Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein IDAgabi119p4|675050
Gene name
Locationscaffold_07:227584..229999
Strand+
Gene length (bp)2415
Transcript length (bp)2322
Coding sequence length (bp)2322
Protein length (aa) 774

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PFAM Domains

(None)

Swissprot hits

Swissprot ID Swissprot Description Start End E-value
sp|P32334|MSB2_YEAST Signaling mucin MSB2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) GN=MSB2 PE=1 SV=1 507 607 6.0E-07

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]
SignalP signal predicted Location
(based on Ymax)
D score
(significance: > 0.45)
Yes 1 - 22 0.45

Transmembrane Domains

Domain # Start End Length
1 661 683 22

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

No expression data available for this genome

Sequences

Type of sequenceSequence
Locus Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein >Agabi119p4|675050
MRLLFLFYAVLPIYAARRSHSTRLTRRQGLLGILGPDTPPTTSILDPVTVFPSSSSSIPTPTPDGGLLGDLTSAA
GGLVSNVGGVVSTVGSDLGGAVSTVGSDLGGIIGGSPSSTPTASPPTNTSNPPSSDGGLLGGLTSVVGGVLDPPS
PSTTAPPPSDTPPAPTPTSSSDGGLLGGLTSVVGGVLDPPSPSTTAPPPSDTPPTPTSSSDGGLLGGVTSVVGGV
ISDVGGAVSTIGSDVGGVLNPPSPSTTPPAPPSSPSQTQPPTPTSSSDGGLLGGVTSIVGGLTSDVGGIISTVTS
GLGGVVGTPTSAPVNTTPISNPGSSSGGIIDTLTSGIGGVITTVTSDLGGVIPTSISSVDPNPPVTDGPSGNATS
TTTSGAVEPTSPNITSSAQPTISFPTQTTNVSTSSTTLSTTQTSTEIMTTVTTTTSTTLSVASDLSFVLEESTLA
FASLPTTTPSVTFTDPDQATPAAPQPVTTLVAPPLPSGIPGWIYPRQRLNSSNSDLEGFTLISILFNKELNWMFE
IQDPISASQIFVYMPMLISTALRIPSDQVKTFALRVYIPDTYHSPNDAAQLGTLYLGYIPSDLIDPLSAQIKVKS
SAFYTQGPDDNSRALAQRVVPSYSLLSVSPNDDPGSGGPSDDSGNNNGSSDSGKAREEAIIGVVSALGSIALLVL
GFLVYRSYKRRQQLAHRRLSDPPGENLGVRPQGREFDQDSVGGARRRSFYYAEDSLRGYESQPAPNDQLMAESSM
SQRRNVVPGSISAPVLRGSTMNW*
Coding >Agabi119p4|675050
ATGCGTCTCCTTTTTCTCTTCTACGCCGTCCTCCCTATTTATGCGGCCCGCCGCTCCCACTCCACCCGCCTCACC
CGTCGCCAGGGCCTTCTTGGCATCCTCGGCCCAGACACACCACCCACCACCAGCATTCTCGATCCAGTCACCGTC
TTTCCTTCTTCATCGTCGTCTATTCCTACCCCCACCCCCGATGGCGGTCTCCTCGGCGATCTCACTAGTGCCGCT
GGCGGTCTCGTCAGCAACGTCGGTGGTGTAGTCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGAGGCGCCGTCAGTACAGTC
GGTAGCGACCTCGGTGGCATTATCGGCGGTTCCCCCTCCAGCACTCCCACGGCCAGTCCTCCCACCAATACCAGC
AATCCTCCGAGTTCTGACGGTGGTCTTCTCGGCGGTCTTACTAGTGTCGTGGGTGGTGTCCTTGATCCTCCTAGT
CCTTCTACTACTGCACCACCCCCTTCCGACACGCCCCCTGCGCCTACACCTACGTCCAGCTCTGACGGTGGTCTT
