Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein IDAgabiH97|000920
Gene name
Locationscaffold_1:217812..219736
Strand+
Gene length (bp)1924
Transcript length (bp)1509
Coding sequence length (bp)1509
Protein length (aa) 503

Your browser does not support drawing a protein figure.

PFAM Domains

(None)

Swissprot hits

(None)

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]
SignalP signal predicted Location
(based on Ymax)
D score
(significance: > 0.45)
Yes 1 - 21 0.45

Transmembrane Domains

(None)

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

Analysis 1: Developmental stages of Agaricus bisporus (strain A15). Published in Pelkmans et al, Applied Microbiology and Biotechnology, 2016

Click here for more information

Sequences

Type of sequenceSequence
Locus Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein >AgabiH97|000920
MARIFGLLLLVAYISTYVAAFPIEPRTGNNSCKAALRQTAKSLRQSSKAIKKLASSNDNNVADAAMIAQGGLNNA
TAGMMMMASAMKDGQDAPAEVADQVSSGLNAAQSAMGNLTSTDNADDGKLKKAQSHLESAMAAGQDVIAKCGGGN
GNNDGAANGADNGAAGGNGTVIDEGGAAAGDDAGADDANADDAGADDAGVDDAGAMGGDAGAMDEAGAMGEEAGA
MGGEEGAMGGEEGAMGGEAGVMDGEAGAMDNNTADGEIDNGSGSAAGNANNNTIGGEDNIGSDNNNATETDAAAS
ATATAVYDNGSNATLTTSAVVSDATAAADNSSEVGMDGMDGAGEANGADENAGADGQDNGNGNNGGKHGNGEGNG
NGNGKGKGNGAANGAGKGDKNDGGMGGMDNASAGKGNAEVNAGQGGMPGNSGNTPAAEAGAGQAGAHGKGKGNAA
ENGESENMDAGSMADGAVEGDNAASGNKDQKAPSSGNMGAAPVRRRFRFARF*
Coding >AgabiH97|000920
ATGGCTCGTATTTTTGGCTTGTTACTTCTTGTCGCCTATATCTCAACCTACGTCGCTGCTTTCCCTATCGAACCT
CGTACAGGAAATAACTCTTGTAAAGCCGCTCTTCGTCAGACCGCTAAAAGTCTTCGTCAATCTTCCAAGGCCATC
AAGAAATTAGCATCCTCAAATGACAATAATGTGGCCGATGCTGCTATGATTGCACAAGGAGGATTAAACAATGCT
ACAGCCGGAATGATGATGATGGCTAGTGCTATGAAAGACGGACAAGACGCTCCCGCCGAAGTCGCAGATCAAGTT
TCAAGTGGTTTAAACGCTGCTCAATCGGCAATGGGTAACCTCACTTCCACCGACAACGCTGATGATGGTAAACTC
AAAAAGGCCCAATCACATTTGGAATCTGCTATGGCTGCGGGTCAAGATGTTATTGCGAAATGTGGAGGTGGAAAT
GGCAATAACGATGGGGCTGCTAATGGCGCTGATAACGGTGCTGCGGGAGGCAACGGCACGGTCATTGACGAAGGT
GGAGCTGCTGCGGGTGACGATGCCGGTGCTGACGATGCAAATGCCGATGATGCTGGCGCTGATGATGCTGGTGTT
GATGATGCTGGTGCTATGGGCGGCGATGCTGGTGCTATGGATGAAGCCGGTGCTATGGGTGAGGAAGCCGGTGCT
ATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAGGCCGGCGTTATGGATGGTGAA
GCCGGTGCCATGGACAACAACACAGCAGACGGCGAAATCGACAACGGCAGTGGATCTGCTGCAGGTAACGCCAAC
AACAACACCATCGGCGGTGAAGACAATATCGGCTCAGACAACAACAACGCTACCGAGACTGATGCCGCCGCTTCA
GCTACTGCCACTGCTGTCTACGACAATGGATCCAATGCCACTTTAACAACATCAGCAGTCGTTTCAGATGCAACT
GCGGCAGCTGATAATTCGTCTGAAGTGGGTATGGATGGGATGGACGGTGCTGGTGAAGCCAACGGAGCTGATGAA
AATGCTGGAGCTGACGGCCAGGACAATGGCAATGGCAACAATGGTGGAAAGCATGGTAATGGTGAAGGCAATGGC
AACGGCAATGGCAAAGGCAAAGGCAATGGTGCTGCGAACGGGGCTGGTAAGGGCGATAAAAATGACGGCGGTATG
GGCGGTATGGATAACGCATCGGCCGGAAAAGGGAACGCAGAAGTTAATGCTGGCCAAGGCGGAATGCCTGGTAAC
AGTGGTAACACTCCCGCTGCCGAAGCTGGTGCTGGCCAAGCTGGAGCTCACGGTAAAGGCAAAGGCAATGCTGCT
GAGAATGGCGAGTCTGAGAATATGGATGCGGGTTCAATGGCCGATGGAGCTGTTGAAGGCGATAATGCAGCTTCT
GGCAACAAAGATCAAAAAGCACCGTCATCTGGGAACATGGGCGCTGCTCCAGTTCGTCGGAGATTCCGCTTTGCT
CGATTTTAA
Transcript >AgabiH97|000920
ATGGCTCGTATTTTTGGCTTGTTACTTCTTGTCGCCTATATCTCAACCTACGTCGCTGCTTTCCCTATCGAACCT
CGTACAGGAAATAACTCTTGTAAAGCCGCTCTTCGTCAGACCGCTAAAAGTCTTCGTCAATCTTCCAAGGCCATC
AAGAAATTAGCATCCTCAAATGACAATAATGTGGCCGATGCTGCTATGATTGCACAAGGAGGATTAAACAATGCT
ACAGCCGGAATGATGATGATGGCTAGTGCTATGAAAGACGGACAAGACGCTCCCGCCGAAGTCGCAGATCAAGTT
TCAAGTGGTTTAAACGCTGCTCAATCGGCAATGGGTAACCTCACTTCCACCGACAACGCTGATGATGGTAAACTC
AAAAAGGCCCAATCACATTTGGAATCTGCTATGGCTGCGGGTCAAGATGTTATTGCGAAATGTGGAGGTGGAAAT
GGCAATAACGATGGGGCTGCTAATGGCGCTGATAACGGTGCTGCGGGAGGCAACGGCACGGTCATTGACGAAGGT
GGAGCTGCTGCGGGTGACGATGCCGGTGCTGACGATGCAAATGCCGATGATGCTGGCGCTGATGATGCTGGTGTT
GATGATGCTGGTGCTATGGGCGGCGATGCTGGTGCTATGGATGAAGCCGGTGCTATGGGTGAGGAAGCCGGTGCT
ATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAGGCCGGCGTTATGGATGGTGAA
GCCGGTGCCATGGACAACAACACAGCAGACGGCGAAATCGACAACGGCAGTGGATCTGCTGCAGGTAACGCCAAC
AACAACACCATCGGCGGTGAAGACAATATCGGCTCAGACAACAACAACGCTACCGAGACTGATGCCGCCGCTTCA
GCTACTGCCACTGCTGTCTACGACAATGGATCCAATGCCACTTTAACAACATCAGCAGTCGTTTCAGATGCAACT
GCGGCAGCTGATAATTCGTCTGAAGTGGGTATGGATGGGATGGACGGTGCTGGTGAAGCCAACGGAGCTGATGAA
AATGCTGGAGCTGACGGCCAGGACAATGGCAATGGCAACAATGGTGGAAAGCATGGTAATGGTGAAGGCAATGGC
AACGGCAATGGCAAAGGCAAAGGCAATGGTGCTGCGAACGGGGCTGGTAAGGGCGATAAAAATGACGGCGGTATG
GGCGGTATGGATAACGCATCGGCCGGAAAAGGGAACGCAGAAGTTAATGCTGGCCAAGGCGGAATGCCTGGTAAC
AGTGGTAACACTCCCGCTGCCGAAGCTGGTGCTGGCCAAGCTGGAGCTCACGGTAAAGGCAAAGGCAATGCTGCT
GAGAATGGCGAGTCTGAGAATATGGATGCGGGTTCAATGGCCGATGGAGCTGTTGAAGGCGATAATGCAGCTTCT
GGCAACAAAGATCAAAAAGCACCGTCATCTGGGAACATGGGCGCTGCTCCAGTTCGTCGGAGATTCCGCTTTGCT
CGATTTTAA
Gene >AgabiH97|000920
ATGGCTCGTATTTTTGGCTTGTTACTTCTTGTCGCCTATATCTCAACCTACGTCGCTGCTTGTAAGTTCATATTT
TTTCAACATAAGACGTATAAGTTACTGACCATTATATTGTGAAAAATAGTCCCTATCGAACCTCGTACAGGAAAT
AACTCTTGTAAAGCCGCTCTTCGTCAGACCGCTAAAAGTCTTCGTCAATCTTCCAAGGCCATCAAGAAATTAGCA
TCCTCAAAGTAAGTATCAAATCCTTCCCGGGAAAGGAAACGATCCATTCATTTCCAAGAAATTTTTTTTAGTGAC
AATAATGTGGCCGATGCTGCTATGATTGCACAAGGAGGATTAAACAATGCTACAGCCGGAATGATGATGATGGCT
AGTGCTATGAAAGACGGACAAGACGCTCCCGCCGAAGTCGCAGATCAAGTTTCAAGTGGTTTAAACGCTGCTCAA
TCGGCAATGGGTAACCTCACTTCGTAAGTCCGCAAAGGGTAAAATAAAATAAAAATAAGACTTTTAACACGCATT
GTAGCACCGACAACGCTGATGATGGTAAACTCAAAAAGGCCCAATCACATTTGGAATCTGCTATGGCTGCGGGTC
AAGATGTTATTGCGAAATGTGGAGGTGGAAATGGCAATAACGATGGGGCTGCTAATGGCGCTGATAACGGTGCTG
CGGGAGGCAACGGCACGGTCATTGACGAAGGTGGAGCTGCTGCGGGTGACGATGCCGGTGCTGACGATGCAAATG
CCGATGATGCTGGCGCTGATGATGCTGGTGTTGATGATGCTGGTGCTATGGGCGGCGATGCTGGTGCTATGGATG
AAGCCGGTGCTATGGGTGAGGAAGCCGGTGCTATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTA
TGGGTGGTGAGGCCGGCGTTATGGATGGTGAAGCCGGTGCCATGGACAACAACACAGCAGACGGCGAAATCGACA
ACGGCAGTGGATCTGCTGCAGGTAACGCCAACAACAACACCATCGGCGGTGAAGACAATATCGGCTCAGACAACA
ACAACGCTACCGAGACTGATGCCGCCGCTTCAGCTACTGCCACTGCTGTCTACGACAATGGATCCAATGCCACTT
TAACAACATCAGCAGTCGTTTCAGATGCAACTGCGGCAGCTGATAATTCGTCTGAAGTGGGTATGGATGGGATGG
ACGGTGCTGGTGAAGCCAACGGAGCTGATGAAAATGCTGGAGCTGACGGCCAGGACAATGGCAATGGCAACAATG
GTGGAAAGCATGGTAATGGTGAAGGCAATGGCAACGGCAATGGCAAAGGCAAAGGCAATGGTGCTGCGAACGGGG
CTGGTAAGGGCGATAAAAATGACGGCGGTATGGGCGGTATGGATAACGCATCGGCCGGAAAAGGGAACGCAGAAG
TGTAAGTCAAGGCCTTCATTTTTGATTAGAAATTCACTCATACCTCATTACAGTAATGCTGGCCAAGGCGGAATG
CCTGGTAACAGTGGTAACACTCCCGCTGCCGAAGCGTAAGTTAAAACTTCCAACCATTATTGATTATTTAACTCA
TATTGAACTAACTTAGTGGTGCTGGCCAAGCTGGAGCTCACGGTAAAGGCAAAGGCAATGCTGCTGAGAATGGCG
AGTCTGAGAATATGGATGCGTAAGTTTTAGGTCTTCATGATCAAATAAATTGTTGACCTTATTCTTGAAACTAAA
AAATCAGGGGTTCAATGGCCGATGGAGCTGTTGAAGGCGATAATGCAGCTTCTGGCAACAAAGATCAAAAAGCAC
CGTCATCTGGGAACATGGGCGCGTAAGTTATTCTCATATCTTCAATGCTTAATGGACTGTCATTTGCTCATGTCA
AAATTTTAGTGCTCCAGTTCGTCGGAGATTCCGCTTTGCTCGATTTTAA

© 2022 - Robin Ohm - Utrecht University - The Netherlands

Built with Python Django and Wagtail