Protein ID | Ani_SJS100_1|g5364.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_030:16675..18076 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 1401 |
Transcript length (bp) | 1278 |
Coding sequence length (bp) | 1278 |
Protein length (aa) | 426 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF03856 | SUN | Beta-glucosidase (SUN family) | 6.2E-91 | 158 | 413 |
SignalP signal predicted | Location | Score |
---|---|---|
Yes | 1 - 18 | 0.999699 |
CAZyme category | E-value | Start | End |
---|---|---|---|
GH132 | 3.1E-107 | 115 | 425 |
Orthofinder run ID | 3 |
Orthogroup | 5634 |
Change Orthofinder run |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
Download genbank file of locus (reverse complement)
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g5364.t1 MKFNTVALTLATAGMVSAQHHHQHRHHHKRSPDTEVVTVPGPTVTTFVLDGKVITFEEACDGVAKGTLKFSGNVP ANVCQSSSSTVSSSTTSPTPTASVQAAAEFIEVAVNKHSSSSSSSSSSTKTSSSYAAASSSSSASSSSSSSSSAT GVDKEFPDGELDCDTFPSEYGAVALDYLGLGGWSGIQYVTIVDEIVDTIVTGVTGDSCISGAMCSYACPAGYQKS QWPSTQGSTGQSVGGIECKNGKLHLTNKSLSKKLCIEGVGGVHVQNTMSEEVAVCRTDYPGTESETIPLAVAANS ELHPLTCPNGATYYKWENQTTSAQYYVNPKGVSTETGCQWGNGSSPIGNWAPINLGVGYNDGKWLSLFQNSPTTT TKLDFNVKIEGDNLSGSCKYEDGTFYSESGSNDSGCTVEVLSGSATYVFY* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g5364.t1 ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTCTGCTCAGCACCACCACCAGCACCGC CATCACCACAAGCGCTCCCCCGACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGAC GGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGGTACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCT GCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTCCAG GCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCGAGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAG ACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCTCCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACC GGCGTGGACAAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTCCCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTC GACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGATACCATCGTT ACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCC CAGTGGCCCAGCACCCAGGGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTT ACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAG GAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGCCAACAGC GAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTAC TATGTTAACCCCAAGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCTATCGGTAACTGG GCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACC ACCAAGCTTGACTTCAACGTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGGTACCTTC TACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTAC TAA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g5364.t1 ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTCTGCTCAGCACCACCACCAGCACCGC CATCACCACAAGCGCTCCCCCGACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGAC GGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGGTACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCT GCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTCCAG GCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCGAGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAG ACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCTCCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACC GGCGTGGACAAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTCCCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTC GACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGATACCATCGTT ACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCC CAGTGGCCCAGCACCCAGGGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTT ACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAG GAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGCCAACAGC GAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTAC TATGTTAACCCCAAGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCTATCGGTAACTGG GCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACC ACCAAGCTTGACTTCAACGTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGGTACCTTC TACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTAC TAA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g5364.t1 ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTCTGCTCAGCACCACCACCAGCACCGC CATCACCACAAGCGCTCCCCCGACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGAC GGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGGTACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCT GCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTCCAG GCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCGAGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAG ACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCTCCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACC GGCGTGGACAAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTCCCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTC GACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGATACCATCGTT ACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCC CAGTGGCCCAGCACCCAGGGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTT ACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAG GAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACTACCCTGGTAAGCATTGAACTTCTCTTCCGACAGGTGGGTCCAAACAAAGA TATTAACTCTGTCTGCAGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGCCAACAGCGAACTTCACCCCC TGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCA AGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCTATCGGTAACTGGGCCCCTATCAACC TTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACT TCAACGTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGGTACCTTCTACTCCGAGTCTG GCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTAAGTGCCCTTGCGTTTGTTTTTGGCTGGGACTTTTCGCTGATCATCATCT CCTCTCCAGGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAA |