Fungal Genomics

at Utrecht University

General Properties

Protein IDAgabi119p4|555050
Gene name
Locationscaffold_01a:216955..218893
Strand+
Gene length (bp)1938
Transcript length (bp)1521
Coding sequence length (bp)1521
Protein length (aa) 507

Your browser does not support drawing a protein figure.

PFAM Domains

(None)

Swissprot hits

(None)

GO

(None)

SignalP

[Help with interpreting these statistics]
SignalP signal predicted Location
(based on Ymax)
D score
(significance: > 0.45)
Yes 1 - 21 0.45

Transmembrane Domains

(None)

Transcription Factor Class

(None)

Expression data

No expression data available for this genome

Sequences

Type of sequenceSequence
Locus Download genbank file of locus
The gene with 5 kb flanks (if sufficient flanking sequence is available). For use in cloning design programs. NOTE: features (genes or exons) that are only partially contained within the sequence are completely excluded.
Protein >Agabi119p4|555050
MARIFGLLLLIAYVTTYVAAFPIEPRTGNNSCKAALRQTAKNLRQSSKAIKKLASSNDNNVADAAMIAQGGLNNA
TAGMMMMASAMKDGQDAPPEVADQVSSGLNAAQSAMSNLTSTDNADDGKLKKAQSHLESAMAAGQDVIAKCGGGN
GNNDGADNGADNGAAGGNGTVIDEGGAATGDDAGADDANADDAGADDAGADDAGVDDAGAMGGDAGAMDEAGAMG
GEEGAMGGEEGAMGGEEGAMGGEAGAMGGEADVMGDEAGAMGNNTADGEIDNGSGSAVGNANNNTIGGEDNIGSD
NNATETGAAASATATAVYDNGSNATLTTSAVVSDATAAADNSSEVGMDGMDGAGEANGADENAGADGQDNGNGGK
HGKGKGNGKGKGNGAANGAGKGGKNDGGMGGMDNASAGKGNAGVGAGQGGMPGNSGNTPAAEAGAGQAGAHGKGK
GNAAENGESENMDAGSMAGGAVEGDNASSGNKDQKAPSSGNMGAAPVRRRFRFARF*
Coding >Agabi119p4|555050
ATGGCTCGTATTTTTGGCTTGTTACTTCTTATAGCCTATGTCACAACCTACGTTGCTGCTTTCCCTATCGAACCT
CGTACAGGAAATAACTCTTGTAAAGCCGCTCTTCGTCAAACCGCTAAAAACCTTCGTCAATCTTCCAAGGCCATT
AAGAAATTAGCATCCTCAAATGACAATAACGTGGCCGATGCTGCTATGATTGCACAAGGAGGATTAAACAATGCT
ACAGCCGGAATGATGATGATGGCTAGTGCTATGAAAGATGGACAAGACGCTCCCCCCGAAGTCGCAGATCAAGTT
TCAAGTGGCTTAAACGCTGCGCAATCGGCAATGAGTAACCTCACTTCCACCGACAACGCTGATGATGGTAAACTC
AAAAAGGCCCAATCACATTTGGAATCTGCTATGGCTGCGGGTCAAGATGTTATTGCGAAATGTGGAGGTGGAAAT
GGCAATAACGATGGGGCTGATAATGGCGCTGATAACGGTGCTGCGGGAGGCAACGGCACGGTCATTGATGAAGGT
GGAGCTGCTACGGGTGACGATGCCGGCGCTGACGATGCAAATGCCGATGATGCTGGTGCCGACGATGCTGGCGCT
GATGATGCTGGTGTTGACGATGCTGGTGCTATGGGCGGCGATGCTGGTGCTATGGATGAAGCCGGTGCTATGGGT
GGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAAGAAGGTGCTATGGGTGGTGAAGAAGGTGCTATGGGTGGTGAAGCTGGT
