Protein ID | Ani_SJS100_1|g3726.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_017:295437..297700 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2263 |
Transcript length (bp) | 1941 |
Coding sequence length (bp) | 1941 |
Protein length (aa) | 647 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00890 | FAD_binding_2 | FAD binding domain | 2.3E-126 | 61 | 456 |
PF02910 | Succ_DH_flav_C | Fumarate reductase flavoprotein C-term | 4.4E-46 | 511 | 646 |
GO Term | Description | Terminal node |
---|---|---|
GO:0016491 | oxidoreductase activity | Yes |
GO:0003824 | catalytic activity | No |
GO:0003674 | molecular_function | No |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 21 | 0.45 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g3726.t1 MSSLGLRSLAPASKISRALGQRRLFSSSRPAARIFGNGPLRAKEAEGFIAQKYPIIDHEYDAVVVGAGGAGLRAA FGLAEAGFNTACVSKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMHEDDWRWHMYDTVKGSDWLGDQDAIHYMTREAPASVRE LEGYGCPFSRTEDGRIYQRAFGGQSKEFGKGGQAYRCCAAADRTGHALLHTLYGQSLRHNTNYFIEYFALDLLME DGECRGIIAYNQEDGTLHRFKAHHTVLATGGYGRAYFSCTSAHTCTGDGMAMVARAGLPNQDLEFVQFHPTGIYG AGCLITEGSRGEGGYLLNSEGERFMERYAPTAKDLASRDVVSRSMTLEIREGRGVGPEKDHIYLQLSHLPAKLLH ERLPGISETASIFAGVDVTKQPIPVLPTVHYNMGGIPTKYTGEVLTQDENGNDQVVPGLYACGEAACVSVHGANR LGANSLLDLVVFGRAVSHRVRDIATPGKPHKELSSDAGAQSIADLDFVRTAEGPKSTNDIRSAMQKAMQSDVSVF RTQESLDEGVEKVTAIDQMFDQVGTKDRSMIWNSDLVETLELRNLLTCASQTAIAAANRKESRGAHAREDYPDRD DENWMKHTLTWQKKPHGEVKLGYRAVEHNTLDENECKSVPPFKRVY* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g3726.t1 ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTC TCCTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCT CAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCT TTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCC GCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTG AAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAG CTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCG AAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCAC ACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAG GACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACC GTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATG GCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGT GCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATG GAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGT GAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCAC GAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTC CTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAAC GGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGT CTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACC CCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACC GCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTC CGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACC AAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCTTCC CAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGAC GACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCC GTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAG |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g3726.t1 ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTC TCCTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCT CAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCT TTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCC GCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTG AAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAG CTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCG AAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCAC ACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAG GACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACC GTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATG GCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGT GCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATG GAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGT GAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCAC GAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTC CTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAAC GGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGT CTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACC CCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACC GCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTC CGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACC AAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCTTCC CAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGAC GACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCC GTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAG |
Gene | >Ani_SJS100_1|g3726.t1 ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGGTCTGTATCCGACTTCTTTTGCCGTGATGCCGA ATTCTGGCTCACCATATTCTCCTCTATCCTCAATGGTCTTACTGACTCCTCTTGTTGGCGCAGATTTCCCGCGCT TTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGGTACGCATTGAACTCGCACATCCGCCCCTGCCTAC GTTTGCTAACTGGTCCCTCCGCTAGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTC ATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTGTAAGCTACTATGTGGATATATCTTGTGGGAACGATGGTCGCTAATGCAAT TGCAGGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGG AAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTA TCAACGCCGCTCTTGGAAAGTGAGTTGCCCTGTATTGACTCCATTGCGAGTGGCGCTAATGGTCTGGCTTGCAGC ATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCC ATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACC GAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGT TGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACC AACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAAC CAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTAC TTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAG GATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGT GAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCC TCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCAC ATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCT ATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATC CCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCT TGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTC TTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGAC GCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGC AGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAG AAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTT GTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCGTATGTATTCCTGCAGAGTTTTGTAATGTTGGATGTT GGCTAACTCGAGTTATAGTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCG TGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGA GGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAA GCGTGTTTACTAG |