Protein ID | Ani_SJS100_1|g3714.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_017:245186..248273 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 3087 |
Transcript length (bp) | 2973 |
Coding sequence length (bp) | 2973 |
Protein length (aa) | 991 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00122 | E1-E2_ATPase | E1-E2 ATPase | 8.5E-38 | 184 | 407 |
PF00702 | Hydrolase | haloacid dehalogenase-like hydrolase | 3.4E-17 | 425 | 691 |
PF00690 | Cation_ATPase_N | Cation transporter/ATPase, N-terminus | 8.2E-10 | 86 | 140 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 32 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 122 | 144 | 22 |
2 | 148 | 166 | 18 |
3 | 337 | 359 | 22 |
4 | 379 | 401 | 22 |
5 | 736 | 758 | 22 |
6 | 762 | 781 | 19 |
7 | 801 | 823 | 22 |
8 | 866 | 888 | 22 |
9 | 909 | 931 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g3714.t1 MAERRISYAPDVENGDHSRAPQLDDGAGLDEYAALNRYISTAPDKRRGSTASAGGVSAGKKKKGFSLFGKKGDGV EDGFVCPDDWLETDMRSGLRSSDIEPRRKRTGWNELTTEKTNFFVQFIGYFRGPILYVMELAVCLAAGLRDWIDF GVIIGILMLNAIVGWYQEKQAADVVASLKGDIAMKAIVIRDGQEQEILARELVTGDIIVIEEGTVVPADIRLICD YDKPENFETYKEYLATVGDDTLKEKEDEDDEDGGIEARAGVSLVAVDQSAITGESLAVDKYMADTCYYTTGCKRG KAYAIVTATARHSFVGKTAALVQGAQDQGHFKAVMDNIGTTLLVLVMFWILAAWIGGFYRHLKIATPENEDRNLL HYTLILLIIGVPVGLPVVTTTTLAVGAAYLAEQKAIVQKLTAIESLAGVDILCSDKTGTLTANQLSIREPYVNEG VDVNWMMAVAAIASNHNIKNLDPIDKVTIMTLRRYPKAREILARNWVTEKYTPFDPVSKRITTICTCDGVRYVCA KGAPKAILNMSQCSEEEADKFREKAAEFARRGFRSLGVAVQKEGEPWQLLGMYPMFDPPREDTAHTIAEAQHLGL SVKMLTGDALAIAKETCKMLALSTKVYDSERLIHGGLAGSAQHDLVEKADGFAEVFPEHKYQVVEMLQQRGHLTA MTGDGVNDAPSLKKADCGIAVEGSTEAAQAAADIVFLAPGLSTIVDAIKLARQIFQRMKAYIQYRIALCLHLEVY LVTSMIIIDETIRADLIVFIALFADLATIAIAYDNAHYEQRPVEWQLPKIWVISVILGILLAGATWIIRASLFLT NGGIIQNFGSPQEILFLEVALTENWLIFVTRGGKTWPSWQLVGAIFIVDVLATLFCVFGWLSGDYLQTHPVDRAD FSVNGDVDIVTVVVVWGYSIGVTIIIAVVYYLLTIIPFLDNLGRKTRSRADTQIENLLGHLSKLAIEHEVDAHGK SRYMLGARAEVEEDE* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g3714.t1 ATGGCGGAGCGGAGGATTTCCTATGCTCCCGACGTGGAGAATGGTGACCATTCTCGCGCTCCTCAACTTGATGAT GGTGCTGGTCTCGACGAGTACGCCGCGTTGAACCGTTACATCTCGACCGCCCCCGACAAGCGCCGCGGTTCGACT GCTAGTGCCGGTGGCGTGAGTGCCGGCAAGAAGAAGAAGGGTTTCTCCCTCTTCGGTAAGAAGGGTGATGGTGTG GAGGATGGCTTCGTCTGCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACATGCGCTCCGGTCTGCGCTCCAGCGACATCGAG CCTCGTCGCAAGCGTACCGGGTGGAACGAGCTGACCACCGAGAAGACCAACTTCTTCGTTCAGTTCATTGGTTAC TTCCGTGGTCCTATTCTTTATGTTATGGAATTGGCTGTCTGTCTTGCTGCTGGTCTTCGTGACTGGATCGATTTC GGTGTCATTATTGGTATTCTTATGCTTAACGCTATCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGACGTTGTC GCTTCCCTCAAGGGTGATATTGCTATGAAGGCCATCGTCATTCGTGATGGTCAGGAACAGGAAATCCTTGCCCGT GAACTTGTTACTGGTGATATTATCGTTATCGAGGAAGGTACCGTTGTCCCCGCCGATATTCGCCTGATCTGTGAC TACGACAAGCCCGAGAACTTCGAGACCTACAAGGAGTACCTCGCCACCGTTGGTGACGACACCCTTAAGGAGAAG GAGGATGAGGACGACGAGGATGGTGGCATTGAGGCCCGTGCCGGTGTCTCTCTCGTCGCCGTTGACCAGTCCGCC ATCACTGGTGAATCTCTCGCTGTCGACAAGTACATGGCCGACACTTGCTACTACACCACTGGTTGCAAGCGTGGT AAGGCCTACGCTATCGTTACTGCCACCGCCAGACACTCTTTCGTCGGTAAGACCGCTGCTCTCGTTCAGGGTGCC CAGGACCAGGGTCACTTCAAGGCTGTCATGGACAACATCGGTACCACCCTGCTTGTTCTTGTCATGTTCTGGATT CTCGCTGCCTGGATCGGTGGTTTCTACCGTCACCTCAAGATCGCTACTCCCGAGAACGAGGACCGCAACTTGCTC CACTACACCCTGATTCTCCTGATCATTGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCTGTC GGTGCTGCCTACTTGGCTGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGCCATTGAGTCCCTTGCCGGTGTCGAC ATTCTCTGCTCTGACAAGACTGGTACCCTCACTGCCAACCAGCTCTCCATCCGTGAGCCCTACGTCAACGAGGGT GTCGATGTTAACTGGATGATGGCTGTCGCTGCCATTGCCTCCAACCACAACATCAAGAACCTCGACCCCATTGAC AAGGTCACTATCATGACCCTCCGTCGTTACCCCAAGGCCCGTGAGATTCTCGCCCGCAACTGGGTCACCGAGAAG TACACTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACCATCTGTACCTGCGATGGTGTCCGCTACGTCTGCGCC AAGGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCAACATGTCCCAGTGCTCTGAGGAGGAGGCCGACAAGTTCCGTGAGAAGGCT GCTGAGTTCGCTCGTCGTGGTTTCCGTTCCCTCGGTGTTGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAACTGCTG GGCATGTACCCCATGTTCGACCCCCCCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGCACCTTGGTCTG TCCGTCAAGATGTTGACTGGTGATGCTCTCGCTATTGCCAAGGAAACCTGCAAGATGCTTGCTCTTTCTACTAAG GTCTACGACTCCGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTTGCTGGCTCTGCTCAGCACGATCTCGTTGAGAAGGCTGAC GGTTTCGCTGAGGTCTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGCTCCAGCAGCGTGGTCACTTGACTGCC ATGACTGGTGACGGTGTCAACGACGCTCCCTCTCTCAAGAAGGCTGACTGCGGTATCGCTGTCGAGGGTTCCACT GAGGCTGCCCAGGCTGCTGCCGATATTGTCTTCCTTGCCCCCGGTCTGTCCACCATTGTTGATGCCATCAAGCTC GCCCGTCAGATCTTCCAGCGTATGAAGGCCTACATCCAGTACCGTATTGCTCTGTGTCTCCACCTTGAGGTCTAC CTTGTCACCTCCATGATCATCATTGACGAGACCATCCGTGCCGATCTGATTGTCTTCATTGCCCTGTTCGCTGAT TTGGCCACCATCGCCATTGCCTACGACAACGCCCACTACGAACAGCGCCCCGTCGAGTGGCAGCTGCCCAAGATC TGGGTGATTTCCGTCATCCTTGGTATCCTCCTGGCTGGCGCCACCTGGATCATCCGTGCCTCCCTCTTCCTCACC AACGGTGGTATTATCCAGAACTTCGGTTCTCCCCAGGAAATCCTCTTCCTCGAGGTTGCCCTTACCGAGAACTGG