GCCATGGGTGGTGAGGCCGACGTTATGGGTGATGAAGCCGGTGCCATGGGCAACAACACAGCAGACGGCGAAATC
GATAACGGCAGTGGATCTGCTGTAGGTAACGCCAACAACAACACCATCGGCGGTGAAGACAATATCGGCTCTGAC
AACAACGCTACCGAGACTGGCGCCGCCGCTTCAGCTACTGCCACTGCTGTCTACGACAATGGATCTAATGCCACT
TTAACCACATCAGCAGTCGTTTCAGATGCAACTGCGGCAGCTGATAATTCGTCTGAAGTGGGTATGGATGGGATG
GACGGTGCTGGAGAAGCCAACGGAGCTGATGAAAATGCTGGAGCTGACGGTCAGGACAACGGCAATGGTGGAAAG
CATGGCAAAGGCAAAGGCAACGGCAAAGGCAAAGGCAATGGTGCTGCGAACGGGGCTGGTAAGGGCGGTAAAAAT
GACGGCGGTATGGGTGGTATGGATAACGCATCGGCCGGAAAAGGGAACGCAGGAGTTGGTGCTGGCCAAGGCGGA
ATGCCTGGTAACAGTGGTAACACTCCCGCTGCCGAAGCTGGTGCTGGCCAAGCTGGAGCACACGGTAAAGGCAAA
GGCAATGCTGCTGAGAATGGCGAGTCTGAGAATATGGATGCGGGTTCAATGGCCGGTGGAGCTGTTGAAGGCGAT
AATGCATCTTCTGGCAACAAAGATCAAAAAGCACCGTCATCTGGGAACATGGGCGCTGCTCCAGTTCGTCGGAGA
TTCCGCTTTGCTCGATTTTAA
Transcript >Agabi119p4|555050
ATGGCTCGTATTTTTGGCTTGTTACTTCTTATAGCCTATGTCACAACCTACGTTGCTGCTTTCCCTATCGAACCT
CGTACAGGAAATAACTCTTGTAAAGCCGCTCTTCGTCAAACCGCTAAAAACCTTCGTCAATCTTCCAAGGCCATT
AAGAAATTAGCATCCTCAAATGACAATAACGTGGCCGATGCTGCTATGATTGCACAAGGAGGATTAAACAATGCT
ACAGCCGGAATGATGATGATGGCTAGTGCTATGAAAGATGGACAAGACGCTCCCCCCGAAGTCGCAGATCAAGTT
TCAAGTGGCTTAAACGCTGCGCAATCGGCAATGAGTAACCTCACTTCCACCGACAACGCTGATGATGGTAAACTC
AAAAAGGCCCAATCACATTTGGAATCTGCTATGGCTGCGGGTCAAGATGTTATTGCGAAATGTGGAGGTGGAAAT
GGCAATAACGATGGGGCTGATAATGGCGCTGATAACGGTGCTGCGGGAGGCAACGGCACGGTCATTGATGAAGGT
GGAGCTGCTACGGGTGACGATGCCGGCGCTGACGATGCAAATGCCGATGATGCTGGTGCCGACGATGCTGGCGCT
GATGATGCTGGTGTTGACGATGCTGGTGCTATGGGCGGCGATGCTGGTGCTATGGATGAAGCCGGTGCTATGGGT
GGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAAGAAGGTGCTATGGGTGGTGAAGAAGGTGCTATGGGTGGTGAAGCTGGT
GCCATGGGTGGTGAGGCCGACGTTATGGGTGATGAAGCCGGTGCCATGGGCAACAACACAGCAGACGGCGAAATC
GATAACGGCAGTGGATCTGCTGTAGGTAACGCCAACAACAACACCATCGGCGGTGAAGACAATATCGGCTCTGAC
AACAACGCTACCGAGACTGGCGCCGCCGCTTCAGCTACTGCCACTGCTGTCTACGACAATGGATCTAATGCCACT
TTAACCACATCAGCAGTCGTTTCAGATGCAACTGCGGCAGCTGATAATTCGTCTGAAGTGGGTATGGATGGGATG
GACGGTGCTGGAGAAGCCAACGGAGCTGATGAAAATGCTGGAGCTGACGGTCAGGACAACGGCAATGGTGGAAAG
CATGGCAAAGGCAAAGGCAACGGCAAAGGCAAAGGCAATGGTGCTGCGAACGGGGCTGGTAAGGGCGGTAAAAAT
GACGGCGGTATGGGTGGTATGGATAACGCATCGGCCGGAAAAGGGAACGCAGGAGTTGGTGCTGGCCAAGGCGGA
ATGCCTGGTAACAGTGGTAACACTCCCGCTGCCGAAGCTGGTGCTGGCCAAGCTGGAGCACACGGTAAAGGCAAA
GGCAATGCTGCTGAGAATGGCGAGTCTGAGAATATGGATGCGGGTTCAATGGCCGGTGGAGCTGTTGAAGGCGAT
AATGCATCTTCTGGCAACAAAGATCAAAAAGCACCGTCATCTGGGAACATGGGCGCTGCTCCAGTTCGTCGGAGA
TTCCGCTTTGCTCGATTTTAA
Gene >Agabi119p4|555050
ATGGCTCGTATTTTTGGCTTGTTACTTCTTATAGCCTATGTCACAACCTACGTTGCTGCTTGTAAGTTCATGTTT
TTTCAACATAAGACGTATAAGTTACTGACCATTCAATTGTGAAAATAGTCCCTATCGAACCTCGTACAGGAAATA
ACTCTTGTAAAGCCGCTCTTCGTCAAACCGCTAAAAACCTTCGTCAATCTTCCAAGGCCATTAAGAAATTAGCAT
CCTCAAAGTAAGTATCAATCCTTCCCGGGAAAGGAAACGATCCATTCATTTCCAAGAAATTTTTTTTAGTGACAA
TAACGTGGCCGATGCTGCTATGATTGCACAAGGAGGATTAAACAATGCTACAGCCGGAATGATGATGATGGCTAG
TGCTATGAAAGATGGACAAGACGCTCCCCCCGAAGTCGCAGATCAAGTTTCAAGTGGCTTAAACGCTGCGCAATC
GGCAATGAGTAACCTCACTTCGTAAGTCCGCAAAGGGTCAAATAAAATAAAAATAAGACTTTTAACACGCATTGT
AGCACCGACAACGCTGATGATGGTAAACTCAAAAAGGCCCAATCACATTTGGAATCTGCTATGGCTGCGGGTCAA
GATGTTATTGCGAAATGTGGAGGTGGAAATGGCAATAACGATGGGGCTGATAATGGCGCTGATAACGGTGCTGCG
GGAGGCAACGGCACGGTCATTGATGAAGGTGGAGCTGCTACGGGTGACGATGCCGGCGCTGACGATGCAAATGCC
GATGATGCTGGTGCCGACGATGCTGGCGCTGATGATGCTGGTGTTGACGATGCTGGTGCTATGGGCGGCGATGCT
GGTGCTATGGATGAAGCCGGTGCTATGGGTGGTGAAGAAGGCGCTATGGGTGGTGAAGAAGGTGCTATGGGTGGT
GAAGAAGGTGCTATGGGTGGTGAAGCTGGTGCCATGGGTGGTGAGGCCGACGTTATGGGTGATGAAGCCGGTGCC
ATGGGCAACAACACAGCAGACGGCGAAATCGATAACGGCAGTGGATCTGCTGTAGGTAACGCCAACAACAACACC
ATCGGCGGTGAAGACAATATCGGCTCTGACAACAACGCTACCGAGACTGGCGCCGCCGCTTCAGCTACTGCCACT
GCTGTCTACGACAATGGATCTAATGCCACTTTAACCACATCAGCAGTCGTTTCAGATGCAACTGCGGCAGCTGAT
AATTCGTCTGAAGTGGGTATGGATGGGATGGACGGTGCTGGAGAAGCCAACGGAGCTGATGAAAATGCTGGAGCT
GACGGTCAGGACAACGGCAATGGTGGAAAGCATGGCAAAGGCAAAGGCAACGGCAAAGGCAAAGGCAATGGTGCT
GCGAACGGGGCTGGTAAGGGCGGTAAAAATGACGGCGGTATGGGTGGTATGGATAACGCATCGGCCGGAAAAGGG
AACGCAGGAGTGTAAGTCAAGGCCTTAATTATTGATCAGAAATTCACTCATACCTTGTTGCAGTGGTGCTGGCCA
AGGCGGAATGCCTGGTAACAGTGGTAACACTCCCGCTGCCGAAGCGTAAGTTGGAGACTTCCAAACCATTGATTA
TTGATTTTTTACTCATATCTAATTAATCTTAGTGGTGCTGGCCAAGCTGGAGCACACGGTAAAGGCAAAGGCAAT
GCTGCTGAGAATGGCGAGTCTGAGAATATGGATGCGTAAGTTTAGGTCTTCATGATCAAATAAATTGTTTGACTT
ATTCTTGAACTAAAAAAATCAGGGGTTCAATGGCCGGTGGAGCTGTTGAAGGCGATAATGCATCTTCTGGCAACA
AAGATCAAAAAGCACCGTCATCTGGGAACATGGGCGCGTAAGTCATTTCATATCTTCAATGCTTAATGGACTATC
ATTTGCTCATGTCAAAATTTTAGTGCTCCAGTTCGTCGGAGATTCCGCTTTGCTCGATTTTAA

© 2022 - Robin Ohm - Utrecht University - The Netherlands

Built with Python Django and Wagtail