Protein ID | Ani_SJS100_1|g3885.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_018:299190..300714 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 1524 |
Transcript length (bp) | 960 |
Coding sequence length (bp) | 960 |
Protein length (aa) | 320 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00153 | Mito_carr | Mitochondrial carrier protein | 1.2E-22 | 18 | 113 |
PF00153 | Mito_carr | Mitochondrial carrier protein | 1.2E-23 | 122 | 214 |
PF00153 | Mito_carr | Mitochondrial carrier protein | 1.4E-16 | 223 | 311 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 31 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 13 | 32 | 19 |
2 | 123 | 145 | 22 |
3 | 186 | 208 | 22 |
4 | 223 | 245 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g3885.t1 MAKGDVNQADKTVFGMPGFVVDFLMGGVSAAVSKTAAAPIERIKLLIQNQDEMLRAGRLDRKYNGIMDCFRRTAA SEGVVSLWRGNTANVIRYFPTQALNFAFRDTYKSMFSYKKERDGYTKWMMGNLASGGAAGATSLLFVYSLDYART RLANDAKSAKGGGDRQFNGLVDVYKKTLASDGIAGLYRGFGPSVAGIVVYRGLYFGMYDSIKPVVLVGPLEGNFL ASFLLGWTVTTGAGIASYPLDTIRRRMMMTSGEAVKYKSSMDAARQIVAKEGVKSLFKGAGANILRGVAGAGVLS IYDQVQLILFGKKYKGGSG* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g3885.t1 ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATG GGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAG GATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCC TCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAAC TTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATG GGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACC CGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAG AAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTAC CGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTT GCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGT CGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAG GAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCT ATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g3885.t1 ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATG GGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAG GATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCC TCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAAC TTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATG GGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACC CGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAG AAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTAC CGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTT GCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGT CGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAG GAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCT ATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g3885.t1 ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGTAAGTTCCTACTTGTCCCCTACG AGCTGAGAGGCCAGGTTGTCGGATGTCGCGCTCTCGACGGAATCGGTTCAAATTGGTCTTGAATATTAAAGATCG AGTACTACGTTCCTTGGAGACTCGACAGTCTGACGATTTGGCCGGGCTCAATGGTGTTGTTGCTGGACTAGGTGG CTAATGAAAATTTTTCACAGGGATTCGTCGTCGACTTCCTGAGTATGTGCATTCCGGCTCGCCCCGAATGATCGA TCATTGCACTACGATCGATCAATTCCCATCCCAACGAGCAACACGAATTGTGCGATGTTGATTTGAAATTGATAC TAACTACTGGTACAGTGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGC TCCTCATCCAGAACCAGGTTGGTTAAGCCTCAACACCAATGTCTTGCACTGGCGGAACGAAAATACTTTGCACGA TCTGCGGTTGCGTCTTCGAAACGACATTGCTCCGACCGAAGATTGCCAATTCAGCCGGGCGCAAAAATTTTCACT CCGGACAGTCGGGACGTGAGATCGGCCCAAACAGATGCTAATACGATTGTCCTTCAGGATGAGATGCTTCGCGCT GGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCC CTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACC TACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGT GGTGTATGTATCCCTATATCCAGTTTGATACTCGAGCGATCCCGCTAACAATCGGTTCAGGCTGCTGGTGCCACT TCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGT GGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTAC CGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAG CCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGT GCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTAC AAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCT AACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAG AAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA |