Protein ID | Ani_SJS100_1|g10596.t1 |
Gene name | |
Location | scaffold_123:40738..43569 |
Strand | - |
Gene length (bp) | 2831 |
Transcript length (bp) | 2100 |
Coding sequence length (bp) | 2100 |
Protein length (aa) | 700 |
PFAM Domain ID | Short name | Long name | E-value | Start | End |
---|---|---|---|---|---|
PF00702 | Hydrolase | haloacid dehalogenase-like hydrolase | 3.5E-11 | 374 | 492 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
No | 1 - 54 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 529 | 551 | 22 |
2 | 570 | 592 | 22 |
3 | 635 | 657 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Ani_SJS100_1|g10596.t1 MENSLHSPDTFEGAALDKYTLINRYISIALVKRRGLTSSAGALSAKAADKKPWCAFWKKSGDGVEAGFVRPDERF ETDMRSYLRAFDIEPRRKRTGFNGLTAAKTNFFVQSTGYSRAGSSMCHRRYPVPQHYRRLVTGEAGPDVAAPMRG DIAMNATAFRAWQAQEILACELVTGDIVVTEEDTTAPADVRLICDYDKPEKFETYRDKAYAVVTVTARQTFVGKT AAFVQGANDSAHSKAIVDYMGGTFLILVMFWIKVIIQKLTAIESLAGVDVLCFNKTGTLIADQLSIRGPYVNEGD DGNWVMSVAAIASNHNVKNLGPIDKATIPHPPPAILNMSQCSEEEVQKFRDKATESARCSSAPSGLPSRRRVSRG SFFGMYPMFDPPREVTAHAVAEAQHLGLQVKMVTGDASAIAKETCKMLALQGLRFERLIHGVLAGSAQNDLVEKA VDTAVVSPEHKLQVVEMLQQRGHLRAMTSDGVNDAPYLKKVDCGITVEGSTKSAQAAADIVFLAPRLSTIVDAIK LARQIFQHLIVFTALFAVLTPVAVAYDNAHFEARPVEWQLPKVSVISVIPEIIFLEVSLTGNWLIFLTRWAKPGL RGSWLAPSSAGSLGEYEPTNSPSGAKFSVNSDVDIFTVVVIWAYSIGVVIVIAVVYYLLTLVAALDIEHPSEEHA HPSPSSPLSTRLAVSFGTATLWGL* |
Coding | >Ani_SJS100_1|g10596.t1 ATGGAGAACAGTCTACATTCCCCTGATACATTTGAAGGAGCTGCTCTTGATAAGTACACTCTTATCAACCGTTAT ATCTCCATCGCCCTGGTCAAGCGCCGTGGATTGACTTCTTCTGCTGGTGCTCTGAGCGCCAAGGCAGCAGATAAG AAGCCCTGGTGCGCTTTCTGGAAGAAGAGTGGTGATGGGGTCGAGGCCGGTTTTGTCCGCCCTGACGAGCGGTTC GAGACCGATATGCGCTCTTATCTGCGGGCTTTCGACATTGAGCCTCGTCGTAAGCGGACCGGTTTCAACGGATTG ACCGCTGCGAAGACCAACTTCTTCGTCCAGTCAACCGGTTACTCCCGGGCCGGATCCTCTATGTGTCATCGTCGG TATCCTGTTCCTCAACACTATCGTCGGTTGGTAACAGGAGAAGCAGGCCCCGATGTCGCCGCGCCTATGAGAGGT GATATTGCCATGAATGCGACTGCTTTTCGTGCTTGGCAGGCGCAGGAGATCCTGGCTTGTGAGCTCGTTACCGGT GATATCGTCGTCACCGAGGAAGACACCACCGCTCCAGCTGATGTCCGCCTCATCTGTGACTATGACAAGCCCGAA AAATTCGAGACCTATCGGGATAAGGCCTACGCCGTCGTTACCGTTACCGCTCGCCAGACTTTTGTCGGTAAGACC GCTGCATTCGTTCAGGGGGCCAACGACTCCGCTCACTCCAAGGCCATTGTGGACTACATGGGTGGTACTTTCCTG ATCTTGGTCATGTTCTGGATTAAGGTCATCATCCAGAAGCTCACCGCCATTGAATCTCTTGCTGGGGTTGACGTT CTTTGCTTCAATAAGACTGGTACCCTCATCGCTGACCAGCTATCCATCCGGGGGCCCTACGTCAATGAAGGCGAC GACGGCAACTGGGTGATGTCTGTCGCCGCCATTGCTTCGAACCACAACGTCAAGAACCTCGGCCCGATCGATAAG GCGACCATCCCCCACCCTCCACCGGCCATCCTGAACATGTCCCAGTGCTCCGAGGAGGAGGTTCAGAAGTTCCGC GACAAGGCTACTGAGTCCGCTCGGTGTAGTTCCGCTCCCTCGGGGTTGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCGTGGT AGCTTCTTCGGCATGTACCCCATGTTCGACCCGCCGCGGGAGGTCACTGCCCACGCCGTTGCCGAGGCTCAGCAC CTGGGTCTCCAGGTCAAGATGGTCACCGGTGACGCCAGCGCCATTGCCAAGGAAACTTGCAAGATGCTTGCCCTC CAAGGTTTACGATTCGAGCGCCTGATCCACGGGGTCCTTGCTGGCTCTGCCCAGAACGACCTCGTCGAGAAGGCC GTTGATACCGCTGTGGTGTCCCCAGAGCACAAGCTCCAGGTCGTCGAGATGCTGCAGCAACGTGGTCACTTAAGA GCCATGACGAGTGATGGTGTCAACGACGCTCCCTACCTCAAGAAGGTGGACTGCGGAATCACTGTCGAGGGTTCC ACCAAGTCTGCCCAGGCTGCCGCCGATATCGTCTTCCTCGCTCCTAGGCTCTCCACCATCGTCGACGCCATCAAG CTCGCTCGTCAGATCTTTCAGCACCTCATCGTCTTCACTGCCCTTTTTGCCGTCTTAACCCCCGTTGCTGTTGCT TACGATAACGCCCACTTCGAGGCACGCCCGGTTGAGTGGCAGCTGCCCAAGGTCTCGGTCATCTCTGTTATCCCT GAGATTATCTTCCTTGAGGTGTCCCTGACTGGGAATTGGCTCATCTTCCTCACCCGGTGGGCAAAACCTGGCCTT CGTGGCAGTTGGTTGGCGCCATCTTCGGCTGGCTCCTTAGGTGAGTATGAGCCGACCAACTCTCCCTCTGGTGCT AAATTCTCCGTCAACAGCGACGTCGACATTTTCACGGTTGTGGTCATTTGGGCCTACTCCATTGGTGTTGTCATC GTCATCGCCGTGGTGTACTATCTCCTTACACTCGTCGCCGCTCTCGACATCGAACACCCAAGTGAAGAACATGCT CACCCCTCTCCAAGCTCGCCGTTGAGCACCAGGTTGGCGGTCAGCTTTGGGACCGCTACACTCTGGGGACTATAG |
Transcript | >Ani_SJS100_1|g10596.t1 ATGGAGAACAGTCTACATTCCCCTGATACATTTGAAGGAGCTGCTCTTGATAAGTACACTCTTATCAACCGTTAT ATCTCCATCGCCCTGGTCAAGCGCCGTGGATTGACTTCTTCTGCTGGTGCTCTGAGCGCCAAGGCAGCAGATAAG AAGCCCTGGTGCGCTTTCTGGAAGAAGAGTGGTGATGGGGTCGAGGCCGGTTTTGTCCGCCCTGACGAGCGGTTC GAGACCGATATGCGCTCTTATCTGCGGGCTTTCGACATTGAGCCTCGTCGTAAGCGGACCGGTTTCAACGGATTG ACCGCTGCGAAGACCAACTTCTTCGTCCAGTCAACCGGTTACTCCCGGGCCGGATCCTCTATGTGTCATCGTCGG TATCCTGTTCCTCAACACTATCGTCGGTTGGTAACAGGAGAAGCAGGCCCCGATGTCGCCGCGCCTATGAGAGGT GATATTGCCATGAATGCGACTGCTTTTCGTGCTTGGCAGGCGCAGGAGATCCTGGCTTGTGAGCTCGTTACCGGT GATATCGTCGTCACCGAGGAAGACACCACCGCTCCAGCTGATGTCCGCCTCATCTGTGACTATGACAAGCCCGAA AAATTCGAGACCTATCGGGATAAGGCCTACGCCGTCGTTACCGTTACCGCTCGCCAGACTTTTGTCGGTAAGACC GCTGCATTCGTTCAGGGGGCCAACGACTCCGCTCACTCCAAGGCCATTGTGGACTACATGGGTGGTACTTTCCTG ATCTTGGTCATGTTCTGGATTAAGGTCATCATCCAGAAGCTCACCGCCATTGAATCTCTTGCTGGGGTTGACGTT CTTTGCTTCAATAAGACTGGTACCCTCATCGCTGACCAGCTATCCATCCGGGGGCCCTACGTCAATGAAGGCGAC GACGGCAACTGGGTGATGTCTGTCGCCGCCATTGCTTCGAACCACAACGTCAAGAACCTCGGCCCGATCGATAAG GCGACCATCCCCCACCCTCCACCGGCCATCCTGAACATGTCCCAGTGCTCCGAGGAGGAGGTTCAGAAGTTCCGC GACAAGGCTACTGAGTCCGCTCGGTGTAGTTCCGCTCCCTCGGGGTTGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCGTGGT AGCTTCTTCGGCATGTACCCCATGTTCGACCCGCCGCGGGAGGTCACTGCCCACGCCGTTGCCGAGGCTCAGCAC CTGGGTCTCCAGGTCAAGATGGTCACCGGTGACGCCAGCGCCATTGCCAAGGAAACTTGCAAGATGCTTGCCCTC CAAGGTTTACGATTCGAGCGCCTGATCCACGGGGTCCTTGCTGGCTCTGCCCAGAACGACCTCGTCGAGAAGGCC GTTGATACCGCTGTGGTGTCCCCAGAGCACAAGCTCCAGGTCGTCGAGATGCTGCAGCAACGTGGTCACTTAAGA GCCATGACGAGTGATGGTGTCAACGACGCTCCCTACCTCAAGAAGGTGGACTGCGGAATCACTGTCGAGGGTTCC ACCAAGTCTGCCCAGGCTGCCGCCGATATCGTCTTCCTCGCTCCTAGGCTCTCCACCATCGTCGACGCCATCAAG CTCGCTCGTCAGATCTTTCAGCACCTCATCGTCTTCACTGCCCTTTTTGCCGTCTTAACCCCCGTTGCTGTTGCT TACGATAACGCCCACTTCGAGGCACGCCCGGTTGAGTGGCAGCTGCCCAAGGTCTCGGTCATCTCTGTTATCCCT GAGATTATCTTCCTTGAGGTGTCCCTGACTGGGAATTGGCTCATCTTCCTCACCCGGTGGGCAAAACCTGGCCTT CGTGGCAGTTGGTTGGCGCCATCTTCGGCTGGCTCCTTAGGTGAGTATGAGCCGACCAACTCTCCCTCTGGTGCT AAATTCTCCGTCAACAGCGACGTCGACATTTTCACGGTTGTGGTCATTTGGGCCTACTCCATTGGTGTTGTCATC GTCATCGCCGTGGTGTACTATCTCCTTACACTCGTCGCCGCTCTCGACATCGAACACCCAAGTGAAGAACATGCT CACCCCTCTCCAAGCTCGCCGTTGAGCACCAGGTTGGCGGTCAGCTTTGGGACCGCTACACTCTGGGGACTATAG |
Gene | >Ani_SJS100_1|g10596.t1 ATGGAGAACAGTCTACATTCCCCTGATACATTTGAAGGAGCTGCTCTTGATAAGTACACTCTTATCAACCGTTAT ATCTCCATCGCCCTGGTCAAGCGCCGTGGATTGACTTCTTCTGCTGGTGCTCTGAGCGCCAAGGCAGCAGATAAG AAGCCCTGGTGCGCTTTCTGGAAGAAGAGTGGTGATGGGGTCGAGGCCGGTTTTGTCCGCCCTGACGAGCGGTTC GAGACCGATATGCGCTCTTATCTGCGGGCTTTCGACATTGAGCCTCGTCGTAAGCGGACCGGTTTCAACGGATTG ACCGCTGCGAAGACCAACTTCTTCGTCCAGTCAACCGGTTACTCCCGGGCCGGATCCTCTATGGTGTGTTCATTG CCTACGCCAGGATGACGGGGAGAGGATAAAAGCTAATCCCCACAGTCATGGAACTCGCTGTCTGTCTCCCTGCCG GTCCTCGCGACTGGATTTGTTTCAGTGTCATCGTCGGTATCCTGTTCCTCAACACTATCGTCGGTTGGTAACAGG AGAAGCAGGCCCCGATGTCGCCGCGCCTATGAGAGGTGATATTGCCATGAATGCGACTGCTTTTCGTGCTTGGCA GGCGCAGGAGATCCTGGCTTGTGAGCTCGTTACCGGTGATATCGTCGTCACCGAGGAAGACACCACCGCTCCAGC TGATGTCCGCCTCATCTGTGACTATGACAAGCCCGAAAAATTCGAGACCTATCGGGAGTACCAAGGGGACCGAGG