CTCATCTTCGTCACCCGTGGTGGTAAGACCTGGCCCTCTTGGCAGCTGGTTGGCGCCATCTTCATTGTCGATGTG CTCGCCACCCTGTTCTGTGTCTTCGGCTGGCTCTCCGGCGACTACCTCCAGACCCACCCCGTTGACCGTGCCGAC TTCTCCGTCAACGGTGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTTGTCTGGGGTTACTCCATTGGTGTCACCATCATC ATCGCTGTGGTGTACTATCTCCTTACCATCATCCCCTTCCTTGACAACCTTGGTCGCAAGACCCGCTCTCGCGCT GACACCCAGATCGAGAACCTGCTTGGCCACCTGTCCAAGCTGGCCATCGAGCACGAGGTCGACGCCCACGGCAAG AGCCGCTACATGCTGGGTGCTCGCGCTGAGGTCGAAGAGGATGAGTAA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g3714.t1 ATGGCGGAGCGGAGGATTTCCTATGCTCCCGACGTGGAGAATGGTGACCATTCTCGCGCTCCTCAACTTGATGAT GGTGCTGGTCTCGACGAGTACGCCGCGTTGAACCGTTACATCTCGACCGCCCCCGACAAGCGCCGCGGTTCGACT GCTAGTGCCGGTGGCGTGAGTGCCGGCAAGAAGAAGAAGGGTTTCTCCCTCTTCGGTAAGAAGGGTGATGGTGTG GAGGATGGCTTCGTCTGCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACATGCGCTCCGGTCTGCGCTCCAGCGACATCGAG CCTCGTCGCAAGCGTACCGGGTGGAACGAGCTGACCACCGAGAAGACCAACTTCTTCGTTCAGTTCATTGGTTAC TTCCGTGGTCCTATTCTTTATGTTATGGAATTGGCTGTCTGTCTTGCTGCTGGTCTTCGTGACTGGATCGATTTC GGTGTCATTATTGGTATTCTTATGCTTAACGCTATCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGACGTTGTC GCTTCCCTCAAGGGTGATATTGCTATGAAGGCCATCGTCATTCGTGATGGTCAGGAACAGGAAATCCTTGCCCGT GAACTTGTTACTGGTGATATTATCGTTATCGAGGAAGGTACCGTTGTCCCCGCCGATATTCGCCTGATCTGTGAC TACGACAAGCCCGAGAACTTCGAGACCTACAAGGAGTACCTCGCCACCGTTGGTGACGACACCCTTAAGGAGAAG GAGGATGAGGACGACGAGGATGGTGGCATTGAGGCCCGTGCCGGTGTCTCTCTCGTCGCCGTTGACCAGTCCGCC ATCACTGGTGAATCTCTCGCTGTCGACAAGTACATGGCCGACACTTGCTACTACACCACTGGTTGCAAGCGTGGT AAGGCCTACGCTATCGTTACTGCCACCGCCAGACACTCTTTCGTCGGTAAGACCGCTGCTCTCGTTCAGGGTGCC CAGGACCAGGGTCACTTCAAGGCTGTCATGGACAACATCGGTACCACCCTGCTTGTTCTTGTCATGTTCTGGATT CTCGCTGCCTGGATCGGTGGTTTCTACCGTCACCTCAAGATCGCTACTCCCGAGAACGAGGACCGCAACTTGCTC CACTACACCCTGATTCTCCTGATCATTGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCTGTC GGTGCTGCCTACTTGGCTGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGCCATTGAGTCCCTTGCCGGTGTCGAC ATTCTCTGCTCTGACAAGACTGGTACCCTCACTGCCAACCAGCTCTCCATCCGTGAGCCCTACGTCAACGAGGGT GTCGATGTTAACTGGATGATGGCTGTCGCTGCCATTGCCTCCAACCACAACATCAAGAACCTCGACCCCATTGAC AAGGTCACTATCATGACCCTCCGTCGTTACCCCAAGGCCCGTGAGATTCTCGCCCGCAACTGGGTCACCGAGAAG TACACTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACCATCTGTACCTGCGATGGTGTCCGCTACGTCTGCGCC AAGGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCAACATGTCCCAGTGCTCTGAGGAGGAGGCCGACAAGTTCCGTGAGAAGGCT GCTGAGTTCGCTCGTCGTGGTTTCCGTTCCCTCGGTGTTGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAACTGCTG GGCATGTACCCCATGTTCGACCCCCCCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGCACCTTGGTCTG TCCGTCAAGATGTTGACTGGTGATGCTCTCGCTATTGCCAAGGAAACCTGCAAGATGCTTGCTCTTTCTACTAAG GTCTACGACTCCGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTTGCTGGCTCTGCTCAGCACGATCTCGTTGAGAAGGCTGAC GGTTTCGCTGAGGTCTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGCTCCAGCAGCGTGGTCACTTGACTGCC ATGACTGGTGACGGTGTCAACGACGCTCCCTCTCTCAAGAAGGCTGACTGCGGTATCGCTGTCGAGGGTTCCACT GAGGCTGCCCAGGCTGCTGCCGATATTGTCTTCCTTGCCCCCGGTCTGTCCACCATTGTTGATGCCATCAAGCTC GCCCGTCAGATCTTCCAGCGTATGAAGGCCTACATCCAGTACCGTATTGCTCTGTGTCTCCACCTTGAGGTCTAC CTTGTCACCTCCATGATCATCATTGACGAGACCATCCGTGCCGATCTGATTGTCTTCATTGCCCTGTTCGCTGAT TTGGCCACCATCGCCATTGCCTACGACAACGCCCACTACGAACAGCGCCCCGTCGAGTGGCAGCTGCCCAAGATC TGGGTGATTTCCGTCATCCTTGGTATCCTCCTGGCTGGCGCCACCTGGATCATCCGTGCCTCCCTCTTCCTCACC AACGGTGGTATTATCCAGAACTTCGGTTCTCCCCAGGAAATCCTCTTCCTCGAGGTTGCCCTTACCGAGAACTGG CTCATCTTCGTCACCCGTGGTGGTAAGACCTGGCCCTCTTGGCAGCTGGTTGGCGCCATCTTCATTGTCGATGTG CTCGCCACCCTGTTCTGTGTCTTCGGCTGGCTCTCCGGCGACTACCTCCAGACCCACCCCGTTGACCGTGCCGAC TTCTCCGTCAACGGTGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTTGTCTGGGGTTACTCCATTGGTGTCACCATCATC ATCGCTGTGGTGTACTATCTCCTTACCATCATCCCCTTCCTTGACAACCTTGGTCGCAAGACCCGCTCTCGCGCT GACACCCAGATCGAGAACCTGCTTGGCCACCTGTCCAAGCTGGCCATCGAGCACGAGGTCGACGCCCACGGCAAG AGCCGCTACATGCTGGGTGCTCGCGCTGAGGTCGAAGAGGATGAGTAA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g3714.t1 ATGGCGGAGCGGAGGATTTCCTATGCTCCCGACGTGGAGAATGGTGACCATTCTCGCGCTCCTCAACTTGATGAT GGTGCTGGTCTCGACGAGTACGCCGCGTTGAACCGTTACATCTCGACCGCCCCCGACAAGCGCCGCGGTTCGACT GCTAGTGCCGGTGGCGTGAGTGCCGGCAAGAAGAAGAAGGGTTTCTCCCTCTTCGGTAAGAAGGGTGATGGTGTG GAGGATGGCTTCGTCTGCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACATGCGCTCCGGTCTGCGCTCCAGCGACATCGAG CCTCGTCGCAAGCGTACCGGGTGGAACGAGCTGACCACCGAGAAGACCAACTTCTTCGTTCAGTTCATTGGTTAC TTCCGTGGTCCTATTCTTTATGGTAAGGCAATCGACTCGGACATTGCATTGCAGGGATGTCTCTAACAGTGCTAT AGTTATGGAATTGGCTGTCTGTCTTGCTGCTGGTCTTCGTGACTGGATCGATTTCGGTGTCATTATTGGTATTCT TATGCTTAACGCTATCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGACGTTGTCGCTTCCCTCAAGGGTGATAT TGCTATGAAGGCCATCGTCATTCGTGATGGTCAGGAACAGGAAATCCTTGCCCGTGAACTTGTTACTGGTGATAT TGTACGTTTATTCTCCGCCGTTTCCACTCTGTCGGCACTGTCTAACATGCTTTCCTATAGATCGTTATCGAGGAA GGTACCGTTGTCCCCGCCGATATTCGCCTGATCTGTGACTACGACAAGCCCGAGAACTTCGAGACCTACAAGGAG TACCTCGCCACCGTTGGTGACGACACCCTTAAGGAGAAGGAGGATGAGGACGACGAGGATGGTGGCATTGAGGCC