Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein IDAni_SJS100_1|g3885.t1
Gene name
Locationscaffold_018:299190..300714
Strand-
Gene length (bp)1524
Transcript length (bp)960
Coding sequence length (bp)960
Protein length (aa) 320

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PFAM Domains

PFAM Domain ID Short name Long name E-value Start End
PF00153 Mito_carr Mitochondrial carrier protein 1.2E-22 18 113
PF00153 Mito_carr Mitochondrial carrier protein 1.2E-23 122 214
PF00153 Mito_carr Mitochondrial carrier protein 1.4E-16 223 311

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]
SignalP signal predicted Location
(based on Ymax)
D score
(significance: > 0.45)
No 1 - 31 0.45

Transmembrane Domains

Domain # Start End Length
1 13 32 19
2 123 145 22
3 186 208 22
4 223 245 22

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

No expression data available for this genome

Sequences

Type of sequenceSequence
Locus Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein >Ani_SJS100_1|g3885.t1
MAKGDVNQADKTVFGMPGFVVDFLMGGVSAAVSKTAAAPIERIKLLIQNQDEMLRAGRLDRKYNGIMDCFRRTAA
SEGVVSLWRGNTANVIRYFPTQALNFAFRDTYKSMFSYKKERDGYTKWMMGNLASGGAAGATSLLFVYSLDYART
RLANDAKSAKGGGDRQFNGLVDVYKKTLASDGIAGLYRGFGPSVAGIVVYRGLYFGMYDSIKPVVLVGPLEGNFL
ASFLLGWTVTTGAGIASYPLDTIRRRMMMTSGEAVKYKSSMDAARQIVAKEGVKSLFKGAGANILRGVAGAGVLS
IYDQVQLILFGKKYKGGSG*
Coding >Ani_SJS100_1|g3885.t1
ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATG
GGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAG
GATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCC
TCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAAC
TTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATG
GGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACC
CGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAG
AAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTAC
CGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTT
GCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGT
CGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAG
GAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCT
ATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA
Transcript >Ani_SJS100_1|g3885.t1
ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATG
GGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAG
GATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCC
TCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAAC
TTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATG
GGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACC
CGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAG
AAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTAC
CGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTT
GCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGT
CGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAG
GAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCT
ATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA
Gene >Ani_SJS100_1|g3885.t1
ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGTAAGTTCCTACTTGTCCCCTACG
AGCTGAGAGGCCAGGTTGTCGGATGTCGCGCTCTCGACGGAATCGGTTCAAATTGGTCTTGAATATTAAAGATCG
AGTACTACGTTCCTTGGAGACTCGACAGTCTGACGATTTGGCCGGGCTCAATGGTGTTGTTGCTGGACTAGGTGG
CTAATGAAAATTTTTCACAGGGATTCGTCGTCGACTTCCTGAGTATGTGCATTCCGGCTCGCCCCGAATGATCGA
TCATTGCACTACGATCGATCAATTCCCATCCCAACGAGCAACACGAATTGTGCGATGTTGATTTGAAATTGATAC
TAACTACTGGTACAGTGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGC
TCCTCATCCAGAACCAGGTTGGTTAAGCCTCAACACCAATGTCTTGCACTGGCGGAACGAAAATACTTTGCACGA
TCTGCGGTTGCGTCTTCGAAACGACATTGCTCCGACCGAAGATTGCCAATTCAGCCGGGCGCAAAAATTTTCACT
CCGGACAGTCGGGACGTGAGATCGGCCCAAACAGATGCTAATACGATTGTCCTTCAGGATGAGATGCTTCGCGCT
GGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCC
CTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACC
TACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGT
GGTGTATGTATCCCTATATCCAGTTTGATACTCGAGCGATCCCGCTAACAATCGGTTCAGGCTGCTGGTGCCACT
TCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGT
GGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTAC
CGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAG
CCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGT
GCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTAC
AAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCT
AACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAG
AAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA

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