ACGATGATGATGGTGGCATCGAAGCGCGTGTTGGCGTGCTCCAGGTCGCTGTTGACCAATCCGCCATCACGGGCG AGTCTCTCGCCGTCGACACATATATGGCCGACACTTGCTAGTACATCACCGGTTGCGAGTGTAGTAAGGCCTACG CCGTCGTTACCGTTACCGCTCGCCAGACTTTTGTCGGTAAGACCGCTGCATTCGTTCAGGGGGCCAACGACTCCG CTCACTCCAAGGCCATTGTGGACTACATGGGTGGTACTTTCCTGATCTTGGTCATGTTCTGGATTGTCGCCGCCT GGATCGGTGGGTTCTACCGCTACCTAGAGAGCGCTACCCGGAGAACTGCAACAACAACCTGCTCTATTACACCCT GATTTTCCTGATCATCGGGGTCCCTGTCGGTCTTTCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCCGTCGGCGCCGCGT ACTCCGTCGAGCAGAAGGTCATCATCCAGAAGCTCACCGCCATTGAATCTCTTGCTGGGGTTGACGTTCTTTGCT TCAATAAGACTGGTACCCTCATCGCTGACCAGCTATCCATCCGGGGGCCCTACGTCAATGAAGGCGACGACGGCA ACTGGGTGATGTCTGTCGCCGCCATTGCTTCGAACCACAACGTCAAGAACCTCGGCCCGATCGATAAGGCGACCA TCCCCCACCCTCCACCGGTACCCCAAGGCCCGGGAATCGTCTCTCGAAACTGGGTTACCGAGAAGTACACGCCTT TCGATCCGTCCGCTACGTCTGCGCCAACGGTGCTCCCAAGGCCATCCTGAACATGTCCCAGTGCTCCGAGGAGGA GGTTCAGAAGTTCCGCGACAAGGCTACTGAGTCCGCTCGGTGTAGTTCCGCTCCCTCGGGGTTGCCGTCCAGAAG GAGGGTGAGCCGTGGTAGCTTCTTCGGCATGTACCCCATGTTCGACCCGCCGCGGGAGGTCACTGCCCACGCCGT TGCCGAGGCTCAGCACCTGGGTCTCCAGGTCAAGATGGTCACCGGTGACGCCAGCGCCATTGCCAAGGAAACTTG CAAGATGCTTGCCCTCCAAGGTTTACGATTCGAGCGCCTGATCCACGGGGTCCTTGCTGGCTCTGCCCAGAACGA CCTCGTCGAGAAGGCCGTTGATACCGCTGTGGTGTCCCCAGAGCACAAGCTCCAGGTCGTCGAGATGCTGCAGCA ACGTGGTCACTTAAGAGCCATGACGAGTGATGGTGTCAACGACGCTCCCTACCTCAAGAAGGTGGACTGCGGAAT CACTGTCGAGGGTTCCACCAAGTCTGCCCAGGCTGCCGCCGATATCGTCTTCCTCGCTCCTAGGCTCTCCACCAT CGTCGACGCCATCAAGCTCGCTCGTCAGATCTTTCAGCGTATGAAAACCTACATTCAGTACCGTATCGCTTTGTG TCTGCACCTGTGAGGTCTACCTGATCACGTCCATTATCACTATCAATGAGACCATCCGTGCAGACCTCATCGTCT TCACTGCCCTTTTTGCCGTCTTAACCCCCGTTGCTGTTGCTTACGATAACGCCCACTTCGAGGCACGCCCGGTTG AGTGGCAGCTGCCCAAGGTCTCGGTCATCTCTGTTATCCCTGGTATCCTCCTTGCCACAGCTACTTGAATCATCC GTGCCTTCCTGTCCTTAAACAACGGTGGTATTATCCAAAACTTCGGTTCTCCTCAAGAGATTATCTTCCTTGAGG TGTCCCTGACTGGGAATTGGCTCATCTTCCTCACCCGGTGGGCAAAACCTGGCCTTCGTGGCAGTTGGTTGGCGC CATCTTCGGCTGGCTCCTTAGGTGAGTATGAGCCGACCAACTCTCCCTCTGGTGCTAAATTCTCCGTCAACAGCG ACGTCGACATTTTCACGGTTGTGGTCATTTGGGCCTACTCCATTGGTGTTGTCATCGTCATCGCCGTGGTGTACT ATCTCCTTACACTCGTCGCCGCTCTCGACATCGAACACCCAAGTGAAGAACATGCTCACCCCTCTCCAAGCTCGC CGTTGAGCACCAGGTTGGCGGTCAGCTTTGGGACCGCTACACTCTGGGGACTATAG |