Protein ID | Agabi119p4|675050 |
Gene name | |
Location | scaffold_07:227584..229999 |
Strand | + |
Gene length (bp) | 2415 |
Transcript length (bp) | 2322 |
Coding sequence length (bp) | 2322 |
Protein length (aa) | 774 |
Swissprot ID | Swissprot Description | Start | End | E-value |
---|---|---|---|---|
sp|P32334|MSB2_YEAST | Signaling mucin MSB2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) GN=MSB2 PE=1 SV=1 | 507 | 607 | 6.0E-07 |
SignalP signal predicted | Location (based on Ymax) |
D score (significance: > 0.45) |
---|---|---|
Yes | 1 - 22 | 0.45 |
Domain # | Start | End | Length |
---|---|---|---|
1 | 661 | 683 | 22 |
Type of sequence | Sequence |
---|---|
Locus | Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded. |
Protein | >Agabi119p4|675050 MRLLFLFYAVLPIYAARRSHSTRLTRRQGLLGILGPDTPPTTSILDPVTVFPSSSSSIPTPTPDGGLLGDLTSAA GGLVSNVGGVVSTVGSDLGGAVSTVGSDLGGIIGGSPSSTPTASPPTNTSNPPSSDGGLLGGLTSVVGGVLDPPS PSTTAPPPSDTPPAPTPTSSSDGGLLGGLTSVVGGVLDPPSPSTTAPPPSDTPPTPTSSSDGGLLGGVTSVVGGV ISDVGGAVSTIGSDVGGVLNPPSPSTTPPAPPSSPSQTQPPTPTSSSDGGLLGGVTSIVGGLTSDVGGIISTVTS GLGGVVGTPTSAPVNTTPISNPGSSSGGIIDTLTSGIGGVITTVTSDLGGVIPTSISSVDPNPPVTDGPSGNATS TTTSGAVEPTSPNITSSAQPTISFPTQTTNVSTSSTTLSTTQTSTEIMTTVTTTTSTTLSVASDLSFVLEESTLA FASLPTTTPSVTFTDPDQATPAAPQPVTTLVAPPLPSGIPGWIYPRQRLNSSNSDLEGFTLISILFNKELNWMFE IQDPISASQIFVYMPMLISTALRIPSDQVKTFALRVYIPDTYHSPNDAAQLGTLYLGYIPSDLIDPLSAQIKVKS SAFYTQGPDDNSRALAQRVVPSYSLLSVSPNDDPGSGGPSDDSGNNNGSSDSGKAREEAIIGVVSALGSIALLVL GFLVYRSYKRRQQLAHRRLSDPPGENLGVRPQGREFDQDSVGGARRRSFYYAEDSLRGYESQPAPNDQLMAESSM SQRRNVVPGSISAPVLRGSTMNW* |
Coding | >Agabi119p4|675050 ATGCGTCTCCTTTTTCTCTTCTACGCCGTCCTCCCTATTTATGCGGCCCGCCGCTCCCACTCCACCCGCCTCACC CGTCGCCAGGGCCTTCTTGGCATCCTCGGCCCAGACACACCACCCACCACCAGCATTCTCGATCCAGTCACCGTC TTTCCTTCTTCATCGTCGTCTATTCCTACCCCCACCCCCGATGGCGGTCTCCTCGGCGATCTCACTAGTGCCGCT GGCGGTCTCGTCAGCAACGTCGGTGGTGTAGTCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGAGGCGCCGTCAGTACAGTC GGTAGCGACCTCGGTGGCATTATCGGCGGTTCCCCCTCCAGCACTCCCACGGCCAGTCCTCCCACCAATACCAGC AATCCTCCGAGTTCTGACGGTGGTCTTCTCGGCGGTCTTACTAGTGTCGTGGGTGGTGTCCTTGATCCTCCTAGT CCTTCTACTACTGCACCACCCCCTTCCGACACGCCCCCTGCGCCTACACCTACGTCCAGCTCTGACGGTGGTCTT CTCGGCGGTCTCACCAGCGTCGTGGGTGGTGTTCTTGATCCTCCTAGTCCTTCCACTACTGCACCACCACCTTCC GATACGCCCCCTACGCCTACGTCTAGCTCTGACGGTGGTCTTCTTGGCGGTGTCACTAGCGTCGTTGGTGGAGTC ATCAGCGATGTCGGTGGCGCTGTGAGTACCATTGGTAGCGATGTCGGTGGTGTCCTCAATCCTCCTAGTCCTTCC ACCACTCCACCAGCCCCTCCTTCCAGTCCTTCACAGACTCAGCCCCCTACGCCCACGTCCAGCTCTGACGGCGGT CTTCTCGGCGGTGTCACAAGTATTGTTGGTGGACTCACGAGTGATGTCGGTGGCATAATCAGTACCGTCACTAGC GGTCTTGGAGGTGTTGTTGGCACTCCGACCAGCGCTCCCGTCAATACTACCCCAATCAGTAATCCTGGTTCTTCC TCTGGTGGTATCATCGATACCTTGACCAGCGGCATTGGTGGTGTTATCACCACAGTAACTAGCGATCTCGGTGGT GTCATCCCCACCTCAATCAGCAGTGTGGACCCGAACCCTCCCGTTACTGATGGTCCAAGTGGGAATGCCACCAGT ACAACAACCTCAGGTGCTGTCGAACCCACATCCCCGAACATTACCAGCTCTGCACAACCGACGATCAGCTTCCCC ACACAGACGACCAATGTCTCAACCTCCTCTACCACCCTTTCTACGACTCAAACGTCGACGGAAATCATGACTACC GTGACTACAACCACGTCCACCACCTTGTCCGTCGCGTCTGATCTCTCCTTTGTCCTTGAAGAGTCTACCCTCGCG TTTGCCTCGCTTCCCACCACCACTCCCTCTGTCACTTTCACAGACCCAGATCAAGCAACGCCGGCCGCTCCCCAA CCTGTTACCACTCTTGTCGCTCCCCCCCTTCCCTCCGGTATCCCTGGTTGGATATACCCTCGCCAACGGCTGAAT TCAAGCAACAGTGACCTCGAGGGATTTACCTTGATCAGTATTCTCTTCAACAAGGAACTCAATTGGATGTTTGAA ATTCAGGATCCCATCTCGGCCAGTCAAATTTTTGTTTACATGCCCATGTTGATCAGCACCGCGCTACGCATCCCA TCTGATCAAGTCAAGACCTTTGCTTTGCGAGTCTATATTCCAGATACCTACCATAGTCCCAATGATGCCGCTCAG CTTGGAACCCTTTATCTCGGCTACATACCCAGTGATTTAATTGATCCCCTCTCTGCTCAAATCAAAGTCAAGTCG TCAGCTTTCTACACCCAAGGTCCCGACGACAATTCTCGAGCCCTTGCTCAGCGTGTCGTTCCCTCTTATTCACTG CTTTCCGTCTCACCCAATGACGATCCCGGATCCGGCGGTCCGTCCGATGATTCCGGCAACAATAACGGCTCATCC GACAGTGGCAAGGCCCGCGAGGAGGCCATTATTGGTGTCGTCAGTGCCCTCGGTTCTATCGCCCTTCTGGTGCTC GGTTTCCTCGTCTATCGGTCGTATAAACGCCGTCAACAACTCGCTCACCGCCGTCTGTCTGATCCTCCCGGCGAG AATCTTGGTGTACGCCCTCAGGGACGCGAATTTGACCAGGATAGTGTCGGCGGTGCGAGAAGGAGAAGTTTCTAT TACGCGGAAGACTCTTTGCGTGGATATGAATCCCAGCCGGCTCCGAATGACCAGCTCATGGCTGAGAGTAGCATG AGTCAGAGGAGGAATGTCGTTCCAGGCTCGATCTCCGCTCCCGTTTTAAGGGGCAGTACGATGAATTGGTAG |
Transcript | >Agabi119p4|675050 ATGCGTCTCCTTTTTCTCTTCTACGCCGTCCTCCCTATTTATGCGGCCCGCCGCTCCCACTCCACCCGCCTCACC CGTCGCCAGGGCCTTCTTGGCATCCTCGGCCCAGACACACCACCCACCACCAGCATTCTCGATCCAGTCACCGTC TTTCCTTCTTCATCGTCGTCTATTCCTACCCCCACCCCCGATGGCGGTCTCCTCGGCGATCTCACTAGTGCCGCT GGCGGTCTCGTCAGCAACGTCGGTGGTGTAGTCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGAGGCGCCGTCAGTACAGTC GGTAGCGACCTCGGTGGCATTATCGGCGGTTCCCCCTCCAGCACTCCCACGGCCAGTCCTCCCACCAATACCAGC AATCCTCCGAGTTCTGACGGTGGTCTTCTCGGCGGTCTTACTAGTGTCGTGGGTGGTGTCCTTGATCCTCCTAGT CCTTCTACTACTGCACCACCCCCTTCCGACACGCCCCCTGCGCCTACACCTACGTCCAGCTCTGACGGTGGTCTT CTCGGCGGTCTCACCAGCGTCGTGGGTGGTGTTCTTGATCCTCCTAGTCCTTCCACTACTGCACCACCACCTTCC GATACGCCCCCTACGCCTACGTCTAGCTCTGACGGTGGTCTTCTTGGCGGTGTCACTAGCGTCGTTGGTGGAGTC ATCAGCGATGTCGGTGGCGCTGTGAGTACCATTGGTAGCGATGTCGGTGGTGTCCTCAATCCTCCTAGTCCTTCC ACCACTCCACCAGCCCCTCCTTCCAGTCCTTCACAGACTCAGCCCCCTACGCCCACGTCCAGCTCTGACGGCGGT CTTCTCGGCGGTGTCACAAGTATTGTTGGTGGACTCACGAGTGATGTCGGTGGCATAATCAGTACCGTCACTAGC GGTCTTGGAGGTGTTGTTGGCACTCCGACCAGCGCTCCCGTCAATACTACCCCAATCAGTAATCCTGGTTCTTCC TCTGGTGGTATCATCGATACCTTGACCAGCGGCATTGGTGGTGTTATCACCACAGTAACTAGCGATCTCGGTGGT GTCATCCCCACCTCAATCAGCAGTGTGGACCCGAACCCTCCCGTTACTGATGGTCCAAGTGGGAATGCCACCAGT ACAACAACCTCAGGTGCTGTCGAACCCACATCCCCGAACATTACCAGCTCTGCACAACCGACGATCAGCTTCCCC ACACAGACGACCAATGTCTCAACCTCCTCTACCACCCTTTCTACGACTCAAACGTCGACGGAAATCATGACTACC GTGACTACAACCACGTCCACCACCTTGTCCGTCGCGTCTGATCTCTCCTTTGTCCTTGAAGAGTCTACCCTCGCG TTTGCCTCGCTTCCCACCACCACTCCCTCTGTCACTTTCACAGACCCAGATCAAGCAACGCCGGCCGCTCCCCAA CCTGTTACCACTCTTGTCGCTCCCCCCCTTCCCTCCGGTATCCCTGGTTGGATATACCCTCGCCAACGGCTGAAT TCAAGCAACAGTGACCTCGAGGGATTTACCTTGATCAGTATTCTCTTCAACAAGGAACTCAATTGGATGTTTGAA ATTCAGGATCCCATCTCGGCCAGTCAAATTTTTGTTTACATGCCCATGTTGATCAGCACCGCGCTACGCATCCCA TCTGATCAAGTCAAGACCTTTGCTTTGCGAGTCTATATTCCAGATACCTACCATAGTCCCAATGATGCCGCTCAG CTTGGAACCCTTTATCTCGGCTACATACCCAGTGATTTAATTGATCCCCTCTCTGCTCAAATCAAAGTCAAGTCG TCAGCTTTCTACACCCAAGGTCCCGACGACAATTCTCGAGCCCTTGCTCAGCGTGTCGTTCCCTCTTATTCACTG CTTTCCGTCTCACCCAATGACGATCCCGGATCCGGCGGTCCGTCCGATGATTCCGGCAACAATAACGGCTCATCC GACAGTGGCAAGGCCCGCGAGGAGGCCATTATTGGTGTCGTCAGTGCCCTCGGTTCTATCGCCCTTCTGGTGCTC GGTTTCCTCGTCTATCGGTCGTATAAACGCCGTCAACAACTCGCTCACCGCCGTCTGTCTGATCCTCCCGGCGAG AATCTTGGTGTACGCCCTCAGGGACGCGAATTTGACCAGGATAGTGTCGGCGGTGCGAGAAGGAGAAGTTTCTAT TACGCGGAAGACTCTTTGCGTGGATATGAATCCCAGCCGGCTCCGAATGACCAGCTCATGGCTGAGAGTAGCATG AGTCAGAGGAGGAATGTCGTTCCAGGCTCGATCTCCGCTCCCGTTTTAAGGGGCAGTACGATGAATTGGTAG |
Gene | >Agabi119p4|675050 ATGCGTCTCCTTTTTCTCTTCTACGCCGTCCTCCCTATTTATGCGGCCCGCCGCTCCCACTCCACCCGCCTCACC CGTCGCCAGGGCCTTCTTGGCATCCTCGGTCTGTTCTTTCTTTTCTCGTTTTGTCGTTGCTCATGTGTACAGGCC CAGACACACCACCCACCACCAGCATTCTCGATCCAGTCACCGTCTTTCCTTCTTCATCGTCGTCTATTCCTACCC CCACCCCCGATGGCGGTCTCCTCGGCGATCTCACTAGTGCCGCTGGCGGTCTCGTCAGCAACGTCGGTGGTGTAG TCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGAGGCGCCGTCAGTACAGTCGGTAGCGACCTCGGTGGCATTATCGGCGGTT CCCCCTCCAGCACTCCCACGGCCAGTCCTCCCACCAATACCAGCAATCCTCCGAGTTCTGACGGTGGTCTTCTCG GCGGTCTTACTAGTGTCGTGGGTGGTGTCCTTGATCCTCCTAGTCCTTCTACTACTGCACCACCCCCTTCCGACA CGCCCCCTGCGCCTACACCTACGTCCAGCTCTGACGGTGGTCTTCTCGGCGGTCTCACCAGCGTCGTGGGTGGTG TTCTTGATCCTCCTAGTCCTTCCACTACTGCACCACCACCTTCCGATACGCCCCCTACGCCTACGTCTAGCTCTG ACGGTGGTCTTCTTGGCGGTGTCACTAGCGTCGTTGGTGGAGTCATCAGCGATGTCGGTGGCGCTGTGAGTACCA TTGGTAGCGATGTCGGTGGTGTCCTCAATCCTCCTAGTCCTTCCACCACTCCACCAGCCCCTCCTTCCAGTCCTT CACAGACTCAGCCCCCTACGCCCACGTCCAGCTCTGACGGCGGTCTTCTCGGCGGTGTCACAAGTATTGTTGGTG GACTCACGAGTGATGTCGGTGGCATAATCAGTACCGTCACTAGCGGTCTTGGAGGTGTTGTTGGCACTCCGACCA GCGCTCCCGTCAATACTACCCCAATCAGTAATCCTGGTTCTTCCTCTGGTGGTATCATCGATACCTTGACCAGCG GCATTGGTGGTGTTATCACCACAGTAACTAGCGATCTCGGTGGTGTCATCCCCACCTCAATCAGCAGTGTGGACC CGAACCCTCCCGTTACTGATGGTCCAAGTGGGAATGCCACCAGTACAACAACCTCAGGTGCTGTCGAACCCACAT CCCCGAACATTACCAGCTCTGCACAACCGACGATCAGCTTCCCCACACAGACGACCAATGTCTCAACCTCCTCTA CCACCCTTTCTACGACTCAAACGTCGACGGAAATCATGACTACCGTGACTACAACCACGTCCACCACCTTGTCCG TCGCGTCTGATCTCTCCTTTGTCCTTGAAGAGTCTACCCTCGCGTTTGCCTCGCTTCCCACCACCACTCCCTCTG TCACTTTCACAGACCCAGATCAAGCAACGCCGGCCGCTCCCCAACCTGTTACCACTCTTGTCGCTCCCCCCCTTC CCTCCGGTATCCCTGGTTGGATATACCCTCGCCAACGGCTGAATTCAAGCAACAGTGACCTCGAGGGATTTACCT TGATCAGTATTCTCTTCAACAAGGAACTCAATTGGATGTTTGAAATTCAGGATCCCATCTCGGCCAGTCAAATTT TTGTTTACATGCCCATGTTGATCAGCACCGCGCTACGCATCCCATGTGAGCCCCTCTTGTGTTGTCGTTGCTTTC AATGCTCATCTATTTTTAGCTGATCAAGTCAAGACCTTTGCTTTGCGAGTCTATATTCCAGATACCTACCATAGT CCCAATGATGCCGCTCAGCTTGGAACCCTTTATCTCGGCTACATACCCAGTGATTTAATTGATCCCCTCTCTGCT CAAATCAAAGTCAAGTCGTCAGCTTTCTACACCCAAGGTCCCGACGACAATTCTCGAGCCCTTGCTCAGCGTGTC GTTCCCTCTTATTCACTGCTTTCCGTCTCACCCAATGACGATCCCGGATCCGGCGGTCCGTCCGATGATTCCGGC AACAATAACGGCTCATCCGACAGTGGCAAGGCCCGCGAGGAGGCCATTATTGGTGTCGTCAGTGCCCTCGGTTCT ATCGCCCTTCTGGTGCTCGGTTTCCTCGTCTATCGGTCGTATAAACGCCGTCAACAACTCGCTCACCGCCGTCTG TCTGATCCTCCCGGCGAGAATCTTGGTGTACGCCCTCAGGGACGCGAATTTGACCAGGATAGTGTCGGCGGTGCG AGAAGGAGAAGTTTCTATTACGCGGAAGACTCTTTGCGTGGATATGAATCCCAGCCGGCTCCGAATGACCAGCTC ATGGCTGAGAGTAGCATGAGTCAGAGGAGGAATGTCGTTCCAGGCTCGATCTCCGCTCCCGTTTTAAGGGGCAGT ACGATGAATTGGTAG |