CTCGGCGGTCTCACCAGCGTCGTGGGTGGTGTTCTTGATCCTCCTAGTCCTTCCACTACTGCACCACCACCTTCC
GATACGCCCCCTACGCCTACGTCTAGCTCTGACGGTGGTCTTCTTGGCGGTGTCACTAGCGTCGTTGGTGGAGTC
ATCAGCGATGTCGGTGGCGCTGTGAGTACCATTGGTAGCGATGTCGGTGGTGTCCTCAATCCTCCTAGTCCTTCC
ACCACTCCACCAGCCCCTCCTTCCAGTCCTTCACAGACTCAGCCCCCTACGCCCACGTCCAGCTCTGACGGCGGT
CTTCTCGGCGGTGTCACAAGTATTGTTGGTGGACTCACGAGTGATGTCGGTGGCATAATCAGTACCGTCACTAGC
GGTCTTGGAGGTGTTGTTGGCACTCCGACCAGCGCTCCCGTCAATACTACCCCAATCAGTAATCCTGGTTCTTCC
TCTGGTGGTATCATCGATACCTTGACCAGCGGCATTGGTGGTGTTATCACCACAGTAACTAGCGATCTCGGTGGT
GTCATCCCCACCTCAATCAGCAGTGTGGACCCGAACCCTCCCGTTACTGATGGTCCAAGTGGGAATGCCACCAGT
ACAACAACCTCAGGTGCTGTCGAACCCACATCCCCGAACATTACCAGCTCTGCACAACCGACGATCAGCTTCCCC
ACACAGACGACCAATGTCTCAACCTCCTCTACCACCCTTTCTACGACTCAAACGTCGACGGAAATCATGACTACC
GTGACTACAACCACGTCCACCACCTTGTCCGTCGCGTCTGATCTCTCCTTTGTCCTTGAAGAGTCTACCCTCGCG
TTTGCCTCGCTTCCCACCACCACTCCCTCTGTCACTTTCACAGACCCAGATCAAGCAACGCCGGCCGCTCCCCAA
CCTGTTACCACTCTTGTCGCTCCCCCCCTTCCCTCCGGTATCCCTGGTTGGATATACCCTCGCCAACGGCTGAAT
TCAAGCAACAGTGACCTCGAGGGATTTACCTTGATCAGTATTCTCTTCAACAAGGAACTCAATTGGATGTTTGAA
ATTCAGGATCCCATCTCGGCCAGTCAAATTTTTGTTTACATGCCCATGTTGATCAGCACCGCGCTACGCATCCCA
TCTGATCAAGTCAAGACCTTTGCTTTGCGAGTCTATATTCCAGATACCTACCATAGTCCCAATGATGCCGCTCAG
CTTGGAACCCTTTATCTCGGCTACATACCCAGTGATTTAATTGATCCCCTCTCTGCTCAAATCAAAGTCAAGTCG
TCAGCTTTCTACACCCAAGGTCCCGACGACAATTCTCGAGCCCTTGCTCAGCGTGTCGTTCCCTCTTATTCACTG
CTTTCCGTCTCACCCAATGACGATCCCGGATCCGGCGGTCCGTCCGATGATTCCGGCAACAATAACGGCTCATCC
GACAGTGGCAAGGCCCGCGAGGAGGCCATTATTGGTGTCGTCAGTGCCCTCGGTTCTATCGCCCTTCTGGTGCTC
GGTTTCCTCGTCTATCGGTCGTATAAACGCCGTCAACAACTCGCTCACCGCCGTCTGTCTGATCCTCCCGGCGAG
AATCTTGGTGTACGCCCTCAGGGACGCGAATTTGACCAGGATAGTGTCGGCGGTGCGAGAAGGAGAAGTTTCTAT
TACGCGGAAGACTCTTTGCGTGGATATGAATCCCAGCCGGCTCCGAATGACCAGCTCATGGCTGAGAGTAGCATG
AGTCAGAGGAGGAATGTCGTTCCAGGCTCGATCTCCGCTCCCGTTTTAAGGGGCAGTACGATGAATTGGTAG
Transcript >Agabi119p4|675050
ATGCGTCTCCTTTTTCTCTTCTACGCCGTCCTCCCTATTTATGCGGCCCGCCGCTCCCACTCCACCCGCCTCACC
CGTCGCCAGGGCCTTCTTGGCATCCTCGGCCCAGACACACCACCCACCACCAGCATTCTCGATCCAGTCACCGTC
TTTCCTTCTTCATCGTCGTCTATTCCTACCCCCACCCCCGATGGCGGTCTCCTCGGCGATCTCACTAGTGCCGCT
GGCGGTCTCGTCAGCAACGTCGGTGGTGTAGTCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGAGGCGCCGTCAGTACAGTC
GGTAGCGACCTCGGTGGCATTATCGGCGGTTCCCCCTCCAGCACTCCCACGGCCAGTCCTCCCACCAATACCAGC
AATCCTCCGAGTTCTGACGGTGGTCTTCTCGGCGGTCTTACTAGTGTCGTGGGTGGTGTCCTTGATCCTCCTAGT
CCTTCTACTACTGCACCACCCCCTTCCGACACGCCCCCTGCGCCTACACCTACGTCCAGCTCTGACGGTGGTCTT
CTCGGCGGTCTCACCAGCGTCGTGGGTGGTGTTCTTGATCCTCCTAGTCCTTCCACTACTGCACCACCACCTTCC
GATACGCCCCCTACGCCTACGTCTAGCTCTGACGGTGGTCTTCTTGGCGGTGTCACTAGCGTCGTTGGTGGAGTC
ATCAGCGATGTCGGTGGCGCTGTGAGTACCATTGGTAGCGATGTCGGTGGTGTCCTCAATCCTCCTAGTCCTTCC
ACCACTCCACCAGCCCCTCCTTCCAGTCCTTCACAGACTCAGCCCCCTACGCCCACGTCCAGCTCTGACGGCGGT
CTTCTCGGCGGTGTCACAAGTATTGTTGGTGGACTCACGAGTGATGTCGGTGGCATAATCAGTACCGTCACTAGC
GGTCTTGGAGGTGTTGTTGGCACTCCGACCAGCGCTCCCGTCAATACTACCCCAATCAGTAATCCTGGTTCTTCC
TCTGGTGGTATCATCGATACCTTGACCAGCGGCATTGGTGGTGTTATCACCACAGTAACTAGCGATCTCGGTGGT
GTCATCCCCACCTCAATCAGCAGTGTGGACCCGAACCCTCCCGTTACTGATGGTCCAAGTGGGAATGCCACCAGT
ACAACAACCTCAGGTGCTGTCGAACCCACATCCCCGAACATTACCAGCTCTGCACAACCGACGATCAGCTTCCCC
ACACAGACGACCAATGTCTCAACCTCCTCTACCACCCTTTCTACGACTCAAACGTCGACGGAAATCATGACTACC
GTGACTACAACCACGTCCACCACCTTGTCCGTCGCGTCTGATCTCTCCTTTGTCCTTGAAGAGTCTACCCTCGCG
TTTGCCTCGCTTCCCACCACCACTCCCTCTGTCACTTTCACAGACCCAGATCAAGCAACGCCGGCCGCTCCCCAA
CCTGTTACCACTCTTGTCGCTCCCCCCCTTCCCTCCGGTATCCCTGGTTGGATATACCCTCGCCAACGGCTGAAT
TCAAGCAACAGTGACCTCGAGGGATTTACCTTGATCAGTATTCTCTTCAACAAGGAACTCAATTGGATGTTTGAA
ATTCAGGATCCCATCTCGGCCAGTCAAATTTTTGTTTACATGCCCATGTTGATCAGCACCGCGCTACGCATCCCA
TCTGATCAAGTCAAGACCTTTGCTTTGCGAGTCTATATTCCAGATACCTACCATAGTCCCAATGATGCCGCTCAG
CTTGGAACCCTTTATCTCGGCTACATACCCAGTGATTTAATTGATCCCCTCTCTGCTCAAATCAAAGTCAAGTCG
TCAGCTTTCTACACCCAAGGTCCCGACGACAATTCTCGAGCCCTTGCTCAGCGTGTCGTTCCCTCTTATTCACTG
CTTTCCGTCTCACCCAATGACGATCCCGGATCCGGCGGTCCGTCCGATGATTCCGGCAACAATAACGGCTCATCC
GACAGTGGCAAGGCCCGCGAGGAGGCCATTATTGGTGTCGTCAGTGCCCTCGGTTCTATCGCCCTTCTGGTGCTC
GGTTTCCTCGTCTATCGGTCGTATAAACGCCGTCAACAACTCGCTCACCGCCGTCTGTCTGATCCTCCCGGCGAG
AATCTTGGTGTACGCCCTCAGGGACGCGAATTTGACCAGGATAGTGTCGGCGGTGCGAGAAGGAGAAGTTTCTAT
TACGCGGAAGACTCTTTGCGTGGATATGAATCCCAGCCGGCTCCGAATGACCAGCTCATGGCTGAGAGTAGCATG
AGTCAGAGGAGGAATGTCGTTCCAGGCTCGATCTCCGCTCCCGTTTTAAGGGGCAGTACGATGAATTGGTAG
Gene >Agabi119p4|675050
ATGCGTCTCCTTTTTCTCTTCTACGCCGTCCTCCCTATTTATGCGGCCCGCCGCTCCCACTCCACCCGCCTCACC
CGTCGCCAGGGCCTTCTTGGCATCCTCGGTCTGTTCTTTCTTTTCTCGTTTTGTCGTTGCTCATGTGTACAGGCC
CAGACACACCACCCACCACCAGCATTCTCGATCCAGTCACCGTCTTTCCTTCTTCATCGTCGTCTATTCCTACCC
CCACCCCCGATGGCGGTCTCCTCGGCGATCTCACTAGTGCCGCTGGCGGTCTCGTCAGCAACGTCGGTGGTGTAG
TCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGAGGCGCCGTCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGTGGCATTATCGGCGGTT
CCCCCTCCAGCACTCCCACGGCCAGTCCTCCCACCAATACCAGCAATCCTCCGAGTTCTGACGGTGGTCTTCTCG
GCGGTCTTACTAGTGTCGTGGGTGGTGTCCTTGATCCTCCTAGTCCTTCTACTACTGCACCACCCCCTTCCGACA
CGCCCCCTGCGCCTACACCTACGTCCAGCTCTGACGGTGGTCTTCTCGGCGGTCTCACCAGCGTCGTGGGTGGTG
TTCTTGATCCTCCTAGTCCTTCCACTACTGCACCACCACCTTCCGATACGCCCCCTACGCCTACGTCTAGCTCTG
ACGGTGGTCTTCTTGGCGGTGTCACTAGCGTCGTTGGTGGAGTCATCAGCGATGTCGGTGGCGCTGTGAGTACCA
TTGGTAGCGATGTCGGTGGTGTCCTCAATCCTCCTAGTCCTTCCACCACTCCACCAGCCCCTCCTTCCAGTCCTT
CACAGACTCAGCCCCCTACGCCCACGTCCAGCTCTGACGGCGGTCTTCTCGGCGGTGTCACAAGTATTGTTGGTG
GACTCACGAGTGATGTCGGTGGCATAATCAGTACCGTCACTAGCGGTCTTGGAGGTGTTGTTGGCACTCCGACCA
GCGCTCCCGTCAATACTACCCCAATCAGTAATCCTGGTTCTTCCTCTGGTGGTATCATCGATACCTTGACCAGCG
GCATTGGTGGTGTTATCACCACAGTAACTAGCGATCTCGGTGGTGTCATCCCCACCTCAATCAGCAGTGTGGACC
CGAACCCTCCCGTTACTGATGGTCCAAGTGGGAATGCCACCAGTACAACAACCTCAGGTGCTGTCGAACCCACAT
CCCCGAACATTACCAGCTCTGCACAACCGACGATCAGCTTCCCCACACAGACGACCAATGTCTCAACCTCCTCTA
CCACCCTTTCTACGACTCAAACGTCGACGGAAATCATGACTACCGTGACTACAACCACGTCCACCACCTTGTCCG
TCGCGTCTGATCTCTCCTTTGTCCTTGAAGAGTCTACCCTCGCGTTTGCCTCGCTTCCCACCACCACTCCCTCTG
TCACTTTCACAGACCCAGATCAAGCAACGCCGGCCGCTCCCCAACCTGTTACCACTCTTGTCGCTCCCCCCCTTC
CCTCCGGTATCCCTGGTTGGATATACCCTCGCCAACGGCTGAATTCAAGCAACAGTGACCTCGAGGGATTTACCT
TGATCAGTATTCTCTTCAACAAGGAACTCAATTGGATGTTTGAAATTCAGGATCCCATCTCGGCCAGTCAAATTT
TTGTTTACATGCCCATGTTGATCAGCACCGCGCTACGCATCCCATGTGAGCCCCTCTTGTGTTGTCGTTGCTTTC
AATGCTCATCTATTTTTAGCTGATCAAGTCAAGACCTTTGCTTTGCGAGTCTATATTCCAGATACCTACCATAGT
CCCAATGATGCCGCTCAGCTTGGAACCCTTTATCTCGGCTACATACCCAGTGATTTAATTGATCCCCTCTCTGCT
CAAATCAAAGTCAAGTCGTCAGCTTTCTACACCCAAGGTCCCGACGACAATTCTCGAGCCCTTGCTCAGCGTGTC
GTTCCCTCTTATTCACTGCTTTCCGTCTCACCCAATGACGATCCCGGATCCGGCGGTCCGTCCGATGATTCCGGC
AACAATAACGGCTCATCCGACAGTGGCAAGGCCCGCGAGGAGGCCATTATTGGTGTCGTCAGTGCCCTCGGTTCT
ATCGCCCTTCTGGTGCTCGGTTTCCTCGTCTATCGGTCGTATAAACGCCGTCAACAACTCGCTCACCGCCGTCTG
TCTGATCCTCCCGGCGAGAATCTTGGTGTACGCCCTCAGGGACGCGAATTTGACCAGGATAGTGTCGGCGGTGCG
AGAAGGAGAAGTTTCTATTACGCGGAAGACTCTTTGCGTGGATATGAATCCCAGCCGGCTCCGAATGACCAGCTC
ATGGCTGAGAGTAGCATGAGTCAGAGGAGGAATGTCGTTCCAGGCTCGATCTCCGCTCCCGTTTTAAGGGGCAGT
ACGATGAATTGGTAG

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