGGATCGCTGGTAGAAGACTTTTCA AGGGGTGGATTGTGGTTCACGGAGCCGTTGCCGGTGAGTTTGTTAAGGGGTTTGGGGGTTGGTGTGGATGATGGG GATAAGGGGTGGTGGTGGTGGAGTGGGAAGTGGTTCGGGAGGTGGGATGGTGGTGGGGGGTTCTGGGATAGGGGG GTGAGGTTTTATTGA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g8718.t1 ATGGCCGCCTCTCAACCGCCTTTTTCATACCGCCGCCTTATCCACGACAATCAGGCCCAGTTCGAGTCCCTTGTT CAAAATGGCGATGTAAAGCCCGTGCTCTTATGGCATCTGATGTTACCCCTCGTGCTGTCCATTCTAGCGCTCCTT GTCCCGCAGCAAAGAGGTGGCCGCTATGTCCGTCCCCTGGTGCTGGCGTGCGTCATAGGCATCACCAGCAATGTC CTCCAACATCGACGCATGCTCACAGGAGGCAATGGCTACATGGGCGGCCTTATTCCCGTCTGGAGCACCATCTGG TCCGCGACGATTCTTCTCTTCCGCGATGTTGAGCGCGACTTCAAACGCATCGAGCGCCACCCATTGTCATCTACC ATGACTATCTCAAACGGCGATGCCGCCCTCAACGGCCATGCTAAAGAATCAAAATGCATGGTCACTACCCACAAC AGCAGCGCCGAACCTGTCTCATGGCAACCATATCCGCAGACGCTATCCCGCCGTCTCAACTGGGTCATAAGTGTA GCCACCAGCATGCGTGGGCCTGAATGGAACTGGCGCATCTCCACCATGGGCGCCTTACCGGCCTCAGTCCAGGCG CAGCTCAACAACTCCTCAGAGCATCACAGCGAAGAAGAAAAAGCAACCACAACCACAAACACCAACCCAGAACCT ATCACCATGCGCACTCGTCTCCGTGCCACACTCACCCTCTTCATCCAATCCTACCTCCTCCTCGACCTGATCAAG CTCCTCATGATCCGCGACCAATACTTCATGGGCAGCGTATCTCCTCCTGCACCTCCCCCCTTCCCCTTCCACCAT CTAATCCCCTACCCCATCCTCATCCACATCTACCGCTGTCTAGTAACAGGCACCGGCGTCCTCGCCGCCCTCAAC TACGTGACCTGCCTCAACCCCCTCATCTTCGGCGGCCTCTCCCTCGCCTTCCCCAACGCCGCCAAATCCCTCACC TCCGTCCCCCTCTCCGCTCCCTACCTCTACCCCCCAGCCTTCGGCCCCTTCTTCACCTCCATCCTCGACCACAGC CTTGCCGGCTGCTGGAGCCTCTGGTGGCACCAGCTCTTCCGCTACGGCTTCATCTCCGCCGCCCACTGGCTCCTC TCTCTCCTTCCCTCCCGTCTATCAACTTCCCGCTCCGTCCGCCGTGTACTCACTGCCTTCGTCGCATTCTCTCTC AGCGGCTTGGTTCATGCCTCCGGCAGCTACGTCCAGAACCGCGAGACGTATCCCTTTGCAGGCCCGTTCCGCTTC TTTGTTCTCCAGGCGGTGGGGGTTCTCCTTCAGGGTGTTATTTCTCCGCTGTGGTTATGGATGCCGCGGCCGGCG AGGCGGGCTTGTAATGCCGTGTTTGCAGTGACTTGGCTGTTGGGGTCGGCGGGATCGCTGGTAGAAGACTTTTCA AGGGGTGGATTGTGGTTCACGGAGCCGTTGCCGGTGAGTTTGTTAAGGGGTTTGGGGGTTGGTGTGGATGATGGG GATAAGGGGTGGTGGTGGTGGAGTGGGAAGTGGTTCGGGAGGTGGGATGGTGGTGGGGGGTTCTGGGATAGGGGG GTGAGGTTTTATTGA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g8718.t1 ATGGCCGCCTCTCAACCGCCTTTTTCATACCGCCGCCTTATCCACGACAATCAGGCCCAGTTCGAGTCCCTTGTT CAAAATGGCGATGTAAAGCCCGTGCTCTTATGGCATCTGATGTTACCCCTCGTGCTGTCCATTCTAGCGCTCCTT GTCCCGCAGCAAAGAGGTGGCCGCTATGTCCGTCCCCTGGTGCTGGCGTGCGTCATAGGCATCACCAGCAATGTC CTCCAACATCGACGCATGCTCACAGGAGGCAATGGCTACATGGGCGGCCTTATTCCCGTCTGGAGCACCATCTGG TCCGCGACGATTCTTCTCTTCCGCGATGTTGAGCGCGACTTCAAACGCATCGAGCGCCACCCATTGTCATCTACC ATGACTATCTCAAACGGCGATGCCGCCCTCAACGGCCATGCTAAAGAATCAAAATGCATGGTCACTACCCACAAC AGCAGCGCCGAACCTGTCTCATGGCAACCATATCCGCAGACGCTATCCCGCCGTCTCAACTGGGTCATAAGTGTA GCCACCAGCATGCGTGGGCCTGAATGGAACTGGCGCATCTCCACCATGGGCGCCTTACCGGCCTCAGTCCAGGCG CAGCTCAACAACTCCTCAGAGCATCACAGCGAAGAAGAAAAAGCAACCACAACCACAAACACCAACCCAGAACCT ATCACCATGCGCACTCGTCTCCGTGCCACACTCACCCTCTTCATCCAATCCTACCTCCTCCTCGACCTGATCAAG CTCCTCATGATCCGCGACCAATACTTCATGGGCAGCGTATCTCCTCCTGCACCTCCCCCCTTCCCCTTCCACCAT CTAATCCCCTACCCCATCCTCATCCACATCTACCGCTGTCTAGTAACAGGCACCGGCGTCCTCGCCGCCCTCAAC TACGTGACCTGCCTCAACCCCCTCATCTTCGGCGGCCTCTCCCTCGCCTTCCCCAACGCCGCCAAATCCCTCACC TCCGTCCCCCTCTCCGCTCCCTACCTCTACCCCCCAGCCTTCGGCCCCTTCTTCACCTCCATCCTCGACCACAGC CTTGCCGGCTGCTGGAGCCTCTGGTGGCACCAGCTCTTCCGCTACGGCTTCATCTCCGCCGCCCACTGGCTCCTC TCTCTCCTTCCCTCCCGTCTATCAACTTCCCGCTCCGTCCGCCGTGTACTCACTGCCTTCGTCGCATTCTCTCTC AGCGGCTTGGTTCATGCCTCCGGCAGCTACGTCCAGAACCGCGAGACGTATCCCTTTGCAGGCCCGTTCCGCTTC TTTGTTCTCCAGGCGGTGGGGGTTCTCCTTCAGGGTGTTATTTCTCCGCTGTGGTTATGGATGCCGCGGCCGGCG AGGCGGGCTTGTAATGCCGTGTTTGCAGTGACTTGGCTGTTGGGGTCGGCGGGATCGCTGGTAGAAGACTTTTCA AGGGGTGGATTGTGGTTCACGGAGCCGTTGCCGGTGAGTTTGTTAAGGGGTTTGGGGGTTGGTGTGGATGATGGG GATAAGGGGTGGTGGTGGTGGAGTGGGAAGTGGTTCGGGAGGTGGGATGGTGGTGGGGGGTTCTGGGATAGGGGG GTGAGGTTTTATTGA |