Protein ID | Ani_SJS100_1|g3643.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_017:54341..57170 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2829 |
Transcript length (bp) | 2829 |
Coding sequence length (bp) | 2829 |
Protein length (aa) | 943 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
Yes | 1 - 19 | 0.45 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g3643.t1 MRSDKLLVLAGLASYALALPTKDLDPRTFGLVAEILTDLGEDLTGFIEALLGGGVKSSASLLTGISAQAAAVLEG GALGCTAGKIEASARAELAAWIRAHASFDASLKSSLLAWCEGEDSATLSVDVRAGLALFIPTCAEVAAKGDIYVT VDGIFSVSELEAAVVLSSSFQSTLSTFLSGSVGVELDADIKAGLSLCAGGGVVADLASDIEASLKVWLSGSECSL SASLKAAVLAWLEGKASVSGVVTIGTVPTAGLTTVSVGAAINALVETSGALTASAQAYLSAFLKSSLAADIEADV KVVLEACISGKLATSVSADARAALAVWLSGDSCQLGVELKAVLYFWLSFALSGDVTVDLSTDIITELETFITGTI DTLIGVNISGVLSLLLSGESLASLSLESRAELSAVIGGCAGVDISSSIEIIVIEWLTGCSIPGGPSIGSGSGSSS GSSSKLIPSASSIPAVASTPAVSVPAVPTVSVPTGGSSPSKPAQSGAPGVPSGGVVPSSPAQSGAPGSPNGVSPT DTPSVPSSPAQSGAPGSPSGGVPAPSGGVVPSSPAQSGAPGAPSGGVVPTASVPEGASAGASTTPCDTITGETVV PVATMTEGGSAPSAPAQSGAPSVTPIVGGGAGGSTGGSTGGSGSGGAAPSGSVVPAGPSGSVPAVPTASVPEGAS AGASTTPCDTITGQTVVPVATMTEGGSAPSVPAQSGGVVPSAPAQSGAPGAPSGAPAPSGGVVPSSPAQSGAPGA PSGGASVPAVPTASVPEGASAGASTTPCDTLTGQTVVPVATMTEGGSAPSAPAESGAPGAPSGVSPSETPAAPAQ SGSGNAPSGGSPAPSGGVVPSGAASVPAVPTASVPEGASAGASTTPCDTITGQTVVPVATETVTPVPVATSATEG GSSPQITTAPVAGSGSGSGSGSETEVVTVTVTATVSVSACDW* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g3643.t1 ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCTCGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGAC CCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCGAGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGCTCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGT GGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCAAGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGGTGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTC GATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGTTCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAGCTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCT ACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTGTCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTGGCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTG AGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCCTTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAACGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCC CTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACCTCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAGCGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCA GTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCCAGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACTCGAGACTTTCATCACCGGTACCATC GACACTCTCATCGGTGTCAACATTAGCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGTTGATATCAGCTCCTCCATTGAGATC ATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCTGCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGCTTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCT GCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCACTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGGATCCCCCAACGGTGTCAGCCCTACC GACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCCTCTGGCGGCGTCCCCGCTCCC AGCGGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGCCCCTAGCGGCGGTGTTGTCCCCACT GCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTGCCGGTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTT CCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCAGTCTGGTGCTCCTAGCGTTACCCCC ATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCTCTACTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCT GGTAGCGTTGTTCCCGCCGGTCCCTCCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTCCCCGAGGGCGCCAGC GCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGC GGCTCTGCCCCCAGTGTCCCTGCTCAGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAGTCCGGTGCTCCTGGT GCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCT CCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACC ACTCCCTGCGACACCCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCCCCCAGT GCCCCTGCTGAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAGCCCCTCCGAGACCCCTGCCGCTCCCGCTCAG TCTGGCTCTGGCAACGCTCCCAGCGGTGGCTCTCCCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCTGCTAGC GTCCCTGCTGTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCATC ACCGGCCAGACTGTCGTCCCTGTCGCTACCGAGACCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACTGAGGGC GGTTCCTCTCCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCTGGCTCTGAGACTGAG GTGGTTACTGTCACCGTCACTGCTACTGTGAGCGTTTCGGCTTGCGACTGGTAA |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g3643.t1 ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCTCGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGAC CCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCGAGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGCTCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGT GGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCAAGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGGTGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTC GATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGTTCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAGCTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCT ACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTGTCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTGGCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTG AGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCCTTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAACGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCC CTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACCTCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAGCGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCA GTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCCAGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACTCGAGACTTTCATCACCGGTACCATC GACACTCTCATCGGTGTCAACATTAGCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGTTGATATCAGCTCCTCCATTGAGATC ATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCTGCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGCTTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCT GCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCACTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGGATCCCCCAACGGTGTCAGCCCTACC GACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCCTCTGGCGGCGTCCCCGCTCCC AGCGGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGCCCCTAGCGGCGGTGTTGTCCCCACT GCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTGCCGGTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTT CCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCAGTCTGGTGCTCCTAGCGTTACCCCC ATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCTCTACTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCT GGTAGCGTTGTTCCCGCCGGTCCCTCCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTCCCCGAGGGCGCCAGC GCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGC GGCTCTGCCCCCAGTGTCCCTGCTCAGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAGTCCGGTGCTCCTGGT GCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCT CCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACC ACTCCCTGCGACACCCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCCCCCAGT GCCCCTGCTGAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAGCCCCTCCGAGACCCCTGCCGCTCCCGCTCAG TCTGGCTCTGGCAACGCTCCCAGCGGTGGCTCTCCCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCTGCTAGC GTCCCTGCTGTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCATC ACCGGCCAGACTGTCGTCCCTGTCGCTACCGAGACCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACTGAGGGC GGTTCCTCTCCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCTGGCTCTGAGACTGAG GTGGTTACTGTCACCGTCACTGCTACTGTGAGCGTTTCGGCTTGCGACTGGTAA |
Gene | >Ani_SJS100_1|g3643.t1 ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCTCGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGAC CCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCGAGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGCTCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGT GGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCAAGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGGTGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTC GATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGTTCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAGCTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCT ACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTGTCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTGGCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTG AGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCCTTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAACGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCC CTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACCTCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAGCGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCA GTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCCAGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACTCGAGACTTTCATCACCGGTACCATC GACACTCTCATCGGTGTCAACATTAGCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGTTGATATCAGCTCCTCCATTGAGATC ATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCTGCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGCTTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCT GCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCACTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGGATCCCCCAACGGTGTCAGCCCTACC GACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCCTCTGGCGGCGTCCCCGCTCCC AGCGGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGCCCCTAGCGGCGGTGTTGTCCCCACT GCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTGCCGGTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTT CCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCAGTCTGGTGCTCCTAGCGTTACCCCC ATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCTCTACTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCT GGTAGCGTTGTTCCCGCCGGTCCCTCCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTCCCCGAGGGCGCCAGC GCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGC GGCTCTGCCCCCAGTGTCCCTGCTCAGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAGTCCGGTGCTCCTGGT GCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCT CCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACC ACTCCCTGCGACACCCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCCCCCAGT GCCCCTGCTGAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAGCCCCTCCGAGACCCCTGCCGCTCCCGCTCAG TCTGGCTCTGGCAACGCTCCCAGCGGTGGCTCTCCCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCTGCTAGC GTCCCTGCTGTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCATC ACCGGCCAGACTGTCGTCCCTGTCGCTACCGAGACCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACTGAGGGC GGTTCCTCTCCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCTGGCTCTGAGACTGAG GTGGTTACTGTCACCGTCACTGCTACTGTGAGCGTTTCGGCTTGCGACTGGTAA |