CGTGCCGGTGTCTCTCTCGTCGCCGTTGACCAGTCCGCCATCACTGGTGAATCTCTCGCTGTCGACAAGTACATG GCCGACACTTGCTACTACACCACTGGTTGCAAGCGTGGTAAGGCCTACGCTATCGTTACTGCCACCGCCAGACAC TCTTTCGTCGGTAAGACCGCTGCTCTCGTTCAGGGTGCCCAGGACCAGGGTCACTTCAAGGCTGTCATGGACAAC ATCGGTACCACCCTGCTTGTTCTTGTCATGTTCTGGATTCTCGCTGCCTGGATCGGTGGTTTCTACCGTCACCTC AAGATCGCTACTCCCGAGAACGAGGACCGCAACTTGCTCCACTACACCCTGATTCTCCTGATCATTGGTGTCCCC GTCGGTCTCCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCTGTCGGTGCTGCCTACTTGGCTGAGCAGAAGGCTATTGTC CAGAAGCTCACTGCCATTGAGTCCCTTGCCGGTGTCGACATTCTCTGCTCTGACAAGACTGGTACCCTCACTGCC AACCAGCTCTCCATCCGTGAGCCCTACGTCAACGAGGGTGTCGATGTTAACTGGATGATGGCTGTCGCTGCCATT GCCTCCAACCACAACATCAAGAACCTCGACCCCATTGACAAGGTCACTATCATGACCCTCCGTCGTTACCCCAAG GCCCGTGAGATTCTCGCCCGCAACTGGGTCACCGAGAAGTACACTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACC ACCATCTGTACCTGCGATGGTGTCCGCTACGTCTGCGCCAAGGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCAACATGTCCCAG TGCTCTGAGGAGGAGGCCGACAAGTTCCGTGAGAAGGCTGCTGAGTTCGCTCGTCGTGGTTTCCGTTCCCTCGGT GTTGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAACTGCTGGGCATGTACCCCATGTTCGACCCCCCCCGTGAGGAT ACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGCACCTTGGTCTGTCCGTCAAGATGTTGACTGGTGATGCTCTCGCTATT GCCAAGGAAACCTGCAAGATGCTTGCTCTTTCTACTAAGGTCTACGACTCCGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTT GCTGGCTCTGCTCAGCACGATCTCGTTGAGAAGGCTGACGGTTTCGCTGAGGTCTTCCCCGAGCACAAGTACCAG GTCGTCGAGATGCTCCAGCAGCGTGGTCACTTGACTGCCATGACTGGTGACGGTGTCAACGACGCTCCCTCTCTC AAGAAGGCTGACTGCGGTATCGCTGTCGAGGGTTCCACTGAGGCTGCCCAGGCTGCTGCCGATATTGTCTTCCTT GCCCCCGGTCTGTCCACCATTGTTGATGCCATCAAGCTCGCCCGTCAGATCTTCCAGCGTATGAAGGCCTACATC CAGTACCGTATTGCTCTGTGTCTCCACCTTGAGGTCTACCTTGTCACCTCCATGATCATCATTGACGAGACCATC CGTGCCGATCTGATTGTCTTCATTGCCCTGTTCGCTGATTTGGCCACCATCGCCATTGCCTACGACAACGCCCAC TACGAACAGCGCCCCGTCGAGTGGCAGCTGCCCAAGATCTGGGTGATTTCCGTCATCCTTGGTATCCTCCTGGCT GGCGCCACCTGGATCATCCGTGCCTCCCTCTTCCTCACCAACGGTGGTATTATCCAGAACTTCGGTTCTCCCCAG GAAATCCTCTTCCTCGAGGTTGCCCTTACCGAGAACTGGCTCATCTTCGTCACCCGTGGTGGTAAGACCTGGCCC TCTTGGCAGCTGGTTGGCGCCATCTTCATTGTCGATGTGCTCGCCACCCTGTTCTGTGTCTTCGGCTGGCTCTCC GGCGACTACCTCCAGACCCACCCCGTTGACCGTGCCGACTTCTCCGTCAACGGTGATGTCGACATTGTCACCGTC GTTGTTGTCTGGGGTTACTCCATTGGTGTCACCATCATCATCGCTGTGGTGTACTATCTCCTTACCATCATCCCC TTCCTTGACAACCTTGGTCGCAAGACCCGCTCTCGCGCTGACACCCAGATCGAGAACCTGCTTGGCCACCTGTCC AAGCTGGCCATCGAGCACGAGGTCGACGCCCACGGCAAGAGCCGCTACATGCTGGGTGCTCGCGCTGAGGTCGAA GAGGATGAGTAA |