Protein ID | Ani_SJS100_1|g78.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_001:265447..267422 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 1975 |
Transcript length (bp) | 1797 |
Coding sequence length (bp) | 1797 |
Protein length (aa) | 599 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF10355 | Ytp1 | Protein of unknown function (Ytp1) | 1.4E-116 | 288 | 577 |
PF10348 | DUF2427 | Domain of unknown function (DUF2427) | 1.0E-32 | 56 | 156 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
Yes | 1 - 23 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 7 | 26 | 19 |
2 | 69 | 91 | 22 |
3 | 104 | 121 | 17 |
4 | 136 | 158 | 22 |
5 | 283 | 302 | 19 |
6 | 312 | 334 | 22 |
7 | 368 | 390 | 22 |
8 | 395 | 414 | 19 |
9 | 486 | 505 | 19 |
10 | 520 | 542 | 22 |
11 | 554 | 576 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g78.t1 MWQRASRAALAAAFLLVSVANALPHGDDEAMDMDMGMDMSHSESTQESSTEANDDSPMSYFAYGKHGTAIAVHIG LMILAWCFILPTAVMFSVARSRFALPSQFLFLVCNAVGLLIGIIYNSQTPDLYENNAHHKIGWIATWVMSAQVIM SLIFAYAGRGESESTSYERAAFLPVSTDEMESPQMYSGGVRHSYRWSRDSGQGTERNSSSLHSRPGSPSCASPSD EYDGFEKPEDPLPEPSSQPRGWFRIPFADRFLASRVPRLVSTRALRIISTIYAVIDRIILPFGFVAIATGGVTYG GLMRGKEVFNGLAHFIKGGIFFWYGLLTLGRMLGCWADLGWAWNVKPSSPIVGKCKAKIPTGEFTESFVIFLYGV TNVFLEHLTGWGGAWTATDLEHVSISIMFFGGGLCGMLFESKRVKGWLNSTVLQYPSHMSAHTSADTAWQLPDTQ GVSLNPMPALVILLLGMMMGSHHQDSMVSTMVHKQWGNLLVGFALARGMTYVIMYLKPPTSYLPSRPPTEIVAAF CLISGGLVFMLSTRSVIQTLEYYDLDAMFVFTVTMGLTAFIMSCEILAIALKAWAVKRESRPALPPFQFPASA* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g78.t1 ATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCAC GGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACA GAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGCGATTGCGGTTCACATCGGT CTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGCCGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTG CCGTCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCATCTACAACAGCCAGACCCCC GATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATG TCGTTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTT TCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGATGTACTCTGGTGGTGTTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGT GGACAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGAT GAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATC CCCTTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACC ATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGT GGTCTCATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGT CTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCC ATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTT ACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATC TCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGT ACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAG GGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGGTTCGCACCACCAGGAT AGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACC TATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTC TGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTC GACGCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTGCGAAATTCTCGCCATTGCC TTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g78.t1 ATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCAC GGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACA GAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGCGATTGCGGTTCACATCGGT CTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGCCGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTG CCGTCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCATCTACAACAGCCAGACCCCC GATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATG TCGTTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTT TCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGATGTACTCTGGTGGTGTTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGT GGACAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGAT GAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATC CCCTTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACC ATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGT GGTCTCATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGT CTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCC ATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTT ACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATC TCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGT ACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAG GGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGGTTCGCACCACCAGGAT AGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACC TATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTC TGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTC GACGCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTGCGAAATTCTCGCCATTGCC TTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g78.t1 ATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCAC GGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACA GAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGCGATTGCGGTTCACATCGGT CTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGCCGACAGGTATAGCTCCATTTTATCTAACCCTCACAAAGACACAG AAAACTAACACTTTGCAATAACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCGTCGCAATTCC TTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGA ACAACGCTCATCACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCGTTGATCTTTG CCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGA TGGAGAGCCCCCAGATGTACTCTGGTGGTGTTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGACAGGGCACGG AGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTT TCGAAAAGCCCGAGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCCTTCGCCGACC GATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTA TCGACAGAATCATCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGTCTCATGGTAA GTTTCTAGGCAATAGACCGTTCTAATGAATTCTGCTAACGCGCATTGGCAGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGC CTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGG GCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACG GGTGAATTCACTGAATCATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGG GGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGT ATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCGCA CACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTC ATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGG GGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCC TACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTT AGTGTAAGTCCAGCAAAGGAACCGCGATTCATCCACAGGACATCTTAGCTGACTCATAGGACAGACCCGGAGCGT GATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCAT CATGTCGTGCGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCCCTGCGCTGCCGCC TTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGA |