Protein ID | Ani_SJS100_1|g7094.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_048:14216..15883 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 1667 |
Transcript length (bp) | 1371 |
Coding sequence length (bp) | 1371 |
Protein length (aa) | 457 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF01490 | Aa_trans | Transmembrane amino acid transporter protein | 8.2E-43 | 52 | 436 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 33 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 83 | 105 | 22 |
2 | 133 | 155 | 22 |
3 | 165 | 182 | 17 |
4 | 189 | 211 | 22 |
5 | 231 | 253 | 22 |
6 | 266 | 288 | 22 |
7 | 311 | 333 | 22 |
8 | 346 | 368 | 22 |
9 | 378 | 400 | 22 |
10 | 413 | 435 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g7094.t1 MRLDGVAPPPDAVEPKSQREKDEDVEDLKAIDNAPEVDAFGDEANAEVKYKTLKWWQCGMFMIAESVSLGVLSLP ATMTALGLVPSLILIIGLGILALYTGYVIGQFRERHPYIHNLADAGEILMGSFGRELFGLGQILFSIFIMGSHIV TFTVMMNTITDHGTCSIVFSIVAFVICLVLSLPRTIKNLTYISTASFLSIFSAVMITMIGVGVQYKGGQNISITT ETNLYTAFSGVTQIMFAYCAHVAFFGLIAEMEEPKDFPKALCLLQGFEISLYVTAAIVIYYYVGNGVDSPALGSA GPVLKKVAYGMAIPTIIGAGVVNGHVGLKYIYVRIFRKSGRMHKNDWVSVGSWIGIGVTCWVIAWIIGEGIPSFS NLVSLISSLFASWFSFGLPGAYWLHMNYGQWWSSPRKCALTIINMLIFAIGGAMCGLGLYASGKAIHDDSSRSSF SCANNA* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g7094.t1 ATGCGTTTGGACGGCGTTGCCCCTCCGCCTGATGCGGTTGAGCCCAAGAGTCAGCGGGAGAAGGACGAGGACGTG GAGGACCTCAAGGCTATCGATAATGCGCCTGAGGTAGACGCCTTTGGTGATGAAGCTAATGCGGAGGTCAAGTAC AAGACCTTGAAGTGGTGGCAATGCGGAATGTTCATGATTGCCGAATCCGTGTCGCTCGGTGTCTTGTCTCTTCCG GCTACTATGACGGCCCTGGGTCTTGTTCCCTCTCTCATCCTCATCATCGGTCTCGGTATCCTCGCCCTTTACACT GGTTATGTCATTGGTCAATTCCGTGAACGCCACCCTTACATCCACAACCTCGCCGATGCGGGAGAGATCCTCATG GGCAGCTTTGGTCGGGAGTTGTTCGGATTGGGCCAGATTCTCTTCTCCATCTTCATCATGGGTAGCCACATCGTC ACCTTCACCGTTATGATGAACACCATCACCGATCACGGTACCTGCTCCATCGTGTTCAGTATCGTTGCATTCGTC ATCTGTCTCGTTCTCTCGCTGCCTCGCACTATCAAGAACTTGACCTACATCTCCACTGCCTCCTTCCTGAGTATC TTCTCCGCGGTTATGATCACCATGATTGGTGTCGGTGTGCAGTACAAGGGTGGACAGAACATCAGCATCACCACC GAGACCAACCTGTACACGGCATTCAGCGGTGTGACCCAGATCATGTTCGCTTACTGTGCGCATGTCGCCTTCTTC GGTCTGATCGCCGAGATGGAGGAGCCCAAGGACTTCCCCAAGGCGCTGTGTCTGCTGCAGGGCTTCGAAATCTCC CTCTATGTTACCGCCGCCATCGTCATCTACTATTATGTGGGCAACGGCGTTGACTCGCCGGCCCTGGGATCGGCT GGTCCTGTCTTGAAGAAGGTGGCCTACGGCATGGCCATTCCTACGATTATCGGTGCCGGTGTGGTCAACGGACAT GTTGGTCTCAAGTACATCTACGTGCGCATCTTCCGCAAGTCGGGTCGCATGCACAAGAACGACTGGGTCTCGGTG GGATCCTGGATTGGCATTGGCGTGACCTGCTGGGTGATTGCCTGGATCATCGGCGAGGGTATCCCCTCTTTCAGC AACCTGGTCAGTCTCATCAGTTCGCTGTTTGCCAGTTGGTTCAGTTTTGGTCTGCCGGGTGCCTACTGGCTGCAC ATGAACTACGGCCAGTGGTGGTCGAGCCCGAGGAAGTGTGCTCTGACTATCATTAACATGCTCATCTTTGCCATT GGTGGCGCGATGTGCGGTCTGGGTCTGTACGCGTCCGGCAAGGCGATCCACGACGACTCGTCTCGGTCCAGCTTC TCGTGCGCCAACAATGCATAG |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g7094.t1 ATGCGTTTGGACGGCGTTGCCCCTCCGCCTGATGCGGTTGAGCCCAAGAGTCAGCGGGAGAAGGACGAGGACGTG GAGGACCTCAAGGCTATCGATAATGCGCCTGAGGTAGACGCCTTTGGTGATGAAGCTAATGCGGAGGTCAAGTAC AAGACCTTGAAGTGGTGGCAATGCGGAATGTTCATGATTGCCGAATCCGTGTCGCTCGGTGTCTTGTCTCTTCCG GCTACTATGACGGCCCTGGGTCTTGTTCCCTCTCTCATCCTCATCATCGGTCTCGGTATCCTCGCCCTTTACACT GGTTATGTCATTGGTCAATTCCGTGAACGCCACCCTTACATCCACAACCTCGCCGATGCGGGAGAGATCCTCATG GGCAGCTTTGGTCGGGAGTTGTTCGGATTGGGCCAGATTCTCTTCTCCATCTTCATCATGGGTAGCCACATCGTC ACCTTCACCGTTATGATGAACACCATCACCGATCACGGTACCTGCTCCATCGTGTTCAGTATCGTTGCATTCGTC ATCTGTCTCGTTCTCTCGCTGCCTCGCACTATCAAGAACTTGACCTACATCTCCACTGCCTCCTTCCTGAGTATC TTCTCCGCGGTTATGATCACCATGATTGGTGTCGGTGTGCAGTACAAGGGTGGACAGAACATCAGCATCACCACC GAGACCAACCTGTACACGGCATTCAGCGGTGTGACCCAGATCATGTTCGCTTACTGTGCGCATGTCGCCTTCTTC GGTCTGATCGCCGAGATGGAGGAGCCCAAGGACTTCCCCAAGGCGCTGTGTCTGCTGCAGGGCTTCGAAATCTCC CTCTATGTTACCGCCGCCATCGTCATCTACTATTATGTGGGCAACGGCGTTGACTCGCCGGCCCTGGGATCGGCT GGTCCTGTCTTGAAGAAGGTGGCCTACGGCATGGCCATTCCTACGATTATCGGTGCCGGTGTGGTCAACGGACAT GTTGGTCTCAAGTACATCTACGTGCGCATCTTCCGCAAGTCGGGTCGCATGCACAAGAACGACTGGGTCTCGGTG GGATCCTGGATTGGCATTGGCGTGACCTGCTGGGTGATTGCCTGGATCATCGGCGAGGGTATCCCCTCTTTCAGC AACCTGGTCAGTCTCATCAGTTCGCTGTTTGCCAGTTGGTTCAGTTTTGGTCTGCCGGGTGCCTACTGGCTGCAC ATGAACTACGGCCAGTGGTGGTCGAGCCCGAGGAAGTGTGCTCTGACTATCATTAACATGCTCATCTTTGCCATT GGTGGCGCGATGTGCGGTCTGGGTCTGTACGCGTCCGGCAAGGCGATCCACGACGACTCGTCTCGGTCCAGCTTC TCGTGCGCCAACAATGCATAG |
Gene | >Ani_SJS100_1|g7094.t1 ATGCGTTTGGACGGCGTTGCCCCTCCGCCTGATGCGGTTGAGCCCAAGAGTCAGCGGGAGAAGGACGAGGACGTG GAGGACCTCAAGGCTATCGATAATGCGCCTGAGGTAGACGCCTTTGGTGATGAAGCTAATGCGGAGGTCAAGTAC AAGACCTTGAAGTGGTGGTAAGTGCTTCTGTCGTGCCTGATGATAGACAATAAGCTAATGGCGCTAGGCAATGCG GAATGTGTATGTGATCAGGACGATAACTTACAAAGTGCGAGATACTAACCAGCATAGTCATGATTGCCGAATCCG TGTCGCTCGGTGTCTTGTCTCTTCCGGCTACTATGACGGCCCTGGGTCTTGTTCCGTAAGTCGGCGCCTCGATGC TTCCGCACTGCGACTAACCGGTGCAGCTCTCTCATCCTCATCATCGGTCTCGGTATCCTCGCCCTTTACACTGGT TATGTCATTGGTCAATTCCGTGAACGCCACCCTTACATCCACAACCTCGCCGATGCGGGAGAGATCCTCATGGGC AGCTTTGGTCGGGAGTTGTTCGGATTGGGCCAGATTCTCTTCTCCATCTTCATCATGGGTAGCCACATCGTCACC TTCACCGTTATGATGAACACCATCACCGATCACGGTACCTGCTCCATCGTGTTCAGTATCGTTGCATTCGTCATC TGTCTCGTTCTCTCGCTGCCTCGCACTATCAAGAACTTGACCTACATCTCCACTGCCTGTAGGTTTCCATTACCC GGTTGTGCAGGGCGACGCTAATGGATTCAGCCTTCCTGAGTATCTTCTCCGCGGTTATGATCACCATGATTGGTG TCGGTGTGCAGTACAAGGGTGGACAGAACATCAGCATCACCACCGAGACCAACCTGTACACGGCATTCAGCGGTG TGACCCAGATCATGTTCGCTTACTGTGCGCATGTCGCCTTCTTCGGTCTGATCGCCGAGATGGAGGAGCCCAAGG ACTTCCCCAAGGCGCTGTGTCTGCTGCAGGGCTTCGAAATCTCCCTCTATGTTACCGCCGCCATCGTCATCTACT ATTATGTGGGCAACGGCGTTGACTCGCCGGCCCTGGGATCGGCTGGTCCTGTCTTGAAGAAGGTGGCCTACGGCA TGGCCATTCCTACGGTGAGTCCCTCTCTCTATGTCCGACGAGGATTAGTTCTAATGGTGTGTAGATTATCGGTGC CGGTGTGGTCAACGGACATGTTGGTCTCAAGTACATCTACGTGCGCATCTTCCGCAAGTCGGGTCGCATGCACAA GAACGACTGGGTCTCGGTGGGATCCTGGATTGGCATTGGCGTGACCTGCTGGGTGATTGCCTGGATCATCGGCGA GGGTATCCCCTCTTTCAGCAACCTGGTCAGTCTCATCAGTTCGCTGTTTGCCAGTTGGTTCAGTTTTGGTCTGCC GGGTGCCTACTGGCTGCACATGAACTACGGCCAGTGGTGGTCGAGCCCGAGGAAGTGTGCTCTGACTATCATTAA CATGCTCATCTTTGCCATTGGTGGCGCGATGGTAAGTTTTCAATCTCTCTTCTCTTCTATATCAGCTCTTGCTAA TTGTTTAGTGCGGTCTGGGTCTGTACGCGTCCGGCAAGGCGATCCACGACGACTCGTCTCGGTCCAGCTTCTCGT GCGCCAACAATGCATAG |