Protein ID | Ani_SJS100_1|g8684.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_070:149601..151789 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2188 |
Transcript length (bp) | 1971 |
Coding sequence length (bp) | 1971 |
Protein length (aa) | 657 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00285 | Citrate_synt | Citrate synthase, C-terminal domain | 7.4E-19 | 430 | 625 |
PF02629 | CoA_binding | CoA binding domain | 1.1E-18 | 40 | 145 |
PF00549 | Ligase_CoA | CoA-ligase | 1.1E-14 | 205 | 328 |
GO Term | Description | Terminal node |
---|---|---|
GO:0003824 | catalytic activity | Yes |
GO:0046912 | acyltransferase activity, acyl groups converted into alkyl on transfer | Yes |
GO:0016740 | transferase activity | No |
GO:0016746 | acyltransferase activity | No |
GO:0003674 | molecular_function | No |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 17 | 0.45 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g8684.t1 MPTSAPLVNTANGASANDNITRFDPPSRVRSPLSNALFHNKTRCFVYGMQPRAVQGMLDFDFICKRSTPSVAGII YTFGGQFVSKMYWGTSETLLPVYQDVSKAMAKHPDVDTVVNFASSRSVYSSTMELMECPQIRSIAIIAEGVPERR AREIMVKAKEKGITIIGPATVGGIKPGAFKIGNTGGMMDNIVASKLYRKGSVGYVSKSGGMSNELNNIISQTTDG VYEGVAIGGDRYPGTTFIDHLLRYQAEPECKILVLLGEVGGVEEYRVIEAVKNGTITKPIVAWAIGTCASMFKTE VQFGHAGASANSDLETAVAKNKAMREAGIFVPETFEDLPQTLKEVYDDQVKKGIVKPQPEPVVPKIPIDYSWAQE LGLVRKPAAFISTISDDRGQELLYAGMPISDVFREDIGIGGVMSLLWFRRRLPAYASKFLEMVLMLTADHGPAVS GAMNTIITTRAGKDLISALVSGLLTIGSRFGGALDGAAEEFTKAFDKGMSPRDFVDTMRKENKLIPGIGHRVKSR NNPDLRVELVKEFAKKHFPSTKLLDYAIAVETVTTSKKDNLILNVDGCVAVCFVDLMRNCGAFSSEEVEDYMKMG VLNGLFVLGRSIGLIAHYLDQKRLRTGLYRHPWDDITYLLPALQKGGSEGRVEVSV* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g8684.t1 ATGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGCTTCGACCCC CCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATATGGTATGCAG CCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATC TACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGAC GTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGC TCCACCATGGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGACGC GCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAG CCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGT TCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGT GTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACCAG GCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCC GTCAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTGAG GTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGT GAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGGTC AAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAG CTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCC GGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGC CGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCT GGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACC ATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGC CCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGC AACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGAC TACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCC GTCTGCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGT GTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGC ACTGGTCTGTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGGTGGCTCCGAGGGT CGTGTCGAGGTCAGCGTCTAA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g8684.t1 ATGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGCTTCGACCCC CCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATATGGTATGCAG CCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATC TACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGAC GTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGC TCCACCATGGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGACGC GCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAG CCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGT TCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGT GTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACCAG GCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCC GTCAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTGAG GTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGT GAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGGTC AAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAG CTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCC GGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGC CGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCT GGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACC ATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGC CCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGC AACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGAC TACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCC GTCTGCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGT GTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGC ACTGGTCTGTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGGTGGCTCCGAGGGT CGTGTCGAGGTCAGCGTCTAA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g8684.t1 ATGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGCTTCGACCCC CCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATAGTAAGTGGCG GCCTGTAGCCGTGCTCAATTGTTCTGGCTGACAATCTGCCACAGTGGTATGCAGCCCCGGGCTGTCCAGGGTATG CTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTC GTGAGCAAGATGTATGGTAAACCAGATCCCTTCTCTTGAATTGAGATACTGATACAATTATAGGTACTGGGGTAC CAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGACGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGT CAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGC CATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGAGTAAGTTCTGCTTCTGAGACACACCATGCTGCTCTCCGCTAACAGCA GAACAGCGCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGCTACCGTTGGT GGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTAC CGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACC ACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTC CGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTC ATCGAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTC AAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAG GCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGAC GACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGG GCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTT CTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGG TTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCT GCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGT CTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAG GGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGAGTAAGTGAACCCTCATTTGTACC TGAAAAGTTGAACAGCTTTAACTGACTATGCACAGTCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCC CGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGACTACGCCAT TGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTT CGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAA CGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCT GTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGA GGTCAGCGTCTAA |